Mnova Gears – MS Scan (Starting Guide)
Manuály | 2023 | SciY/Mestrelab ResearchInstrumentace
Analýza LC-MS dat a kvantifikace vybraných iontů v metabolomice je často časově náročná a náročná na manuální zpracování. Plugin MS Scan v Mnova Gears přináší automatizované extrakce hmotnostních spekter a chromatogramů, čímž zjednodušuje tuto úlohu.
Dokument popisuje konfiguraci a spuštění analýzy MS Scan 1.0, včetně pěti klíčových kroků pracovního postupu: Input, Processing, Plugins, Design a Output. Ukazuje, jak vybrat vstupní soubory, nastavit plugin a získat výsledné reporty.
Analýza probíhá na datech z LC-MS (TIC soubory) pomocí softwaru Mnova Gears. Klíčovým modulem je plugin MS Scan, který:
Výstupní složka obsahuje timestamp složku s CSV soubory a HTML reporty sumarizující parametry analýzy (tolerance, prahové hodnoty) a výsledné metriky špiček. HTML report umožňuje interaktivní úpravy zobrazených sloupců a export dat do CSV či PDF.
Dalším vývojem mohou být funkce pro opakované analýzy, pokročilé filtry detekce signálu, integrace s databázemi chemických sloučenin a rozšíření pro další typy instrumentace. Automatizace bude v budoucnu směřovat k plnohodnotné platformě pro nestrukturované metabolomické studie.
MS Scan 1.0 v Mnova Gears nabízí robustní nástroj pro automatizovanou extrakci a kvantifikaci dat z LC-MS experimentů. Díky snadnému nastavení, přizpůsobitelným výstupům a podpoře Mgears Vieweru přispívá k efektivnímu workflow v metabolomice.
©2023 MestreLab Research S.L. Manual Mnova Gears pluginy
Software, GC/MSD, LC/MS
ZaměřeníOstatní
VýrobceSciY/Mestrelab Research
Souhrn
Význam tématu
Analýza LC-MS dat a kvantifikace vybraných iontů v metabolomice je často časově náročná a náročná na manuální zpracování. Plugin MS Scan v Mnova Gears přináší automatizované extrakce hmotnostních spekter a chromatogramů, čímž zjednodušuje tuto úlohu.
Cíle a přehled studie
Dokument popisuje konfiguraci a spuštění analýzy MS Scan 1.0, včetně pěti klíčových kroků pracovního postupu: Input, Processing, Plugins, Design a Output. Ukazuje, jak vybrat vstupní soubory, nastavit plugin a získat výsledné reporty.
Použitá metodika a instrumentace
Analýza probíhá na datech z LC-MS (TIC soubory) pomocí softwaru Mnova Gears. Klíčovým modulem je plugin MS Scan, který:
- extrahuje až tři hmotnostní spektra v definovaných časových oknech,
- identifikuje a kvantifikuje chromatografické špičky dle nastavené tolerance a prahových hodnot,
- generuje CSV a HTML reporty s hodnotami m/z, retenčního času, relativní a absolutní plochy a výšky špiček.
Hlavní výsledky a diskuse
Výstupní složka obsahuje timestamp složku s CSV soubory a HTML reporty sumarizující parametry analýzy (tolerance, prahové hodnoty) a výsledné metriky špiček. HTML report umožňuje interaktivní úpravy zobrazených sloupců a export dat do CSV či PDF.
Přínosy a praktické využití metody
- Výrazné zrychlení a standardizace zpracování LC-MS dat,
- Možnost hromadné analýzy velkého počtu vzorků,
- Interaktivní kontrola a úpravy výsledků v Mgears Vieweru,
- Snadné generování přehledných reportů pro další statistické a kvalitativní hodnocení.
Budoucí trendy a možnosti využití
Dalším vývojem mohou být funkce pro opakované analýzy, pokročilé filtry detekce signálu, integrace s databázemi chemických sloučenin a rozšíření pro další typy instrumentace. Automatizace bude v budoucnu směřovat k plnohodnotné platformě pro nestrukturované metabolomické studie.
Závěr
MS Scan 1.0 v Mnova Gears nabízí robustní nástroj pro automatizovanou extrakci a kvantifikaci dat z LC-MS experimentů. Díky snadnému nastavení, přizpůsobitelným výstupům a podpoře Mgears Vieweru přispívá k efektivnímu workflow v metabolomice.
Reference
©2023 MestreLab Research S.L. Manual Mnova Gears pluginy
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Mnova Gears – Chrom Cal (Starting Guide)
2023|SciY/Mestrelab Research|Manuály
Gears Chrom Calibration 1.0 STARTING GUIDE Document Number P/N 345 R1.1 Gears Chrom Cal 1.0 | Starting guide COPYRIGHT ©2023 MESTRELAB RESEARCH S.L. All rights reserved. No parts of this work may be reproduced in any form or by any…
Klíčová slova
mnova, mnovacexpected, cexpectedcalibration, calibrationdirectory, directoryreports, reportscsv, csvgrouping, groupingdocument, documentresults, resultspdf, pdfccalculated, ccalculatedpointwiseresults, pointwiseresultsunselecting, unselectingagain, againsaved
Mnova Gears – DB Search (Starting Guide)
2022|SciY/Mestrelab Research|Manuály
Document Number P/N 238 R1.1 Gears DB Search 1.1 | Starting guide COPYRIGHT ©2022 MESTRELAB RESEARCH S.L. All rights reserved. No parts of this work may be reproduced in any form or by any means - graphic, electronic, or mechanical,…
Klíčová slova
mgears, mgearsyou, youclick, clickstack, stackmnova, mnovaquery, queryspectrum, spectrumsearch, searchoptions, optionshit, hitclicking, clickinginput, inputyour, yourdocument, documentwhether
Mnova Gears – Chrom Reaction Optimization (Starting Guide)
2023|SciY/Mestrelab Research|Manuály
Document Number P/N 312 R1.1 Chrom Reaction Optimization| Starting guide COPYRIGHT ©2023 MESTRELAB RESEARCH S.L. All rights reserved. No parts of this work may be reproduced in any form or by any means - graphic, electronic, or mechanical, including photocopying,…
Klíčová slova
chrom, chromstarting, startingoptimization, optimizationreaction, reactionguide, guidemgears, mgearstab, tabyou, youmnova, mnovaclicking, clickingcomponent, componentviewer, viewercsv, csvclick, clickoutput
Mnova Gears – Fraction Analysis (Starting Guide)
2023|SciY/Mestrelab Research|Manuály
Document Number P/N 462 R1 Fraction Analysis| Starting guide COPYRIGHT ©2023 MESTRELAB RESEARCH S.L. All rights reserved. No parts of this work may be reproduced in any form or by any means - graphic, electronic, or mechanical, including photocopying, recording,…
Klíčová slova
fraction, fractionstarting, startingguide, guideanalysis, analysis𝑡𝑎𝑟𝑔𝑒𝑡, 𝑡𝑎𝑟𝑔𝑒𝑡fractions, fractionsmgears, mgearsdocument, documentthresholds, thresholdspurity, purity𝑖𝑚𝑝𝑢𝑟𝑖𝑡𝑖𝑒𝑠, 𝑖𝑚𝑝𝑢𝑟𝑖𝑡𝑖𝑒𝑠peak, peak𝑃𝑢𝑟𝑖𝑡𝑦, 𝑃𝑢𝑟𝑖𝑡𝑦background, backgroundthreshold
