Identification of Unresolved Components in GC-MS Peaks Using KnowItAll
Prezentace | 2022 | James Little/Mass Spec Interpretation ServicesInstrumentace
V analýze směsí pomocí plynové chromatografie spojené s hmotnostní spektrometrií (GC–MS) se často setkáváme s jevem neúplného rozlišení koeluujících komponent. Odstranění jejich vzájemných interferencí je zásadní pro přesnou identifikaci a kvantifikaci sloučenin v komplexních matricích, a to jak v kvalitativních, tak kvantitativních aplikacích v chemii, farmacii nebo potravinářství.
Školící materiál prezentovaný Jamesem Littlem ukazuje praktické postupy v softwaru KnowItAll pro extrakci, vyhledávání a dekonvoluci spekter skrytých nebo částečně koeluujících komponent. Hlavním cílem je demonstrovat řadu manuálních i automatizovaných algoritmů, které umožňují spolehlivou identifikaci i v případě výrazného šumu a chemického pozadí.
Ulita softwaru KnowItAll poskytuje několik klíčových modulů:
Výukové demo ukazuje analýzu vzorku obsahujícího více než 40 sloučenin s přibližně 11 výrazně nerozlišenými píky. Použití modulů 2‐mixture a 3‐mixture významně zlepšilo identifikační výsledky, zejména tam, kde standardní podobnostní vyhledávání vykazovalo nízké hodnoty HQI (Hit Quality Index < 90 %). Dekonvoluční modul MS Expert automaticky oddělil většinu koeluujících signálů a byl efektivnější než manuální přístupy, avšak v případech silného chemického šumu v baselinu je doporučeno kombinovat metody:
Metodika umožňuje:
Očekává se další integrace strojového učení pro pokročilou dekonvoluci a predikci struktur neznámých komponent. Využití cloudových databází spekter a rozvoj vendor‐neutralních platforem podpoří sdílení dat a rychlejší aktualizace knihoven. Dále mohou vznikat hybridní přístupy kombinující GC–MS s technikami vysokorozlišující hmotnostní spektrometrie (HRMS) pro zlepšení citlivosti a selektivity analýzy.
Pro identifikaci neúplně separovaných komponent v GC–MS je optimální začít dekonvolucí pomocí MS Expert. V případě nedostatečných výsledků lze efektivně aplikovat manuální přístupy: extrakce spekter z okrajů píku, vícesložkové vyhledávání a reverzní analýzu rozdílových spekter. Takový pracovní postup zvyšuje přesnost identifikace a poskytuje robustní řešení pro náročné analytické úlohy.
Software
ZaměřeníVýrobceWiley
Souhrn
Význam tématu
V analýze směsí pomocí plynové chromatografie spojené s hmotnostní spektrometrií (GC–MS) se často setkáváme s jevem neúplného rozlišení koeluujících komponent. Odstranění jejich vzájemných interferencí je zásadní pro přesnou identifikaci a kvantifikaci sloučenin v komplexních matricích, a to jak v kvalitativních, tak kvantitativních aplikacích v chemii, farmacii nebo potravinářství.
Cíle a přehled studie / článku
Školící materiál prezentovaný Jamesem Littlem ukazuje praktické postupy v softwaru KnowItAll pro extrakci, vyhledávání a dekonvoluci spekter skrytých nebo částečně koeluujících komponent. Hlavním cílem je demonstrovat řadu manuálních i automatizovaných algoritmů, které umožňují spolehlivou identifikaci i v případě výrazného šumu a chemického pozadí.
