Screening of organic acids for nutritional and metabolic profiling from dried urine spots using Gas Chromatograph Mass Spectrometer
Aplikace | 2022 | ShimadzuInstrumentace
Organické kyseliny jsou klíčovými intermediáty řady metabolických drah včetně Krebsova cyklu a mikrobiálních procesů ve střevech. Analýza jejich koncentrací v moči přináší hodnotné informace o nutričním stavu, mikrobiomu a možnostech časné detekce metabolických či gastrointestinálních poruch.
Cílem studie bylo ověřit rychlou a spolehlivou metodu skríninku až 65 organických kyselin z vysušených kapek moči (dried urine spots) pomocí plynové chromatografie s hmotnostní detekcí (GC–MS) systému Shimadzu GCMS-QP2020 NX. Metoda využívá databázi Smart Metabolites DatabaseTM Ver.2 a funkci Automatic Adjustment of Retention Time (AART) pro automatické přizpůsobení retenčních časů a přesnou identifikaci.
Vzorek moči určený podle koncentrace kreatininu se zpracoval takto:
Metoda umožnila kvalitativní identifikaci až 65 organických kyselin v matici vysušené moči. Použití AART a lineárního retenčního indexu zvýšilo přesnost identifikace oproti klasickým spektrálním knihovnám. Rekapitulace klíčových bodů:
Metoda nabízí:
Očekávané směry dalšího rozvoje:
Vyvinutá metoda GC–MS skríninku organických kyselin z vysušených kapek moči pomocí Shimadzu GCMS-QP2020 NX poskytuje rychlý, robustní a přesný přehled metabolického profilu. Nasazení databáze Smart Metabolites a AART výrazně zefektivnilo identifikaci a podporuje širší využití v klinických a nutrigenomických studiích.
GC/MSD, GC/SQ
ZaměřeníMetabolomika, Klinická analýza
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Organické kyseliny jsou klíčovými intermediáty řady metabolických drah včetně Krebsova cyklu a mikrobiálních procesů ve střevech. Analýza jejich koncentrací v moči přináší hodnotné informace o nutričním stavu, mikrobiomu a možnostech časné detekce metabolických či gastrointestinálních poruch.
Cíle a přehled studie
Cílem studie bylo ověřit rychlou a spolehlivou metodu skríninku až 65 organických kyselin z vysušených kapek moči (dried urine spots) pomocí plynové chromatografie s hmotnostní detekcí (GC–MS) systému Shimadzu GCMS-QP2020 NX. Metoda využívá databázi Smart Metabolites DatabaseTM Ver.2 a funkci Automatic Adjustment of Retention Time (AART) pro automatické přizpůsobení retenčních časů a přesnou identifikaci.
Použitá instrumentace
- Shimadzu GCMS-QP2020 NX
- Automatický vkladač vzorků AOC-20i+s
- Kolona SH-Rxi-5Sil MS (30 m × 0,25 mm × 0,25 μm)
- Restek TopazTM Liner (s vlnou)
- Metoda ionizace: EI, skenovací rychlost 20 000 u/s
Použitá metodika
Vzorek moči určený podle koncentrace kreatininu se zpracoval takto:
- Normace objemu vzorku a přidání interních standardů (tridekanová a margarová kyselina)
- Hydrolýza urey pomocí ureázy (37 °C, 30 min)
- Deproteinace ethanolem, centrifugace (3 000 rpm, 4 °C, 5 min) a odpaření supernatantu pod N2 při 60 °C
- Derivatizace BSTFA s 1 % TMCS (80 °C, 30 min)
- Injekce 1 μl do GC–MS v režimu split, programovaná teplota kolony od 60 °C do 310 °C, dobu běhu ~23,7 min
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda umožnila kvalitativní identifikaci až 65 organických kyselin v matici vysušené moči. Použití AART a lineárního retenčního indexu zvýšilo přesnost identifikace oproti klasickým spektrálním knihovnám. Rekapitulace klíčových bodů:
- Celkový iontový chromatogram ukázal dobře separované píky 65 kyselin.
- Porovnání masových spekter s databází Smart Metabolites snížilo falešně pozitivní a negativní nálezy.
- Příklad bibliografické studie odhalil význam fosforečné kyseliny jako biomarker při onemocnění SLE.
- Kalibrační křivky (např. pro kyselinu glutárovou) pro kvantitativní analýzu vykazují vysokou linearitu.
Přínosy a praktické využití
Metoda nabízí:
- Rychlý skrínink nutričních a metabolických markerů z malého objemu vzorku.
- Jednoduchou přípravu vzorku z filtrových papírků i čerstvé moči.
