BIOCEV - Centrum molekulární struktury | LabRulez GCMS

BIOCEV - Centrum molekulární struktury

St, 30.9.2020
| Originální článek z: BioCeV/MBÚ
Centrum molekulární struktury (CMS) sdružuje několik laboratoří poskytujících komplexní přístup ke studiu prostorové struktury, funkce a biofyzikálních vlastností biologických molekul.
Video placeholder

BIOCEV: Centrum molekulární struktury - Biotechnologický ústav AV ČR

Společně s centrálními laboratořemi centra CEITEC je CMS sdruženo do České infrastruktury pro integrativní strukturní biologii (CIISB) - přidruženého národního centra Evropského strategického fóra pro výzkumné infrastruktury Instruct (ESFRI; European infrastructure for structural biology Instruct). Členové CIISB reprezentují českou strukturní biologii a Českou republiku jakožto jednu z ustavujících zemí konsorcia INSTRUCT.

CMS poskytuje expertízu, měření a asistenci v následujícíh oblastech:

  • krystalizace biologických molekul
  • monokrystalová rentgenová difrakce
  • řešení krystalových struktur
  • mikrokalorimetrické techniky pro sledování interakcí a stability (ITC, DSC)
  • stanovení parametrů interakcí makromolekulárních látek (SPR)
  • určovaní primární sekvence bílkovin na mikrogramové úrovni a uspořádáni disulfidových můstků (FTMS)
  • charakterizace posttranslačních modifikací
  • mapování terciární a kvartérní struktury

Výzkumní pracovníci, kteří se zasloužili o návrh a realizaci laboratoří CMS:

  • Biofyzikální techniky - Bohdan Schneider (BTÚ)
  • Krystalizace proteinů a nukleových kyselin a Difrakční techniky - Jan Dohnálek (BTÚ)
  • Jarmila Dušková (BTÚ)
  • Tomáš Kovaľ (BTÚ)
  • Karla Fejfarová (BTÚ)
  • Strukturní hmotnostní spektrometrie - Petr Novák (MBÚ)

Laboratoř Strukturní hmotnostní spektrometrie a Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace

Je multidisciplinárním týmem, jehož tematické zaměření je rozděleno do dvou hlavních směrů.

Strukturně biologická skupina produkuje proteiny pomocí rekombinantních expresních technologií a charakterizuje strukturu a dynamiku proteinů nebo komplexů proteinu s ligandem pomocí pokročilé hmotnostní spektrometrie.

Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace

Skupina buněčné signalizace zkoumá propojení buněčné signalizace na metabolismus rakovinných buněk za použití molekulárně-biologických a biochemických metod.

Skrze spolupráci obou skupin vzniká jedinečná výzkumná platforma, kde výsledky získané studiem biologických systémů mohou být ověřeny a vysvětleny na molekulární úrovni.

Vybavení laboratoře

BIOCEV - Vybavení laboratoře Strukturní hmotnostní spektrometrie

15T-SolariX XR FT-ICR mass spectrometer (Bruker Daltonics)

Bruker Daltonics 15T-Solarix XR FT-ICR mass spectrometer, with electrospray and MALDI ion sources. This ultra-high resolution mass spectrometer is used mostly for the determination of the precise mass of biological macromolecules, and the characterization of their posttranslational modifications. Further possibilities include peptide mass fingerprinting, detection of small molecule/metabolites, monitoring of protein structural changes and protein-protein interactions under physiological conditions by hydrogen-deuterium exchange, chemical cross-linking and covalent labelling.

Agilent Technologies 1200 HPLC system (usually coupled to the 15T-SolariX XR mass spectrometer) for the separation of complex peptide mixtures, proteins and metabolites.