Použitá metodika a instrumentace
Ulita softwaru KnowItAll poskytuje několik klíčových modulů:
- ProcessIt – extrakce spekter z přední či zadní části chromatografického píku s odečtením pozadí
- MineIt a SearchIt – generování rozdílových spekter a jejich vyhledávání pomocí podobnostního vyhledávání
- 2‐mixture a 3‐mixture algortimy – vícesložkové vyhledávání pro přímo koeluované spektra
- MS Expert – automatizovaná dekonvoluce spekter
Hlavní výsledky a diskuse
Výukové demo ukazuje analýzu vzorku obsahujícího více než 40 sloučenin s přibližně 11 výrazně nerozlišenými píky. Použití modulů 2‐mixture a 3‐mixture významně zlepšilo identifikační výsledky, zejména tam, kde standardní podobnostní vyhledávání vykazovalo nízké hodnoty HQI (Hit Quality Index < 90 %). Dekonvoluční modul MS Expert automaticky oddělil většinu koeluujících signálů a byl efektivnější než manuální přístupy, avšak v případech silného chemického šumu v baselinu je doporučeno kombinovat metody:
- Extrahovat spektra z okrajů píku v ProcessIt s korekcí pozadí
- Provést 2‐mixture vyhledávání a zkontrolovat zbytkové ionty
- Při nedostatečných výsledcích přejít na 3‐mixture vyhledávání
- Jako doplněk použít reverzní vyhledávání rozdílového spektra
Přínosy a praktické využití metody
Metodika umožňuje:
- Rychlejší a spolehlivější identifikaci složek v komplexních směsích
- Snížení chyb spojených s koeluujícími píkmi
- Automatizaci rutinních analýz díky MS Expert dekonvoluci
- Flexibilitu díky kombinaci manuálních a automatizovaných přístupů
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se další integrace strojového učení pro pokročilou dekonvoluci a predikci struktur neznámých komponent. Využití cloudových databází spekter a rozvoj vendor‐neutralních platforem podpoří sdílení dat a rychlejší aktualizace knihoven. Dále mohou vznikat hybridní přístupy kombinující GC–MS s technikami vysokorozlišující hmotnostní spektrometrie (HRMS) pro zlepšení citlivosti a selektivity analýzy.
Závěr
Pro identifikaci neúplně separovaných komponent v GC–MS je optimální začít dekonvolucí pomocí MS Expert. V případě nedostatečných výsledků lze efektivně aplikovat manuální přístupy: extrakce spekter z okrajů píku, vícesložkové vyhledávání a reverzní analýzu rozdílových spekter. Takový pracovní postup zvyšuje přesnost identifikace a poskytuje robustní řešení pro náročné analytické úlohy.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Automatic GC-MS Data Processing Using MS Exper
2022|Wiley|Prezentace
KnowItAll Mass Spectrometry Training Vendor Neutral Data Processing Solution for Spectral Analyses “Automatic GC-MS Data Processing Using MS Expert” James Little Mass Spec Interpretation Services Handouts for Videos: Website: Little Mass Spec and Sailing https://littlemsandsailing.wordpress.com NOTE: Series of other training…
Klíčová slova
files, filesclick, clickexpert, expertsearches, searchesautomatic, automaticfile, fileleft, leftdata, dataselect, selectdeconvolution, deconvolutionlibrary, librarynarrow, narrowknowitall, knowitallhqi, hqideselect
Overview of KnowItAll Software for Unknown Identifications in EI GC-MS Analyses
2022|Wiley|Prezentace
KnowItAll Mass Spectrometry Training Vendor Neutral Data Processing Solution for Spectral Analyses “Overview of KnowItAll Software for Unknown Identifications in EI GC-MS Analyses” James Little Mass Spec Interpretation Services Handouts for Videos: Website: “Little Mass Spec and Sailing” https://littlemsandsailing.wordpress.com Note:…
Klíčová slova
searchit, searchitknowitall, knowitallsearch, searchspec, specnominal, nominaljames, jamesspectrum, spectrumselected, selectedmass, masshit, hitmineit, mineitwebsite, websiteprocessit, processitlittle, littlefiles
Transferring Spectra from KnowItAll to NIST Search
2022|Wiley|Prezentace
KnowItAll Mass Spectrometry Training Vendor Neutral Data Processing Solution for Spectral Analyses “Transferring Spectra from KnowItAll to NIST Search” James Little Mass Spec Interpretation Services Handouts for Videos: Website: Little Mass Spec and Sailing https://littlemsandsailing.wordpress.com NOTE: Series of other training…
Klíčová slova
knowitall, knowitallnist, nistsearch, searchcaller, callersearchit, searchitmsp, mspfile, fileprocessit, processitformat, formatspectra, spectratransferring, transferringswitch, switcheasy, easytransfer, transferreasons
Identity Search of GC-MS Data with SearchIt/MineIT
2022|Wiley|Prezentace
KnowItAll Mass Spectrometry Training Vendor Neutral Data Processing Solution for Spectral Analyses “Identity Search of GC-MS Data with SearchIt/MineIT” James Little Mass Spec Interpretation Services Handouts for Videos: Website: Little Mass Spec and Sailing https://littlemsandsailing.wordpress.com Note: Series of training videos/handouts…
Klíčová slova
search, searchsearchit, searchitmineit, mineitprocessit, processitimplicit, implicitclick, clickhydrogens, hydrogensleft, leftreturn, returnpage, pagebottom, bottomclicked, clickedwindow, windowbutton, buttonspectrum