Enhanced Metabolite Profiling: Hard and Soft Ionization High Resolution Time-of-Flight Mass Spectrometry
Aplikace | 2013 | LECOInstrumentace
Metabolomika představuje klíčový přístup k mapování malých molekul v biologických vzorcích. Kombinace vysokého rozlišení času letu a různých způsobů ionizace (tvrdé EI a měkké CI) zvyšuje citlivost, přesnost měření hmotnostních spektier a spolehlivost identifikace derivatizovaných metabolitů.
Studie se zaměřila na profilování metabolitů z extraktu jater myší pomocí GC-HRT-MS s cílem porovnat a zkombinovat výhody elektronové impaktní (EI) a chemické ionizace (CI) při identifikaci trimethylsilylových derivátů.
Vzorky byly připraveny dvoufázovou TMS derivatizací:
Analýzu prováděl LECO Pegasus GC-HRT s Agilent 7890A GC a 7693 autosamplerem. Použit sloupcem Rxi-5Sil MS (30 m × 0,25 mm × 0,25 µm), teplotní program 50 °C (1 min)→320 °C (5 min) při 20 °C/min, nosný plyn He 1,0 mL/min. EI při 70 eV, CI při 140 eV s 5 % NH3 v CH4, rozsah m/z 30–510 (EI), 50–650 (CI), rozlišení 25 000.
Analytický iontový chromatogram odhalil řadu TMS derivátů s knihovními podobnostmi 831–919 (z 1000) v EI. Vysoká hmotnostní přesnost (do 1 ppm) umožnila spolehlivé stanovení elementárních složení. Příklady:
Kombinace EI a CI na vysokém rozlišení zlepšuje detekci nízce zastoupených a labilních metabolitů, poskytuje přesná elementární složení a zvyšuje důvěryhodnost přidělených identit v biochemických drahách.
Očekává se širší aplikace HR-CI v nevelkých vzorcích, rozvoj databází s přesnými hmotnostmi, automatizované zpracování dat a integrace výsledků do metabolických modelů pro pokročilé biomarkerové studie.
GC-HRT-MS s kombinovanou EI a CI ionizací představuje výkonný nástroj pro komplexní metabolomické studie. Vysoká hmotnostní přesnost a doplňující informace z měkké ionizace významně zvyšují kvalitu identifikace.
GC/MSD, GC/HRMS, GC/TOF
ZaměřeníMetabolomika, Klinická analýza
VýrobceAgilent Technologies, LECO
Souhrn
Význam tématu
Metabolomika představuje klíčový přístup k mapování malých molekul v biologických vzorcích. Kombinace vysokého rozlišení času letu a různých způsobů ionizace (tvrdé EI a měkké CI) zvyšuje citlivost, přesnost měření hmotnostních spektier a spolehlivost identifikace derivatizovaných metabolitů.
Cíle a přehled studie
Studie se zaměřila na profilování metabolitů z extraktu jater myší pomocí GC-HRT-MS s cílem porovnat a zkombinovat výhody elektronové impaktní (EI) a chemické ionizace (CI) při identifikaci trimethylsilylových derivátů.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky byly připraveny dvoufázovou TMS derivatizací:
- Metoxymamine hydrochlorid v pyridinu (30 °C, 90 min),
- BSTFA se 1 % chlorotrimethylsilanu (37 °C, 30 min).
Analýzu prováděl LECO Pegasus GC-HRT s Agilent 7890A GC a 7693 autosamplerem. Použit sloupcem Rxi-5Sil MS (30 m × 0,25 mm × 0,25 µm), teplotní program 50 °C (1 min)→320 °C (5 min) při 20 °C/min, nosný plyn He 1,0 mL/min. EI při 70 eV, CI při 140 eV s 5 % NH3 v CH4, rozsah m/z 30–510 (EI), 50–650 (CI), rozlišení 25 000.
Hlavní výsledky a diskuse
Analytický iontový chromatogram odhalil řadu TMS derivátů s knihovními podobnostmi 831–919 (z 1000) v EI. Vysoká hmotnostní přesnost (do 1 ppm) umožnila spolehlivé stanovení elementárních složení. Příklady:
- 5-oxo-prolin: EI a CI spektra potvrdila molekulární ion; mass error 0,72 ppm.
- Cholesterol TMS: doplněné CI spektrum se pseudo-molekulárním iontem; mass error –0,29 ppm.
- 1,5-anhydroglukitol: v EI chybí molekulární ion, CI ukázala [M+H]+ při m/z 453,23334 (–1,1 ppm), čímž se odstranila nejednoznačnost.
