Converting NIST User Library to Wiley User Library
Prezentace | 2022 | James Little/Mass Spec Interpretation ServicesInstrumentace
Konverze uživatelských knihoven hmotnostních spekter mezi formáty NIST a Wiley je klíčová pro zajištění kompatibility analytických nástrojů a efektivní sdílení dat v laboratorní praxi. Umožňuje plné využití vyhledávacích funkcí různých softwarových platforem pro identifikaci látek na základě masových spekter.
Konverze umožňuje zachovat struktury, přesné hmotnosti, seznamy fragmentačních píků a další metadatová pole. Uživatelé získají plnohodnotnou databázi ve formátu Wiley, kterou lze vyhledávat a analyzovat pomocí KnowItAll. Byla zdůrazněna nutnost správného mapování polí a vyloučení uložení numerických hodnot jako textu, aby nedocházelo k chybám při tvorbě knihovny.
Popisovaný postup převodu uživatelských knihoven hmotnostních spekter z formátu NIST do Wiley KnowItAll rozšiřuje možnosti analýzy a vyhledávání. Klíčová je správná příprava dat, mapování polí a kontrola číselných parametrů. Sdílení dat ve formátu Wiley i NIST podporuje interoperabilitu a přispívá k efektivnějšímu využívání spektrálních databází.
Žádné explicitní reference nebyly uvedeny
Software
ZaměřeníVýrobceWiley
Souhrn
Význam tématu
Konverze uživatelských knihoven hmotnostních spekter mezi formáty NIST a Wiley je klíčová pro zajištění kompatibility analytických nástrojů a efektivní sdílení dat v laboratorní praxi. Umožňuje plné využití vyhledávacích funkcí různých softwarových platforem pro identifikaci látek na základě masových spekter.
Cíle a přehled článku
- Popis postupu převodu NIST uživatelské knihovny do formátu Wiley KnowItAll
- Zdůraznění hlavních kroků a doporučení pro zajištění bezproblémové konverze
- Prezentace možností dalšího využití otevřených knihoven spekter MoNA
Použitá metodika a instrumentace
- NIST utility Lib2NIST pro export knihovny do formátu SDF
- Wiley KnowItAll MineIt modul pro import SDF a vytvoření lokální databáze
- Mapování vlastností spekter do databázového formátu Wiley
- Ověření nastavení uložení numerických hodnot a kompakce databáze
Hlavní výsledky a diskuse
Konverze umožňuje zachovat struktury, přesné hmotnosti, seznamy fragmentačních píků a další metadatová pole. Uživatelé získají plnohodnotnou databázi ve formátu Wiley, kterou lze vyhledávat a analyzovat pomocí KnowItAll. Byla zdůrazněna nutnost správného mapování polí a vyloučení uložení numerických hodnot jako textu, aby nedocházelo k chybám při tvorbě knihovny.
Přínosy a praktické využití metody
- Větší flexibilita při sdílení a přenosu dat mezi laboratořemi
- Možnost využití rozsáhlých volně dostupných knihoven MoNA ve formátu NIST i Wiley
- Zrychlení identifikace organických sloučenin díky jednotnému přístupu k databázím
Budoucí trendy a možnosti využití
- Rozšíření podpory pro konverzi specializovaných knihoven (např. GCxGC nebo derivatizovaných sloučenin)
- Automatizace převodního procesu a integrace s cloudovými úložišti dat
- Propojení s AI nástroji pro zlepšení interpretace masových spekter a predikci struktur
Závěr
Popisovaný postup převodu uživatelských knihoven hmotnostních spekter z formátu NIST do Wiley KnowItAll rozšiřuje možnosti analýzy a vyhledávání. Klíčová je správná příprava dat, mapování polí a kontrola číselných parametrů. Sdílení dat ve formátu Wiley i NIST podporuje interoperabilitu a přispívá k efektivnějšímu využívání spektrálních databází.
Reference
Žádné explicitní reference nebyly uvedeny
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Making User Library Using PubChem & MS Interpreter
2022|Wiley|Prezentace
Sept 18, 2022 Skills Needed from Previous Videos and Handouts ProcessIt for obtaining an EI spectrum from a GC-MS file SearchIt/MineIt for searching a mass spectrum Tips for drawing structures using ChemWindow NOTE: Internet links to my FREE course on…
Klíčová slova
mineit, mineitinterpreter, interpretertutorial, tutorialchemwindow, chemwindowprocessit, processithandout, handoutvideo, videoadd, addnist, nistspectrum, spectrumfile, filerecord, recordlinks, linkssearchit, searchithandouts
Wiley Spectral Webinar Part V: Creating and Sharing User EI and MS/MS Libraries
2020|Wiley|Prezentace
Wiley Spectral Webinar Part V: Creating and Sharing User EI and MS/MS Libraries 12/27/20 James Little [email protected] https://littlemsandsailing.wordpress.com/ Kingsport, TN Retired* Research Fellow, Eastman Chem. Co. 42 years experience unknown identification Now Consultant, MS Interpretation Services Specialties1 EI GC-MS, LC-MS/MS,…
Klíčová slova
lmb, lmblibrary, librarynist, nistspectrum, spectrumsearch, searchuser, userentries, entriesprogram, programlibraries, librarieswindow, windowkeyboard, keyboardcomments, commentstags, tagswiley, wileyadded
Free NIST GC-MS Software Lab for Universities: Part 9: 58,456 Additional Reference Spectra for NIST Demo Search
2023||Prezentace
Free NIST GC-MS Software Lab for Universities: Part 9: 58,456 Additional Reference Spectra for NIST Demo Search Resource Link to 5 Additional Libraries in Combined in One Zipped File James Little August 29, 2023 38 years Eastman Chemical Company 7…
Klíčová slova
library, librarymona, monalibraries, librariesnist, nistlink, linksearch, searchdemo, democayman, caymansdf, sdfdownload, downloadquality, qualitygood, goodindex, indexswgdrug, swgdrugspectrum
Wiley Spectral Webinar Part I: Spectral Searches with NIST MS Search
2020|Wiley|Prezentace
Wiley Spectral Webinar Part I: Spectral Searches with NIST MS Searc 12/27/20 James Little [email protected] https://littlemsandsailing.wordpress.com/ Kingsport, TN Retired* Research Fellow, Eastman Chem. Co. 42 years experience unknown identification Now Consultant, MS Interpretation Services Specialties1 EI GC-MS, LC-MS/MS, Chemical Ionization,7…
Klíčová slova
search, searchlmb, lmbnist, nistlibraries, librariestour, tourpresearch, presearchwindow, windowcontinued, continuedtab, tabwindows, windowsstructure, structureprogram, programspectrum, spectrumhit, hitlibrary
