Optimizing tissue preparation and storage for analysis of polyunsaturated fatty acids using Agilent’s FTIR imaging systems
Aplikace | 2014 | Agilent TechnologiesInstrumentace
Polynenasycené mastné kyseliny (PUFA), jako je DHA, EPA a AA, hrají klíčovou roli v biochemických procesech mozku a sítnice. Jejich oxidativní degradace může ovlivnit interpretaci výsledků při studiu neurodegenerativních onemocnění. FTIR zobrazování umožňuje mapovat rozložení PUFA na subbuněčné úrovni, a proto je optimalizace přípravy a uchovávání vzorků zásadní pro spolehlivou analýzu.
Cílem bylo sledovat rychlost oxidace PUFA v tenkých řezech myší sítnice za různých skladovacích podmínek a navrhnout protokoly minimalizující ztrátu biomarkerů pro přesné FTIR měření.
Vzorky sítnice (7 µm) z divokého typu myši byly kryokrájeny, umístěny na MirrIR podložky nebo BaF2 okénka a skladovány při –70 °C. Pro měření byly po rozmražení a vysušení uloženy v temnu při pokojové teplotě a snímkovány v čase následujících intervalů:
FTIR obrazy pro pásmo olefínového C=C–H (3012 cm⁻¹) ukázaly:
Optimalizované FTIR zobrazování přináší:
Metoda lze rozšířit o:
Pro co nejpřesnější měření PUFA v tkáňových řezech je nezbytné co nejdříve po rozmražení a vysušení provést FTIR zobrazování v temnu. Delší skladování vede k významné oxidaci a podhodnocení obsahu PUFA.
1. Fraser T., Taylor H., Love S. Neurochem. Res. 35, 503–513 (2010)
2. Hartmann T., Kuchenbecker J., Grimm M. O. W. J. Neurochem. 103, 159–170 (2007)
3. Stitt D. M., Kastyak-Ibrahim M. Z., Liao C. R., Morrison J., Albensi B. C., Gough K. M. Tissue acquisition and storage associated oxidation considerations for FTIR microspectroscopic imaging of polyunsaturated fatty acids. Vib. Spectrosc. 60, 16–22 (2012)
FTIR Spektroskopie, Mikroskopie
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Polynenasycené mastné kyseliny (PUFA), jako je DHA, EPA a AA, hrají klíčovou roli v biochemických procesech mozku a sítnice. Jejich oxidativní degradace může ovlivnit interpretaci výsledků při studiu neurodegenerativních onemocnění. FTIR zobrazování umožňuje mapovat rozložení PUFA na subbuněčné úrovni, a proto je optimalizace přípravy a uchovávání vzorků zásadní pro spolehlivou analýzu.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem bylo sledovat rychlost oxidace PUFA v tenkých řezech myší sítnice za různých skladovacích podmínek a navrhnout protokoly minimalizující ztrátu biomarkerů pro přesné FTIR měření.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky sítnice (7 µm) z divokého typu myši byly kryokrájeny, umístěny na MirrIR podložky nebo BaF2 okénka a skladovány při –70 °C. Pro měření byly po rozmražení a vysušení uloženy v temnu při pokojové teplotě a snímkovány v čase následujících intervalů:
- FTIR mikroskop Agilent Cary 620 s 64×64 pixelovou FPA detekcí (5,5 µm/pixel),
- Agilent Cary 670 FTIR spektrometr, spektrální rozsah 4000–900 cm⁻¹, rozlišení 4 cm⁻¹, 256 skenů na spektrum,
- Režimy: reflexe (MirrIR) a průchod (BaF2),
- Analýza dat: Agilent Resolutions Pro a vlastní software.
Hlavní výsledky a diskuse
FTIR obrazy pro pásmo olefínového C=C–H (3012 cm⁻¹) ukázaly:
- Nejvyšší koncentrace PUFA v disku mikrodisků tyčinek (ROS) sítnice.
- Po 12 hodinách od rozmražení bylo dosaženo prvního měření, následně u normálního skladování (temno, pokojová teplota) 3, 7, 15, 31 a 272 dní.
- Pokles intenzity olefínového pásma o ~8 % během prvních 2 týdnů, ~15 % po měsíci a pod jednu třetinu původní hodnoty po 8 měsících.
- Menší, ale významný pokles karbonylového pásma (1735 cm⁻¹) a změny ve spektru OH stretch naznačující vznik nových oxidačních produktů.