- Možnost využití v klinických laboratořích pro monitoring střevní mikroflóry, diagnostiku poruch vstřebávání živin a v nutraceutickém výzkumu.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekávané směry dalšího rozvoje:
- Rozšíření databází metabolit a integrace s umělou inteligencí pro automatizovanou analýzu profilů.
- Vysokoprůchodnost (high-throughput) pro rutinní klinické a výzkumné aplikace.
- Propojení GC-MS dat s dalšími analytickými technikami (LC–MS, NMR) pro komplexní metabolomiku.
- Personalizované hodnocení výživy na základě individuálních metabolických fingerprintů.
Závěr
Vyvinutá metoda GC–MS skríninku organických kyselin z vysušených kapek moči pomocí Shimadzu GCMS-QP2020 NX poskytuje rychlý, robustní a přesný přehled metabolického profilu. Nasazení databáze Smart Metabolites a AART výrazně zefektivnilo identifikaci a podporuje širší využití v klinických a nutrigenomických studiích.
Reference
- Naraian R., Kumari S. Microbial production of organic acids. Microbial Functional Foods and Nutraceuticals, 2017.
- Suiryanrayna M.V., Ramana J.V. A review of the effects of dietary organic acids fed to swine. Journal of Animal Science and Biotechnology, 2015;6(1):1-11.
- Yan R. et al. Fecal metabolites were altered, identified as biomarkers and correlated with disease activity in patients with systemic lupus erythematosus in a GC-MS-based metabolomics study. Frontiers in Immunology, 2020;11:2138.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Screening of organic acids for nutritional and metabolic profiling from dried urine spots using Gas Chromatograph Mass Spectrometer 
2024|Shimadzu|Postery
TP 401 Screening of organic acids for nutritional and metabolic profiling from dried urine spots using Gas Chromatograph Mass Spectrometer Dr. Aseem Wagle1; Prashant Hase1; Bhaumik Trivedi1; Sanket Chiplunkar1; Durvesh Sawant1; Rahul Dwivedi1; Hemant Kesarkar1; Dheeraj Handique1; Dr. Pratap Rasam1;…
Klíčová slova
acid, acidacids, acidsorganic, organicurine, urinenutritional, nutritionalscreening, screeninglri, lrimarkers, markersmetabolic, metabolicaart, aartcreatinine, creatinineelevated, elevateddisorders, disordersurinary, urinaryname
FAST GCMS DETERMINATION OF URINARY ORGANIC ACIDS FOR DIAGNOSIS OF METABOLISM INBORN ERRORS
|Shimadzu|Aplikace
Application Note FAST GCMS DETERMINATION OF URINARY ORGANIC ACIDS FOR DIAGNOSIS OF METABOLISM INBORN ERRORS Introduction During normal metabolism activities, the nutrients obtained from food are metabolized in the body, which means that they are either stored or used as…
Klíčová slova
gcms, gcmslri, lridiagnosis, diagnosisacids, acidsorganic, organicinternal, internalfast, fastscreening, screeningurinary, urinarysearch, searchacid, acidmetabolism, metabolismshimadzu, shimadzutrimethylester, trimethylesterthanks
Using Gas Chromatography – Tandem Mass Spectrometry to Improve the Reliability and Accuracy of Organic Acid Analyses in Urine
2010|Bruker|Aplikace
Chemical Analysis Application Note # CA-271518 Using Gas Chromatography – Tandem Mass Spectrometry to Improve the Reliability and Accuracy of Organic Acid Analyses in Urine Organic acids are water-soluble compounds containing one or more carboxyl groups, as well as other…
Klíčová slova
oxoglutaric, oxoglutaricurine, urinehydroxy, hydroxyacid, acidoxoisovaleric, oxoisovalerichomogentisic, homogentisicsuberic, subericisocaproic, isocaproicundecanoic, undecanoicmethylmalonic, methylmalonicmalonic, malonicisovaleric, isovalericarabinose, arabinoseacids, acidsorganic
EIGHTH ANNUAL CONFERENCE OF THE CZECH SOCIETY FOR MASS SPECTROMETRY Olomouc, March 27 – March 29, 2019 BOOK OF ABSTRACTS Book of Abstracts from the Eighth Annual Conference of the Czech Society for Mass Spectrometry Czech Society for Mass Spectrometry…
Klíčová slova
abstracts, abstractspresentation, presentationspectrometry, spectrometryczech, czechmass, massrepublic, republicmaldi, maldiproteins, proteinsanalysis, analysisconference, conferenceproteomic, proteomicdnps, dnpscyaa, cyaafrom, fromwere