Efektivní využití databází EI hmotnostních spekter při identifikaci neznámých látek - část II: Vyhledávání struktur pomocí MS Search a použití MS Interpreteru

Knihovny hmotnostních spekter NIST, Wiley a uživatelské EI knihovny jsou velmi výkonnými nástroji pro identifikaci organických sloučenin ve složitých směsích pomocí plynové chromatografie s hmotnostní spektrometrií (GC-MS).  Tato série webinářů ukáže použití softwarové sady NIST včetně NIST Search, AMDIS a MS Interpreter pro prohledávání knihoven EI. Tato série by měla být užitečná pro širokou škálu vědců zabývajících se výzkumem a vývojem v lékařských, environmentálních, průmyslových, forenzních a biologických oborech.

Webináře předvádějí jak verzi 3.0 (2023), tak verzi V2.4 vyhledávání NIST. Pokud používáte verzi V3.0, začněte částí 0. Pokud používáte verzi V2.4, začněte částí I.

Dnes se podíváme na:

Část II: Vyhledávání struktur pomocí MS Search a použití MS Interpreteru

• Soubory nápovědy pro NIST Search
• Obecné příkazy/funkce systému Windows
• Primární knihovny EI spekter a přidružených struktur
• Výběr knihoven používaných pro vyhledávání přesných struktur
• Získání struktur z programu pro chemické kreslení
• Vyhledávání podobných struktur po vložení struktury do schránky
• Odeslání struktury z MS Search do kreslicího programu
• Tipy pro zobrazení výsledků vyhledávání struktur
• Tipy pro zobrazení příbuzných struktur při vyhledávání struktur
• Vyhledávání přesných struktur
• Použití porovnávacího okna pro zobrazení více spekter
• Zobrazení využitých možností vyhledávání struktur v seznamu shod/hitů
• MS interpret pro korelaci struktury se spektrem
• Fragmentují 3 izomery methylhydroxybenzoátu odlišně?
• Jakákoli struktura a související spektrum odeslány do MS Interpretru
• Přesné hmotnostní spektrum korelované se strukturou v MS Interpreteru
• Odkazy na webinář
• Poděkování

Podrobné materiály včetně tabulek jsou k dispozici v knihovně LabRulezGCMS library

Další díly této série jsou zaměřeny na:

• Část 0: Změny v programu EI NIST23 (V3.0) ( pouze video)
• Část I: Spektrální vyhledávání pomocí NIST MS Search
• Část II: Vyhledávání struktur pomocí MS Search a použití MS Interpreteru (tato část)
• Část III: AMDIS (NIST) pro zpracování souborů s EI hmotnostními spektry
• Část IV: Pokročilé hybridní vyhledávání EI a MS/MS spekter NIST
• Část V: Vytváření a sdílení uživatelských knihoven EI a MS/MS
• Část VI: Vytváření a používání retenčních indexů v softwaru NIST
• Část VII: Sledování komplexní koelace pomocí AMDIS a vyhledávání NIST

Videa ve vyšší kvalitě si můžete stáhnout zde:

• Higher Quality Video Part 0
• Higher Quality Videos Pt. I-V Zipped

Další zdroje webinářů:

• Test Files Used In Part VII for Tracking Coelution in Complex Mixtures with AMDIS and NIST
• New NIST23 Brochures and Purchasing
• NIST23 ASMS Presentation Houston, TX
• NIST 23 Separation Science Article by David Sparkman
• NIST and AMDIS User Manuals
• NIST Approach for Creating Libraries
• Databases Listed in Version 3.0 (2023)
• ACD Free Software (structure drawing program personal/academic use)
• Mass Spec Calculator Professional (free structure drawing program)
• Using with Manufacturers Data Processing Software
• Delta Mass Table (Excel Format)
• Delta Mass Table (PDF format)
• Hybrid Search/ChemSpider/SciFinder for Illicit Drug Identifications
• Importing Mass Spectra to NIST Search Program
• MS_Interpreter Correlating Structure to Spectrum
• NIST Tutorials and Settings for AMDIS
• Example Files for Part III AMDIS Webinar
• Example Spectra/Structures in Library Format Parts I-V
• Wiley Library User Manual with Spectral Source Codes
• Using with Manufacturers Data Processing Software
• Components in Free MONA Libraries
• MONA Library in EI format
• MONA and Other Free Libraries, 60,829 EI Spectra (see read_me in zip file)