TĚLNÍ TEKUTINY JAKO ZDROJ PROTEOMICKÝCH BIOMARKERŮ RŮZNÝCH ONEMOCNĚNÍ
Vědecké články | 2020 | Chemické listyInstrumentaceZaměření
Proteomické biomarkery z tělních tekutin představují šanci pro včasnou, neinvazivní a vysoce citlivou diagnostiku celé řady onemocnění. Odběrové tekutiny jako moč, sliny, slzy nebo kondenzát vydechovaného vzduchu umožňují sledovat molekulární změny v proximálních matricích, často s vyšší lokální koncentrací cílových proteinů než v krvi.
Článek systematicky popisuje možnosti využití různých tělních tekutin jako zdrojů proteomických biomarkerů mimo krevní plasmou. Autoři představují:
Hlavní metodou je hmotnostní spektrometrie (LC-MS/MS) s vysokým rozlišením. Pro přípravu vzorků se využívají koncentrační techniky (ultrafiltrace, lyofilizace a chromatografie na reverzní fázi), zpevňování proteinů na polymerních nosičích či digesce trypsinem. Ke kvantifikaci se uplatňují metody cílené proteomiky (SRM/MRM), jakož i imunoanalytické přístupy (ELISA).
Analýza jednotlivých tekutin odhalila:
Proteomická analýza tělních tekutin přináší:
Očekávají se:
Proteomika tělních tekutin mimo krev nabízí perspektivu vysoce specifických, citlivých a neinvazivních biomarkerů pro nejrůznější diagnózy. Klíčem k úspěchu je robustní validace, optimalizovaná příprava vzorků a úzká spolupráce mezi výzkumem a klinickou praxí.
Proteomika
VýrobceSouhrn
Význam tématu
Proteomické biomarkery z tělních tekutin představují šanci pro včasnou, neinvazivní a vysoce citlivou diagnostiku celé řady onemocnění. Odběrové tekutiny jako moč, sliny, slzy nebo kondenzát vydechovaného vzduchu umožňují sledovat molekulární změny v proximálních matricích, často s vyšší lokální koncentrací cílových proteinů než v krvi.
Cíle a přehled článku
Článek systematicky popisuje možnosti využití různých tělních tekutin jako zdrojů proteomických biomarkerů mimo krevní plasmou. Autoři představují:
- Výhody a limity nejběžnějších tekutin pro odběr biomarkerů
- Příklady konkrétních proteinových markerů pro jednotlivé tekutiny
- Nástroje a metody nezbytné pro jejich detekci
- Perspektivy jejich implementace do klinické praxe
Použitá metodika a instrumentace
Hlavní metodou je hmotnostní spektrometrie (LC-MS/MS) s vysokým rozlišením. Pro přípravu vzorků se využívají koncentrační techniky (ultrafiltrace, lyofilizace a chromatografie na reverzní fázi), zpevňování proteinů na polymerních nosičích či digesce trypsinem. Ke kvantifikaci se uplatňují metody cílené proteomiky (SRM/MRM), jakož i imunoanalytické přístupy (ELISA).
Hlavní výsledky a diskuse
Analýza jednotlivých tekutin odhalila:
- Moč: identifikaci proteinů spojených s onemocněním ledvin, močového měchýře i prostaty; v klinice již využívané markery NGAL, cystatin C, UBC, NMP22.
- Sliny: přes 3 000 proteinů s aplikací v diagnostice nádorů ústní dutiny či Sjögrenova syndromu; komerční senzory OFNASET a obdobné testy pro stanovení lokálních zánětů.
- Slzy: více než 1 000 proteinů, včetně markerů suchého oka a diabetické retinopatie; komerční testy InflammaDry a TearScan.
- Sputum a kondenzát vydechovaného vzduchu: náročná příprava, ale detekce biomarkerů chronické obstrukční plicní nemoci, astmatu a nádorů plic.
- Sperma a seminální plasma: rozdíly v proteinech energetického metabolismu; uplatnění ve vyšetření mužské plodnosti (SpermCheck).
- Cervikální hlen: proteomy odrážejí cyklické změny a patologie reprodukčního traktu (karcinom děložního čípku, endometrióza).
- Mozkomíšní mok: proteiny 14-3-3, S100β, beta-amyloid, tau proteiny, autoprotilátky; diagnostika neurodegenerativních a zánětlivých onemocnění CNS.
- Pankreatická šťáva a plodová voda: proteomické profily v nádorových onemocněních a riziku předčasného porodu.
Přínosy a praktické využití metody
Proteomická analýza tělních tekutin přináší:
- Neinvazivitu a komfort pro pacienta
- Možnost opakovaných odběrů pro dynamické sledování onemocnění
- Identifikaci lokálně koncentrovaných biomarkerů s vyšší citlivostí
- Rozšíření diagnostických panelů o kombinaci několika proteinů pro lepší specificitu
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekávají se:
- Další zlepšení citlivosti MS detekcí pro minoritní proteiny
- Integrace multi-omických přístupů (genomika, metabolomika)
- Vývoj automatizovaných odběrových systémů a miniaturizovaných senzorů
- Širší validace v rámci multicentrických studií a schválení regulačními autoritami
Závěr
Proteomika tělních tekutin mimo krev nabízí perspektivu vysoce specifických, citlivých a neinvazivních biomarkerů pro nejrůznější diagnózy. Klíčem k úspěchu je robustní validace, optimalizovaná příprava vzorků a úzká spolupráce mezi výzkumem a klinickou praxí.