Přínosy a praktické využití metody
Kombinace EI a CI na vysokém rozlišení zlepšuje detekci nízce zastoupených a labilních metabolitů, poskytuje přesná elementární složení a zvyšuje důvěryhodnost přidělených identit v biochemických drahách.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se širší aplikace HR-CI v nevelkých vzorcích, rozvoj databází s přesnými hmotnostmi, automatizované zpracování dat a integrace výsledků do metabolických modelů pro pokročilé biomarkerové studie.
Závěr
GC-HRT-MS s kombinovanou EI a CI ionizací představuje výkonný nástroj pro komplexní metabolomické studie. Vysoká hmotnostní přesnost a doplňující informace z měkké ionizace významně zvyšují kvalitu identifikace.
Reference
- Kind T. a kol. FiehnLib: Mass Spectral and Retention Index Libraries for Metabolomics Based on Quadrupole and Time-of-Flight GC/MS, Anal. Chem., 2009, 81, 100038–10048.
- Lisec J. a kol. Gas Chromatography Mass Spectrometry-Based Metabolite Profiling in Plants, Nature Protocols, 2006, 1(1), 387–396.
- Warren C.R. Use of Chemical Ionization for GC-MS Metabolite Profiling, Metabolomics, 2011, 1–11.
- Wang Y. a kol. A Study on the Association of Serum 1,5-Anhydroglucitol Levels and Hyperglycaemic Excursions as Measured by CGMS, Diabetes Metab. Res. Rev., 2012, 28(4), 357–362.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Improved Methodology for Metabolomics Data Acquisition Workflow: Utilization of Electron Impact and Chemical Ionization High Resolution Time-of-Flight Mass Spectrometry
2013|Agilent Technologies|Postery
Improved Methodology for Metabolomics Data Acquisition Workflow: Utilization of Electron Impact and Chemical Ionization High Resolution Time-of-Flight Mass Spectrometry David E. Alonso*, Joe Binkley, John Heim and Jeff Patrick | LECO Corporation, St. Joseph, Michigan USA Experimental 500 1000 1500…
Klíčová slova
hrt, hrtheight, heightcounts, countstms, tmsdata, datatrue, truenist, nistpegasus, pegasusformula, formulaacid, acidpeak, peakconfident, confidentosi, osiparameters, parametersconfirmation
Solutions for Metabolomics Analysis
2009|LECO|Brožury a specifikace
Solutions for Metabolomics Analysis EMPOWERING RESULTS The Established Leader in GC-MS Metabolomics Metabolomics presents challenges for both the analytical methods used and the data reduction required to interpret the results. No single analytical technique can be used for complete characterization…
Klíčová slova
identi, identigcxgc, gcxgcpegasus, pegasustofms, tofmsmetabolomics, metabolomicscon, concholesterol, cholesterolour, ourdeconvolution, deconvolutionleco, lecowhat, whatcation, cationdence, dencetms, tmsyour
Strategic Utilization of Gas Chromatography with Both Nominal and High Resolution Time-of-Flight Mass Spectrometers for Metabolomic Studies
2014|LECO|Postery
Strategic Utilization of Gas Chromatography with Both Nominal and High Resolution Time-of-Flight Mass Spectrometers for Metabolomic Studies David E. Alonso, Jeffrey S. Patrick, and Joe Binkley | LECO Corporation, St. Joseph, MI USA Results and Discussion – Instrumental Platforms Introduction…
Klíčová slova
tms, tmshrt, hrtpegasus, pegasusacid, acidpalmitoleic, palmitoleictemp, tempsimilarity, similaritycholesterol, cholesterolphenotype, phenotypearachidonic, arachidonicoctadecanoic, octadecanoicmass, massdiscovery, discoverymonosaccharides, monosaccharidesoleic
Electron Impact and Chemical Ionization High Resolution Time-of-Flight Mass Spectrometry Analyses of Blood Plasma Samples
2013|Agilent Technologies|Postery
Electron Impact and Chemical Ionization High Resolution Time-of-Flight Mass Spectrometry Analyses of Blood Plasma Samples David E. Alonso, Jeffrey S. Patrick, Joe Binkley, and John Heim | LECO Corporation, St. Joseph, MI USA 0.0e0 M/Z 800 AIC Fatty 1 900…
Klíčová slova
hrt, hrtheight, heightcounts, countshexatms, hexatmsobese, obesetms, tmslean, leanpegasus, pegasusfatty, fattyoxime, oximeaic, aiccholestadiene, cholestadienesinh, sinhgenedata, genedatadeconvolution