Přínosy a praktické využití metody
Optimalizované FTIR zobrazování přináší:
- Prostorové rozlišení PUFA na subbuněčné úrovni v biologických tkáních.
- Kvantitativní sledování degradace při běžných laboratorních podmínkách.
- Návod na minimalizaci podhodnocení PUFA analýzou čerstvých vzorků.
Budoucí trendy a možnosti využití
Metoda lze rozšířit o:
- FTIR zobrazování dalších lipidových tříd v různých tkáních.
- Automatizované SPME nebo inline spektroskopické techniky pro vysokopropustné analýzy.
- Multimodální zobrazování kombinující FTIR s Ramanovou spektroskopií či hmotnostní spektrometrií.
Závěr
Pro co nejpřesnější měření PUFA v tkáňových řezech je nezbytné co nejdříve po rozmražení a vysušení provést FTIR zobrazování v temnu. Delší skladování vede k významné oxidaci a podhodnocení obsahu PUFA.
Reference
1. Fraser T., Taylor H., Love S. Neurochem. Res. 35, 503–513 (2010)
2. Hartmann T., Kuchenbecker J., Grimm M. O. W. J. Neurochem. 103, 159–170 (2007)
3. Stitt D. M., Kastyak-Ibrahim M. Z., Liao C. R., Morrison J., Albensi B. C., Gough K. M. Tissue acquisition and storage associated oxidation considerations for FTIR microspectroscopic imaging of polyunsaturated fatty acids. Vib. Spectrosc. 60, 16–22 (2012)
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
High Spatial resolution FTIR imaging of biomedical tissue samples using a novel method of magnification enhancement
2014|Agilent Technologies|Aplikace
High Spatial resolution FTIR imaging of biomedical tissue samples using a novel method of magnification enhancement Application note Biomedical Research Authors Mustafa Kansiz1, Carol Hirschmugl2, Benedict Albensi3, Catherine Liao4, Kathleen Gough4 1 Agilent Technologies Australia Pty Ltd, Mulgrave, Australia 2…
Klíčová slova
magnification, magnificationsynchrotron, synchrotronabsorbance, absorbancespatial, spatialireni, irenipixel, pixelglobar, globarftir, ftiragilent, agilentimaging, imagingsource, sourcehigh, highmicroscope, microscopebiomedical, biomedicalstandard
Rapid screening of brain tissue with a high spatial resolution over large analysis areas using Agilent’s 670 and 620 FTIR imaging analysis
2012|Agilent Technologies|Aplikace
Rapid screening of brain tissue with a high spatial resolution over large analysis areas using Agilent’s 670 and 620 FTIR imaging analysis Application note Biomedical Authors Kathleen M. Gough*, Alexandra Kuzyk*, Jonah Kirkwood† * Department of Chemistry University of Manitoba…
Klíčová slova
imaging, imagingmosaic, mosaicbrain, brainplaques, plaquesspatial, spatialtissue, tissueresolutions, resolutionsagilent, agilentchemical, chemicalresolution, resolutiontangles, tanglesinvestigate, investigateinfrared, infraredmanitoba, manitobahippocampus
Polymers and Rubbers Application Compendium
2010|Agilent Technologies|Příručky
MATERIALS TESTING AND RESEARCH SOLUTIONS FROM AGILENT Polymers and Rubbers Application Compendium AGILENT TECHNOLOGIES MATERIALS TESTING AND RESEARCH SOLUTIONS From the extraction of raw materials through the development, manufacturing and utilization of advanced materials, to material reuse and recycling, Agilent…
Klíčová slova
kfm, kfmsurface, surfaceforce, forceafm, afmmodulus, modulustopography, topographyimages, imagesimaging, imagingpolymer, polymerscratch, scratchsample, samplepotential, potentialprobe, probefrom, frommeasurements
FTIR Microscopic Imaging of Large Samples with 4x and 15x Infrared Objectives: A Case Study of a Carcinoma Tissue Section
2014|Agilent Technologies|Aplikace
FTIR Microscopic Imaging of Large Samples with 4x and 15x Infrared Objectives: A Case Study of a Carcinoma Tissue Section Application note Biomedical Research Author Claudia Beleites*, Jürgen Popp*, Christoph Krafft*, Mustafa Kansiz† * Institute of Photonic Technology, Albert-Einstein-Str. 9,…
Klíčová slova
tissue, tissuecarcinoma, carcinomamosaic, mosaicsize, sizeftir, ftirfile, filemosaics, mosaicspixel, pixelfov, fovdata, datafpa, fpasection, sectionimages, imagesfive, fivemicroscopic