Mnova DB Server (User Manual)

Význam tématu

MnServer představuje centralizované řešení pro ukládání a sdílení chemických a analytických dat (molekulární struktury, texty, kresby, NMR, MS a další) v rámci laboratoří s více platformami. Cílem je nahradit lokální soubory jednotnou databází, která zvyšuje efektivitu práce, podporuje spolupráci vědců a zajišťuje konzistentní správu verzí a přístupových práv.

Cíle a přehled dokumentu

Tento manuál popisuje verzi MnServer 2.0 od MESTRELAB RESEARCH (2022) a poskytuje podrobný postup pro:

• Instalaci různých edic: MyData (lokální SQLite), MnDB Group (síťová SQLite), MnDB Enterprise (různé RDBMS).
• Konfiguraci serveru, licencování a databázového připojení.
• Správu uživatelů interně i prostřednictvím Active Directory.
• Provoz, testování a audit změn v databázi.

Použitá metodika a instrumentace

Software a nástroje potřebné pro nasazení MnServeru:

• Java Runtime Environment (min. verze 1.8, doporučeno 11).
• Operační systémy podporující Javu: Windows 7/10, macOS 10.13+, Linux (Red Hat, Suse, Ubuntu apod.).
• Databázové backendy: SQLite (MyData, MnDB Group), Oracle, MySQL, PostgreSQL (MnDB Enterprise).
• Nástroje pro správu: MnServerAdmin (grafické i konzolové), startServer/startMnServer skripty, TestClient, Python 3.8+ a skript Audit.py pro auditní rozhraní.
• Volitelně Active Directory pro centrální autentizaci a řízení přístupových práv.

Hlavní funkce a diskuse

• Instalace: Jednoduché MSI (Windows) nebo JAR instalátory (Mac/Linux), možnost bezhlavé instalace.
• Konfigurace: Generování souboru MnServer.conf s parametry DB připojení, portu a licencí.
• Správa uživatelů: Interní ukládání rolí a přístupů (Searcher až Administrator) nebo automatické přiřazení rolí dle členství v AD.
• Provoz: Server jako služba na Windows, demon na Unix/Linux, podpora virtualizačním prostředím.
• Testování: TestClient ověřuje připojení a autorizaci uživatelů.
• Audit trail: Log4j pro systémové logy, audit.log sleduje všechny změny SQL příkazy. Audit.py umožňuje pohodlné vyhledávání podle CID, SNR, uživatele či databáze.

Přínosy a praktické využití

MnServer zajišťuje:

• Jednotné úložiště analytických dat napříč platformami.
• Podporu multiuživatelského prostředí s jemně nastavitelnými právy.
• Možnost zálohování jednoduchým kopírováním SQLite složky nebo standardními nástroji DBMS.
• Sledování veškerých úprav v audit logu pro zajištění souladu s normami QA/QC.

Budoucí trendy a možnosti využití

Možné směry dalšího rozvoje:

• Nasazení v cloudu a kontejnerizace (Docker, Kubernetes).
• Hlubší integrace s laboratorními informačními systémy (LIMS).
• Automatizovaný import/export datových formátů a rozšířená REST API.
• Využití strojového učení pro prediktivní analýzy a prohledávání rozsáhlých datových sad.

Závěr

MnServer 2.0 je robustní, flexibilní a škálovatelné řešení pro centralizované ukládání chemických a analytických dat. Díky podpoře různých databázových backendů, multiplatformní klientské aplikaci a modulární architektuře nabízí vysokou úroveň bezpečnosti, správy uživatelů i auditu a splňuje požadavky moderních laboratoří.