Reference
- Freedland S. J., Sutter M. E., Dorey F., Aronson W. J.: Urology 61, 365 (2003).
- Azab S., Osama A., Rafaat M.: Transl. Androl. Urol. 1, 148 (2012).
- Zuo X., Zhang L., Luo H., Li Y., Zhu H.: Clin. Genet. 92, 365 (2017).
- Ortega M. A., Poirion O., Zhu X., Huang S., Wolfgruber T. K., Sebra R., Garmire L. X.: Clin. Transl. Med. 6, 46 (2017).
- Jimenez-Luna C., Torres C., Ortiz R., Dieguez C., Martinez-Galan J., Melguizo C., Prados J. C., Caba O.: Oncotarget 9, 16573 (2018).
- Tessitore A., Gaggiano A., Cicciarelli G., Verzella D., Capece D., Fischietti M., Zazzeroni F., Alesse E.: Int. J. Proteomics 2013, 125858.
- Pavone B. a dalších: J. Nephrol. 24, 453 (2011).
- Michelis R. a dalších: Nephrol. Dial. Transplant. 18, 924 (2003).
- Kang J. H. a dalších: Biochim. Biophys. Acta 1568, 30 (2001).
- Miller Y. I., Altamentova S. M., Shaklai N.: Biochemistry 36, 12189 (1997).
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Abstrakty přednášek v sekci Mládí vpřed a plakátových sdělení 24. ročníku Školy hmotnostní spektrometrie Editoři: Josef Cvačka, Vladimír Vrkoslav, Martin Hubálek, Mikuláš Vlk Milovy, 11. - 15. září 2023 © Spektroskopická společnost Jana Marka Marci, Brno 2023 ISBN: 978-80-88195-43-6 Mládí…
Klíčová slova
hmotnostní, hmotnostnípomocí, pomocípro, provyužitím, využitímstanovení, stanoveníanalýza, analýzapylových, pylovýchpacientů, pacientůzrn, zrnbyla, bylaznaček, značekonemocnění, onemocněnílaserové, laserovélátek, látektkáních
Abstrakty přednášek v sekci Mládí vpřed a plakátových sdělení (25. Škola MS)
2024|Thermo Fisher Scientific|PříručkyPosteryPrezentace
25. ročník Školy hmotnostní spektrometrie Abstrakty přednášek v sekci Mládí vpřed a plakátových sdělení Ondřej Novák, David Friedecký, René Lenobel, Ivan Petřík (editoři) Špindlerův Mlýn, 09. – 13. září 2024 LABORATOŘ RŮSTOVÝCH REGULÁTORŮ Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci &…
Klíčová slova
pro, promládí, mládípráce, prácerostlinných, rostlinnýchvpřed, vpředdbdi, dbdimetabolické, metabolickékapalinové, kapalinovépalackého, palackéhobuněčných, buněčnýchsdělení, sdělenínové, novétato, tatomultiomický, multiomickýuniverzity
HPST ChromAtoMol #3 - časopis nejen pro analytické laboratoře
2016|Agilent Technologies|Ostatní
1 ChromAtoMol časopis nejen pro analytické laboratoře » Účinná korekce pozadí ICP-OES spekter » ICP-MS/MS – analýza bez interferencí » miRNA microarrays ve studiu regulace genové exprese » Imunodeplece plodové vody » Spojení kapilární elektroforézy s hmotnostní spektrometrií » Přístroje…
Klíčová slova
pro, proicp, icpspecialista, specialistaanalýza, analýzainterferencí, interferencíjsou, jsounebo, neboprvků, prvkůmicroarray, microarraypři, přisystému, systémujako, jakozastoupených, zastoupenýchtak, taksystém
TECHNIKY METABOLOMIKY V BIOMEDICÍNĚ
2013||Vědecké články
Chem. Listy 107, 311 (2013) Referát TECHNIKY METABOLOMIKY V BIOMEDICÍNĚ PETR WOJTOWICZ, HANA JANEČKOVÁ, DAVID FRIEDECKÝ a TOMÁŠ ADAM mají na jeho genovou expresi malý vliv1. Jinými slovy lze s jistou nadsázkou říci, že genom říká, co by se v…
Klíčová slova
referát, referátpro, prometabolomických, metabolomickýchmetabolomika, metabolomikametabolomické, metabolomickénebo, nebolidských, lidskýchpak, pakčásti, částimetabolický, metabolickýmetabolomického, metabolomickéhometabolomiku, metabolomikupodnět, podnětmetabolomu, metabolomulidskou