Efektivní využití databází EI hmotnostních spekter při identifikaci neznámých látek - část IV: Pokročilé hybridní vyhledávání EI a MS/MS spekter NIST

Knihovny hmotnostních spekter NIST, Wiley a uživatelské EI knihovny jsou velmi výkonnými nástroji pro identifikaci organických sloučenin ve složitých směsích pomocí plynové chromatografie s hmotnostní spektrometrií (GC-MS).  Tato série webinářů ukáže použití softwarové sady NIST včetně NIST Search, AMDIS a MS Interpreter pro prohledávání knihoven EI. Tato série by měla být užitečná pro širokou škálu vědců zabývajících se výzkumem a vývojem v lékařských, environmentálních, průmyslových, forenzních a biologických oborech.

Webináře předvádějí jak verzi 3.0 (2023), tak verzi V2.4 vyhledávání NIST. Pokud používáte verzi V3.0, začněte částí 0. Pokud používáte verzi V2.4, začněte částí I.

Dnes se podíváme na:

Část IV: Pokročilé hybridní vyhledávání EI a MS/MS spekter NIST

• Soubory nápovědy pro NIST Search
• Obecné příkazy/funkce systému Windows
• Popis programu a mé osobní zkušenosti
• Hybridní generování skóre na základě fragmentů i neutrálních ztrát
• Nastavení indexů pro hybridní vyhledávání EI pro knihovny Wiley a uživatele
• Uložení konfigurace pro hybridní vyhledávání EI
• Výsledky hybridního vyhledávání pro neznámé látky
• Tip: Zobrazení běžných výsledků vyhledávání EI identity v seznamu hybridního vyhledávání
• „Mentální“ sloučení informací z hybridního a jednoduchého vyhledávání identit EI
• Bližší pohled na zobrazení hybridního vyhledávání
• Zobrazení výsledků hybridního vyhledávání s neutrální ztrátou
• Použití dostupných přesných údajů o hmotnosti pro podporu hybridního vyhledávání nominální hmotnosti
• Hybridní vyhledávání potřebuje ke správné funkci nominální MW
• Použití softwaru NIST k získání navrhované nominální MW
• Pohled na strukturu seznamu hitů Možnosti hybridního vyhledávání
• Tabulka DeltaMass
• Přiřazení některých jednoduchých struktur k hodnotám DeltaMass
• Další věci, které je třeba vzít v úvahu při použití hybridního vyhledávání pro identifikaci neznámého objektu
• NIST MSMS (tandemové) hybridní vyhledávání
• Další nabídky hybridního vyhledávání NIST MSMS (tandem)
• Knihovny Wiley MSMS (tandem)
• Odkazy na webový seminář
• Poděkování

Podrobné materiály včetně tabulek jsou k dispozici v knihovně LabRulezGCMS library

Další díly této série jsou zaměřeny na:

• Část 0: Změny v programu EI NIST23 (V3.0) ( pouze video)
• Část I: Spektrální vyhledávání pomocí NIST MS Search
• Část II: Vyhledávání struktur pomocí MS Search a použití MS Interpreteru
• Část III: AMDIS (NIST) pro zpracování souborů s EI hmotnostními spektry
• Část IV: Pokročilé hybridní vyhledávání EI a MS/MS spekter NIST (tato část)
• Část V: Vytváření a sdílení uživatelských knihoven EI a MS/MS
• Část VI: Vytváření a používání retenčních indexů v softwaru NIST
• Část VII: Sledování komplexní koelace pomocí AMDIS a vyhledávání NIST

Videa ve vyšší kvalitě si můžete stáhnout zde:

• Higher Quality Video Part 0
• Higher Quality Videos Pt. I-V Zipped

Další zdroje webinářů:

• Test Files Used In Part VII for Tracking Coelution in Complex Mixtures with AMDIS and NIST
• New NIST23 Brochures and Purchasing
• NIST23 ASMS Presentation Houston, TX
• NIST 23 Separation Science Article by David Sparkman
• NIST and AMDIS User Manuals
• NIST Approach for Creating Libraries
• Databases Listed in Version 3.0 (2023)
• ACD Free Software (structure drawing program personal/academic use)
• Mass Spec Calculator Professional (free structure drawing program)
• Using with Manufacturers Data Processing Software
• Delta Mass Table (Excel Format)
• Delta Mass Table (PDF format)
• Hybrid Search/ChemSpider/SciFinder for Illicit Drug Identifications
• Importing Mass Spectra to NIST Search Program
• MS_Interpreter Correlating Structure to Spectrum
• NIST Tutorials and Settings for AMDIS
• Example Files for Part III AMDIS Webinar
• Example Spectra/Structures in Library Format Parts I-V
• Wiley Library User Manual with Spectral Source Codes
• Using with Manufacturers Data Processing Software
• Components in Free MONA Libraries
• MONA Library in EI format
• MONA and Other Free Libraries, 60,829 EI Spectra (see read_me in zip file)