Agilent MassHunter Profinder Software

Význam tématu

Analýza velkých souborů hmotnostně‐spektrických dat vyžaduje spolehlivou extrakci molekulárních znaků (feature extraction), která je klíčová pro ne‐cílené i cílené studie. Správná detekce a kvantifikace složek vzorků umožňuje přesnější diferenciální analýzu, biomarker discovery či monitorování stabilních izotopů.

Cíle a přehled studie

Cílem softwaru Agilent MassHunter Profinder je zrychlit a zpřesnit extrakci molekulárních znaků pro dávky LC/MS či GC/MS dat. Profinder nabízí dva hlavní režimy:

• Neřízená (MFE): automatická detekce podle m/z, retenční doby a intenzity.
• Cílená: hledání předem definovaných sloučenin podle známých vzorců.

Přístrojový výstup lze zobrazit interaktivně a výsledky exportovat do běžných formátů pro následné zpracování.

Použitá metodika a instrumentace

Profinder využívá pokročilý algoritmus pro binning, zarovnání a rekurzivní dávkovou analýzu. Klíčové vlastnosti metodiky:

• Multithreading a optimalizace paměti pro 64bit Windows.
• Rekurzivní dávkový režim: první průchod detekuje feature, druhý provádí cílenou extrakci.
• Podpora stabilního izotopického značení (13C, 15N, 2H) pro kinetické studie.

Instrumentace:

• Agilent TOF a Q-TOF systémy s LC, GC, CE či SFC.
• Nominal-mass GC/MS.
• Formáty exportu: .CEF, .PFA, .CSV pro integraci s VistaFlux, Omix a dalšími.

Hlavní výsledky a diskuse

Implementace rekurzivního dávkového módu a multithreadingu přinesla:

• Vyšší selektivitu detekce a rychlejší zpracování rozsáhlých datasetů.
• Možnost manuální validace a reintegrace přímo v grafickém rozhraní.
• Praktické workflow řešení pro malé molekuly, intact proteiny a izotopologickou analýzu.

Uživatelé uvádějí zvýšení produktivity i přesun analýzy k biologům bez nutnosti hlubokých znalostí chemometrie.

Přínosy a praktické využití metody

Profinder je využitelný v řadě aplikací:

• Potravinářský a nápojový průmysl (detekce kontaminantů, metabolitů).
• Monitorování odpadních vod a environmentálních vzorků.
• Analýza polymerů a intact protein profiling ve výzkumu i QA/QC.
• Kinetické modelování metabolických drah pomocí stabilních izotopů.

Budoucí trendy a možnosti využití

Další směřování rozvoje zahrnuje:

• Propojení s cloudovými platformami a AI‐poháněnou anotaci feature.
• Automatizované reporty a validace výsledků.
• Rozšíření podpory nových izotopických značení a hyphenovaných technik.

Závěr

Agilent MassHunter Profinder představuje robustní řešení pro komplexní extrakci molekulárních znaků z hmotnostně‐spektrických dat. Díky rekurzivnímu dávkovému režimu, multithreadingu a bohaté vizualizaci zvyšuje kvalitu výsledků a urychluje workflow v různých aplikačních oblastech.

Reference

Agilent Technologies, Inc. (2016). Agilent MassHunter Profinder Software, Application Note 5991-6984EN, August 4, 2016.