Comparison of Metabolites in Rice from Different Production Areas Using GC-MS/MS
Aplikace | 2025 | ShimadzuInstrumentace
Metabolomika potravin umožňuje komplexní profilaci nízkomolekulárních látek ovlivňujících chuť, vůni a nutriční vlastnosti. U rýže odrůdy Koshihikari z různých japonských regionů pomáhá odhalit vliv geografického původu na metabolický profil a podporuje vývoj vysoce kvalitních zemědělských produktů.
Cílem bylo simultánně kvantifikovat více než 500 metabolitů v šesti prefekturách Japonska a porovnat vzorky pomocí multivariační analýzy. Studie využila GC-MS/MS v režimu MRM a speciální databázi metabolitů pro efektivní zpracování dat a statistické vyhodnocení.
Vzorky rýže Koshihikari (8 typů, n=3) z prefektur Niigata, Toyama, Kagawa, Chiba, Shiga a Ibaraki byly mrazově drceny. Pro extrakci se aplikovala metoda Bligh & Dyer, následuje derivatizace pomocí methoxime-TMS. Interním standardem byl 2-isopropylmalát.
Detekováno bylo 65 klíčových látek, včetně cukrů, aminokyselin a mastných kyselin. Pomocí PCA bylo dosaženo 41,4 % celkové variance (PC1 22,0 %, PC2 19,4 %). Skóre grafy ukázaly jasné oddělení vzorků z Kagawa a Chiba podél PC1 a z Toyama a Niigata podél PC2. Na základě loading plotů byly identifikovány charakteristické sloučeniny: monosacharidy (glukóza, fruktóza) pro Kagawa, aminokyseliny (leucin, valin) pro Chiba, mastné kyseliny (oktanová, kaprová) pro Niigata a organické kyseliny (citronová, 2-amino-pimelová) pro Toyama.
Metoda umožňuje rychlou simultánní analýzu stovek metabolitů s vysokou selektivitou a citlivostí. Integrované workflow zjednodušuje přípravu vzorku, zpracování dat i vyhodnocení výsledků. Identifikace geografických markerů přispívá k zabezpečení kvality a autenticity potravin.
Očekává se rozšíření databází metabolitů, využití umělé inteligence pro automatizovanou analýzu a další integrace s genomikou a proteomikou. Potenciál mají též nasazení v kontrole kvality a trasovatelnosti potravin na globálním trhu.
Studie prokázala, že kombinace GC-MS/MS a multivariační analýzy efektivně odhalí rozdíly v metabolickém profilu rýže z různých regionů. Použité nástroje a postupy jsou vhodné pro široké aplikace v potravinářské kvalitě a výzkumu.
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ, Software
ZaměřeníMetabolomika, Potraviny a zemědělství
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Metabolomika potravin umožňuje komplexní profilaci nízkomolekulárních látek ovlivňujících chuť, vůni a nutriční vlastnosti. U rýže odrůdy Koshihikari z různých japonských regionů pomáhá odhalit vliv geografického původu na metabolický profil a podporuje vývoj vysoce kvalitních zemědělských produktů.
Cíle a přehled studie
Cílem bylo simultánně kvantifikovat více než 500 metabolitů v šesti prefekturách Japonska a porovnat vzorky pomocí multivariační analýzy. Studie využila GC-MS/MS v režimu MRM a speciální databázi metabolitů pro efektivní zpracování dat a statistické vyhodnocení.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky rýže Koshihikari (8 typů, n=3) z prefektur Niigata, Toyama, Kagawa, Chiba, Shiga a Ibaraki byly mrazově drceny. Pro extrakci se aplikovala metoda Bligh & Dyer, následuje derivatizace pomocí methoxime-TMS. Interním standardem byl 2-isopropylmalát.
- Chromatografie: GC-MS/MS (Shimadzu GCMS-TQ 8040 NX) s kapalinovým autoinjektorem AOC-30i/20s, kolona BPX-5 (30 m × 0,25 mm, 0,25 μm), režim Split 30:1.
- Podmínky GC: teplota injektoru 250 °C, odlučovací režim Split, nosný plyn He, lineární rychlost 39,0 cm/s, program teploty 60 °C (2 min) → 15 °C/min → 330 °C (3 min).
- Podmínky MS: zdroj iontů 200 °C, rozhraní 280 °C, režim měření MRM.
- Software: LabSolutions Insight pro zpracování dat, Smart Metabolites Database Ver.2 pro identifikaci a kvantifikaci, eMSTAT Solution pro statistickou analýzu (PCA, PLS-DA, diskriminace).
