Free NIST GC-MS Software Lab for Universities: Part 6: Structure Searches with Input from ChemSketch

Význam tématu

Interakce mezi softwarovým nástrojem pro vyhledávání hmotnostních spekter NIST MS Search a kreslicím programem ACD/ChemSketch umožňuje uživatelům přímo importovat navržené struktury a okamžitě je porovnat s knihovnou EI spekter. Tento přístup zjednodušuje identifikaci neznámých látek, urychluje výuku GC–MS metod a podporuje výzkum i kontrolu kvality v akademických i průmyslových laboratořích.

Cíle a přehled studie / článku

• Předvést způsob přenosu struktur mezi NIST MS Search a ChemSketch.
• Upozornit na běžné problémy (bugy) při kopírování a nabídnout praktická řešení.
• Ukázat proces zpětného vložení upravené struktury do vyhledávacího programu NIST.

Použitá metodika a instrumentace

• Přenos struktury jako výchozího editoru: Nastavení ACD/ChemSketch jako implicitního kreslicího programu v NIST MS Search.
• Přenos přes clipboard: Kopírování struktury do schránky a vložení do ChemSketch.
• Řešení chyby oxidačního stavu: Označení struktury v ChemSketch a úprava stylu zpět na standardní zobrazení.
• Zpětné vložení struktury do NIST MS Search: Výběr, kopírování a vkládání přes kontextové menu.

Použitá instrumentace

• NIST MS Search – software pro vyhledávání a porovnávání hmotnostních spekter.
• ACD/ChemSketch – program pro kreslení a úpravu chemických struktur.

Hlavní výsledky a diskuse

• Uživatelé mohou efektivně přenášet struktury oběma směry mezi NIST MS Search a ChemSketch bez nutnosti manuálního překreslování.
• Odhalený bug s nesprávným oxidačním stavem lze jednoduše odstranit změnou stylu zobrazení v ChemSketch.
• Postup výrazně zrychluje proces vyhledávání a ověřování struktur, snižuje chybovost a zvyšuje přehlednost práce se spektrometry.

Přínosy a praktické využití metody

• Zrychlení identifikace neznámých analytů v GC–MS laboratoři.
• Využití v rámci výuky pro demonstrační účely i samostatné cvičení studentů analytické chemie.
• Zavedení standardizovaného workflow pro propojení kreslicího softwaru a spektrálních knihoven.

Budoucí trendy a možnosti využití

• Další automatizace přenosu dat mezi kreslicími a vyhledávacími programy.
• Integrace s cloudovými platformami a online spektrálními databázemi.
• Podpora dalších formátů kreslení (např. InChI, SMILES) pro širší kompatibilitu a výměnu dat.

Závěr

Popisovaný postup propojení NIST MS Search a ACD/ChemSketch přináší efektivní a uživatelsky přívětivý způsob, jak převádět navržené chemické struktury do vyhledávacího programu pro rychlé porovnání spekter. Díky jednoduchému řešení běžných chyb je pracovní tok spolehlivý a snadno implementovatelný v akademických i průmyslových laboratořích.

Reference

Little J. Free NIST GC–MS Software Lab for Universities: Part 6: Structure Searches with Input from ChemSketch, August 29, 2023.