GC/MS Metabolomics with Automated Sample Preparation and Measurement followed by AI- assisted Data Analysis and Discussion
Aplikace | 2024 | ShimadzuInstrumentace
Analýza metabolitů v bylinných lécích pomocí GC-MS poskytuje detailní chemický profil účinných složek, který je klíčový pro standardizaci, kontrolu kvality a bezpečnost tradičních přípravků. Automatizace přípravy vzorků a využití umělé inteligence při zpracování dat snižují pracovní zátěž, zvyšují reprodukovatelnost a zkracují dobu od přípravy po výsledky.
Cílem studie bylo demonstrovat plně integrovaný workflow pro metabolomickou analýzu tří komerčně dostupných čínských bylinných prášků (n=5), který kombinuje:
Vzorky byly připraveny na online SPE systému SPL-M100, který automaticky derivatizuje hydrofobní i hydrofilní metabolity v čase 15 minut na vzorek s překryvem přípravy a měření. GC-MS analýza probíhala v MR M režimu za podmínek: odstupňované zahřívání pece (100→330 °C), 30 µl injekce, helium jako nosný plyn, celkově 23 minut na běh. AI-algoritmus Peakintelligence zajišťuje přesnou integraci špiček a potlačení šumu. Pro statistickou analýzu a vizualizaci dat byly použity PCA, hierarchické shlukování, volcano plot a mapování metabolických drah v Multi-Omics Analysis Package a generativní AI Chatcata pro interpretaci výsledků.
Integrace pokročilých AI nástrojů do analytických workflow se bude dále rozšiřovat, včetně prediktivní analýzy a autonomních laboratorních systémů. Kombinace multi-omics dat (metabolomika, proteomika) a strojového učení otevře nové možnosti v personalizované medicíně, kontrole potravinové bezpečnosti a vývoji fytoterapeutik.
Představený systém GCMS-TQ8040 NX s automatizovaným předzpracováním SPL-M100 a AI podporou významně urychluje komplexní analýzu metabolitů v bylinných přípravcích, zvyšuje reprodukovatelnost výsledků a zkracuje dobu od vzorku k interpretaci. Tento přístup představuje efektivní nástroj pro QA/QC, výzkum i vývoj nových farmaceutických a potravinářských produktů.
GC/MSD, GC/MS/MS, HeadSpace, Příprava vzorků, GC/QQQ
ZaměřeníFarmaceutická analýza
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Analýza metabolitů v bylinných lécích pomocí GC-MS poskytuje detailní chemický profil účinných složek, který je klíčový pro standardizaci, kontrolu kvality a bezpečnost tradičních přípravků. Automatizace přípravy vzorků a využití umělé inteligence při zpracování dat snižují pracovní zátěž, zvyšují reprodukovatelnost a zkracují dobu od přípravy po výsledky.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem studie bylo demonstrovat plně integrovaný workflow pro metabolomickou analýzu tří komerčně dostupných čínských bylinných prášků (n=5), který kombinuje:
- automatizovanou přípravu vzorku (SPL-M100),
- rychlou GC-MS analýzu více než 400 TMS derivátů (GCMS-TQ8040 NX, MRM režim, doba 23 min),
- AI-řízenou integraci špiček (Peakintelligence),
- statistickou a biologickou interpretaci dat (Multi-Omics Analysis Package, generativní AI Chatcata).
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky byly připraveny na online SPE systému SPL-M100, který automaticky derivatizuje hydrofobní i hydrofilní metabolity v čase 15 minut na vzorek s překryvem přípravy a měření. GC-MS analýza probíhala v MR M režimu za podmínek: odstupňované zahřívání pece (100→330 °C), 30 µl injekce, helium jako nosný plyn, celkově 23 minut na běh. AI-algoritmus Peakintelligence zajišťuje přesnou integraci špiček a potlačení šumu. Pro statistickou analýzu a vizualizaci dat byly použity PCA, hierarchické shlukování, volcano plot a mapování metabolických drah v Multi-Omics Analysis Package a generativní AI Chatcata pro interpretaci výsledků.
Hlavní výsledky a diskuse
- Detekováno ~250 metabolitů v každé skupině bylinných prášků.
- SPL-M100 snížil dobu přípravy vzorku z 1,5 dne na 15 minut (redukováno o 144×).
- Workflow umožnilo overlap mezi přípravou a analýzou, což při 30 vzorcích ušetřilo 37 hodin (18 h vs. 55 h konvenčně).
- Peakintelligence zlepšila integraci špiček, eliminovala falešné signály a snížila manuální čas analýzy z 2,5 h na 1,75 h.
- Generativní AI Chatcata zrychlila interpretaci, navrhla biologicky relevantní hypotézy (např. metabolismus purinů u hypoxanthinu).
