Advanced Utilization of the Custom Calculator Tool for OpenLab CDS: An Oligonucleotide Example

Význam tématu

Analýza oligonukleotidů je klíčová pro hodnocení čistoty farmaceutických produktů a stabilitu během výroby i skladování. Tradiční manuální zpracování dat z LC–MS analýzy je časově náročné a náchylné k chybám. Automatizace pomocí custom výpočtů významně zvyšuje efektivitu a spolehlivost výsledků.

Cíle a přehled studie / článku

Cílem bylo demonstrovat využití nástroje Custom Calculator v softwaru OpenLab CDS pro automatizovanou extrakci a výpočet procentuálního podílu (%Area) hlavního produktu (FLP) a jednotlivých nečistot (shortmery, longmery, adukty, degradanty) u oligonukleotidů. Studie porovnává manuální workflow se zcela automatizovaným procesem a kvantifikuje úsporu času a zátěž pro laboratorní personál.

Použitá metodika a instrumentace

Vzorky syntetických oligonukleotidů obsahovaly desítky až stovky koelujících nečistot. Pro jejich kvantifikaci byla využita kombinace chromatografické (UV) a hmotnostní (MS) detekce. Extrakce signálů probíhala v předdefinovaných časových oknech pro jednotlivé m/z kanály.

• Software: Agilent OpenLab CDS s modulem Custom Calculator
• Hmotnostní detektor: Agilent MSD XT single quadrupole
• Výpočet: automatické seskupení do kategorií FLP, shortmer, longmer, oxidované a depurinované formy a dalších

Hlavní výsledky a diskuse

Automatizované nastavení custom výpočtů trvalo přibližně 15 minut versus 30–120 minut u manuálního postupu. Následná každodenní práce s daty se zkrátila na 2 minuty pro celý datový soubor až 100 kanálů místo hodinové rutiny. Výsledky vykazují vysokou reprodukovatelnost a eliminují ruční chyby při opakovaných výpočtech.

Přínosy a praktické využití metody

Metoda významně snižuje pracovní zátěž laboratorních analytiků a administrátorů, zvyšuje propustnost a konzistenci výsledků. Automatizované reporty poskytují okamžité přehledy o čistotě produktů, usnadňují dokumentaci a zrychlují rozhodovací procesy v rámci QA/QC.

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekává se rozšíření této automatizace na další typy biomolekul a integrace s laboratorními informačními systémy (LIMS). Dále se otevírá prostor pro využití umělé inteligence k dynamické optimalizaci časových oken a adaptivních výpočtů při analýze komplexních vzorků.

Závěr

Jednorázové nastavení Custom Calculator workflow v OpenLab CDS přináší výrazné časové úspory, vyšší kvalitu dat a minimalizaci chyb u analýzy oligonukleotidů. Doporučuje se pro rutinní QC a výzkumné laboratoře, které požadují rychlé a spolehlivé výsledky.

Reference

• Grossman J.N., Van Herck N., Thibaut F. a kol. Advanced Utilization of the Custom Calculator Tool for OpenLab CDS: An Oligonucleotide Example. Agilent Technologies, USA, únor 2023.