Solutions Rename filenames by folder names

Význam tématu

Automatizace přejmenování a konsolidace chromatografických dat ve formátu AIA (CDF) usnadňuje a zrychluje import dat z Agilent ChemStation do Clarity. Ruční přejmenovávání a přesun mnoha souborů je náchylné k chybám a zbytečně zatěžuje analytika.

Cíle a přehled studie / článku

Účelem předloženého řešení je nabídnout jednoduchý a univerzální návod k využití dávkového skriptu (rename-aia.bat) v kombinaci s nástrojem Bulk Rename Utility (BRC) pro:

• automatické přejmenování CDF souborů podle názvů rodičovských složek,
• sloučení všech přejmenovaných souborů do jednoho cílového adresáře,
• odstranění prázdných složek po přesunu.

Použitá metodika a instrumentace

Pro zpracování exportovaných .cdf souborů ze struktury vytvořené ChemStation se využívá:

• Agilent ChemStation pro export chromatogramů do AIA (*.cdf),
• Bulk Rename Utility – příkazová verze (BRC) pro hromadné přejmenování souborů,
• dávkový skript rename-aia.bat obsahující kroky pro detekci bitové verze OS, přejmenování, přesun a mazání složek.

Hlavní výsledky a diskuse

Skript provádí tyto klíčové operace:

1. Identifikace 32- či 64bitové verze Windows pro volbu odpovídajícího BRC nástroje.
2. Přejmenování jednotlivých .cdf souborů tak, aby název odpovídal chromatogramu (např. signal01.cdf → chromA_01.cdf).
3. Přesun všech upravených souborů do jednoho výstupního adresáře pro rychlý import do Clarity.
4. Odstranění prázdných vstupních složek, čímž se udržuje čistota pracovního adresáře.

Testování na demonstračních datech potvrdilo spolehlivé a rychlé fungování bez odborného zásahu během běhu skriptu.

Přínosy a praktické využití metody

Automatizované přejmenování a konsolidace AIA souborů přináší:

• úsporu času a minimalizaci chyb manuálního přejmenovávání,
• bezproblémový import do systému Clarity,
• jednoduchou úpravu skriptu pro vlastní cesty k adresářům nebo zakázání přesunu/smazání.

Budoucí trendy a možnosti využití

Další rozvoj tohoto přístupu může zahrnovat:

• integraci do širších pracovních toků LIMS,
• vytvoření grafického uživatelského rozhraní pro snazší konfiguraci,
• rozšíření o verifikaci integrity dat a kontrolu metadat před importem.

Závěr

Popsané řešení představuje rychlý a efektivní způsob přípravy AIA souborů pro import do Clarity. Využití dávkového skriptu s Bulk Rename Utility umožňuje standardizovat název a umístění chromatogramů, zvyšuje produktivitu laboratoře a snižuje riziko chyb.

Reference

DataApex. Solutions – Rename filenames by folder names. Application note, Code D145/EN03-20240314, 2024.