Přínosy a praktické využití metody
- Vyšší propustnost laboratoře a standardizace přípravy vzorků.
- Vylepšená přesnost kvantifikace i v přítomnosti složitých matric (cukry, polyfenoly).
- Snížení kontaminace a variability TMS derivátů díky konzistentní době mezi derivatizací a analýzou.
- Rychlá generace biologických závěrů s podporou AI šetří lidské zdroje.
Budoucí trendy a možnosti využití
Integrace pokročilých AI nástrojů do analytických workflow se bude dále rozšiřovat, včetně prediktivní analýzy a autonomních laboratorních systémů. Kombinace multi-omics dat (metabolomika, proteomika) a strojového učení otevře nové možnosti v personalizované medicíně, kontrole potravinové bezpečnosti a vývoji fytoterapeutik.
Závěr
Představený systém GCMS-TQ8040 NX s automatizovaným předzpracováním SPL-M100 a AI podporou významně urychluje komplexní analýzu metabolitů v bylinných přípravcích, zvyšuje reprodukovatelnost výsledků a zkracuje dobu od vzorku k interpretaci. Tento přístup představuje efektivní nástroj pro QA/QC, výzkum i vývoj nových farmaceutických a potravinářských produktů.
Reference
- メタボローム分析用オンラインSPE-GCシステム SPL-M100 [Online SPE-GC System for Metabolome Analysis SPL-M100], AiSTI SCIENCE Co. Ltd, accessed Dec 5, 2023.
- Time-saving data processing for pesticide residues with Peakintelligence™ for GCMS, Application News No. 01-00585-EN.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Shimadzu Software Comprehensive Catalog LabSolutions
2025|Shimadzu|Brožury a specifikace
C191-E058 Shimadzu Software Comprehensive Catalog LabSolutions Workflow in Laboratory Automated sampling Optimization of analysis schedule Study phase Automatic generation of acquisition method Data acquisition Automated pre-processing Sample setup / injection Instrument stabilization Shimadzu Software Analytical Workflow Management Using AI to…
Klíčová slova
labsolutions, labsolutionsacq, acqdata, dataclient, clientpeakintelligence, peakintelligencegcms, gcmsreport, reportserver, serveranalytical, analyticalanalysis, analysisreports, reportsintegration, integrationproduct, productmanagement, managementinsight
Facilitation of Bio-manufacturing Research Through Metabolic Pathway Analysis Simulation
2024|Shimadzu|Aplikace
GCMS GCMS-TQ™8040 NX Application News Facilitation of Bio-manufacturing Research Through Metabolic Pathway Analysis Simulation Yuki Nakagawa1, Shuya Arakawa2, Ryoichi Sasano2, Shigetoshi Yoshikawa3, Kazuki Tomita4, Kenya Tanaka4,5, Tomohisa Hasunuma4, 5 1 Shimadzu Corporation 2 AiSTI SCIENCE Co., Ltd. 3 Infocom Corporation…
Klíčová slova
orsellinic, orselliniclichens, lichensmetabolic, metabolicpathway, pathwaymetabolite, metaboliteacid, acidarea, areaprojection, projectionbio, biosimulation, simulationmanufacturing, manufacturingproduce, producenews, newsorcinol, orcinolaccumulation
Secrets of science magazine 02/2024
2024|Shimadzu|Ostatní
02/2024 How to create a nervous system for infrastructural buildings Design and testing of distributed optical sensors and other diagnostic solutions Accelerating towards the future of drug discovery Using AI-led design and automated synthesis to speed up discovery of potential…
Klíčová slova
coumarin, coumarinpeakintelligence, peakintelligencewoodruff, woodruffdiscovery, discoveryinfrastructural, infrastructuralswitch, switchsensors, sensorsnervous, nervousintegration, integrationvoices, voicesbuildings, buildingsgcms, gcmswater, waterdesign, designwine
Metabolomic differential analysis of gene-mutated Drosophila using GC/MS
2023|Shimadzu|Aplikace
GC-MS Application News GCMS-TQ™8040 NX Metabolomic differential analysis of gene-mutated Drosophila using GC/MS Dr. S. Kashio*1, E. Shimbo*2, Y. Yamada*2, Y. Nakagawa*2 *1: Genetics laboratory, Tokyo University *2: Shimadzu Corporation User Benefits Obtained GC/MS data can be easily visualized…
Klíčová slova
wild, wilddrosophila, drosophilagenetically, geneticallymetabolites, metabolitesmutations, mutationsmutated, mutatedgenetic, geneticmethoxamine, methoxamineomics, omicsgene, genenews, newsmutant, mutantanalysis, analysismin, minpackage