Hlavní výsledky a diskuse
Detekováno bylo 65 klíčových látek, včetně cukrů, aminokyselin a mastných kyselin. Pomocí PCA bylo dosaženo 41,4 % celkové variance (PC1 22,0 %, PC2 19,4 %). Skóre grafy ukázaly jasné oddělení vzorků z Kagawa a Chiba podél PC1 a z Toyama a Niigata podél PC2. Na základě loading plotů byly identifikovány charakteristické sloučeniny: monosacharidy (glukóza, fruktóza) pro Kagawa, aminokyseliny (leucin, valin) pro Chiba, mastné kyseliny (oktanová, kaprová) pro Niigata a organické kyseliny (citronová, 2-amino-pimelová) pro Toyama.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda umožňuje rychlou simultánní analýzu stovek metabolitů s vysokou selektivitou a citlivostí. Integrované workflow zjednodušuje přípravu vzorku, zpracování dat i vyhodnocení výsledků. Identifikace geografických markerů přispívá k zabezpečení kvality a autenticity potravin.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření databází metabolitů, využití umělé inteligence pro automatizovanou analýzu a další integrace s genomikou a proteomikou. Potenciál mají též nasazení v kontrole kvality a trasovatelnosti potravin na globálním trhu.
Závěr
Studie prokázala, že kombinace GC-MS/MS a multivariační analýzy efektivně odhalí rozdíly v metabolickém profilu rýže z různých regionů. Použité nástroje a postupy jsou vhodné pro široké aplikace v potravinářské kvalitě a výzkumu.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Multicomponent Analysis of Metabolites in Human Plasma using GC-MS/MS
2015|Shimadzu|Aplikace
LAAN-J-MS-E104 GC-MS Gas Chromatograph Mass Spectrometer Multicomponent Analysis of Metabolites in Human Plasma using GC-MS/MS 104 The analysis of metabolomes, such as when searching for disease biomarkers, is performed in many areas in the medical field, whether it be for…
Klíčová slova
tms, tmsacid, acidmeto, metovalproic, valproicisovalerylglycine, isovalerylglycinentms, ntmsdihydrouracil, dihydrouraciloctadecanol, octadecanolacetylglycine, acetylglycinecystamine, cystaminephenylacetic, phenylaceticoleamide, oleamideparaxanthine, paraxanthinemargaric, margaricglyoxylic
Analysis of Metabolites Extracted from Human Embryonic Stem Cells Using GC-MS
2015|Shimadzu|Aplikace
LAAN-J-MS-E103 GC-MS Gas Chromatograph Mass Spectrometer Analysis of Metabolites Extracted from Human Embryonic Stem Cells Using GC-MS 103 Metabolome analysis, a comprehensive analysis of the various metabolites generated as biological functions are maintained, is widely used in disease biomarker searches…
Klíčová slova
tms, tmsacid, acidembryonic, embryonicntms, ntmsoctadecanol, octadecanolcystamine, cystaminemeto, metomargaric, margaricmetabolites, metaboliteselaidic, elaidicpalmitoleic, palmitoleicniacinamide, niacinamidenonanoic, nonanoicarachidonic, arachidonichuman
Profiling of Japanese Green Tea Metabolites by GC-MS
2010|Shimadzu|Aplikace
IMD-N-036 Profiling of Japanese Green Tea Metabolites by GC-MS GC/MS Technical Report No.1 GC/MS Metabolomics & Life Science Project (Yuki Sakamoto, Katsuhiro Nakagawa, Shuichi Kawana, Novalina Lingga, Hui-Loo Lai Chin, Haruhiko Miyagawa) Tairo Ogura Abstract Metabolites from nine varieties of…
Klíčová slova
tea, tealeaves, leavesrankings, rankingstms, tmsranked, rankedmultivariate, multivariatecompetition, competitiongreen, greenmetabolites, metabolitesspectral, spectraljapanese, japaneseranking, rankingmethyloximation, methyloximationhad, hadtrimethylsilyl
Application for Plant Metabolome Analysis Using the GC/MS/MS Smart Metabolites Database
2016|Shimadzu|Aplikace
C146-E315 Application for Plant Metabolome Analysis Using the GC/MS/MS Smart Metabolites Database Technical Report Mami Okamoto1, Junko Takanobu1, Muneo Sato1, Satoshi Yamaki2, Yuji Sawada1, Masami Yokota Hirai1 A b s tra c t: The GC/MS/MS Smart Metabolites Database contains analytical…
Klíčová slova
tms, tmsacid, acidaric, aricsucci, succisucc, succnyl, nylmetabolites, metabolitesmrm, mrmsmart, smartpyruvic, pyruviccoa, coafumar, fumarisoci, isociociitric, ociitricogluttaric