This equipment allows to provide the following services:

  • Protein molecular weight determination by ultra-high resolution FT-ICR mass spectrometer with sequence confirmation by Top-down approach using different fragmentation techniques (collision induced dissociation, electron transfer/capture dissociation);
  • Peptide mass fingerprinting – identification of proteins from gel or solution including larger protein mixtures by using MALDI or ESI ;
  • Characterization of posttranslational modification such as phosphorylation, glycosylation or disulphide bonds;
  • Structural mass spectrometry: limited proteolysis, hydrogen/deuterium exchange, chemical cross-linking, covalent labelling;
  • HPLC separation of peptides, proteins and small molecules (metabolites) coupled with mass spectrometric detection by FT-ICR;
  • Processing and interpretation of mass spectrometric data.
MALDI-TOF (Bruker Daltonics)

Used for routine analysis of peptides and proteins.

Excimer laser (Coherent)

Used for Fast Photochemical Oxidation of Proteins (FPOP) - a type of hydroxyl-radical-based protein footprinting.

HPLC, UPLC (Agilent Technologies)

For the separation of complex peptide mixtures, proteins and metabolites.

BIOCEV
 

Mohlo by Vás zajímat

Accurate Mass Library for Natural Products Based on Compounds Identified in Hemp Oil Using High-Resolution GC/Q-TOF

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/HRMS, GC/Q-TOF
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Analysis of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons (PAH) in Palm Oil by GC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Determination of Polycyclic aromatic hydrocarbons in soils using the EXTREVA ASE Accelerated Solvent Extractor and GC-MS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
GC/MSD, Příprava vzorků, GC/SQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Životní prostředí

Comprehensive Evaluation of Scotch Whisky Aroma Profiles Using SPME-GCxGC-TOFMS

Aplikace
| 2022 | LECO
Instrumentace
GCxGC, GC/MSD, SPME, GC/TOF
Výrobce
LECO
Zaměření
Potraviny a zemědělství

NEMC: Increasing Sample Throughput in Ultra-trade Environmental Analysis with the TSQ-9610 GC- MS/MS

Prezentace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Článek | Nejbližší akce

Program konference Prague Meeting on Historical Perspectives of Mass Spectrometry

Konference se ve dnech 13. - 14. 10. zaměří na historii, aktuální stav a perspektivy hmotnostní spektrometrie v našem regionu a nabídne celkem 27 unikátních přednášek.
Článek | Nejbližší akce

Prague Meeting on Historical Perspectives of Mass Spectrometry - Den 2

Druhý den konference přinesl 17 špičkových přednášek a podívali jsme se na celou škálu možností a inovací v hmotnostní spektrometrii. Přidali se také mladí nadějní hmotnikáři a den zakončil praktický workshop.
Článek | Nejbližší akce

Konference CEEPC/IPM/CMSC 2022 (Den 2)

Druhý den společné konference o hmotnostní spektrometrii a proteomice v roce 2022 přinesl 17 přednášek, posterovou sekci a předání ceny Zdeňka Hermana.
 

Mohlo by Vás zajímat

Accurate Mass Library for Natural Products Based on Compounds Identified in Hemp Oil Using High-Resolution GC/Q-TOF

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/HRMS, GC/Q-TOF
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Analysis of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons (PAH) in Palm Oil by GC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Determination of Polycyclic aromatic hydrocarbons in soils using the EXTREVA ASE Accelerated Solvent Extractor and GC-MS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
GC/MSD, Příprava vzorků, GC/SQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Životní prostředí

Comprehensive Evaluation of Scotch Whisky Aroma Profiles Using SPME-GCxGC-TOFMS

Aplikace
| 2022 | LECO
Instrumentace
GCxGC, GC/MSD, SPME, GC/TOF
Výrobce
LECO
Zaměření
Potraviny a zemědělství

NEMC: Increasing Sample Throughput in Ultra-trade Environmental Analysis with the TSQ-9610 GC- MS/MS

Prezentace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Článek | Nejbližší akce

Program konference Prague Meeting on Historical Perspectives of Mass Spectrometry

Konference se ve dnech 13. - 14. 10. zaměří na historii, aktuální stav a perspektivy hmotnostní spektrometrie v našem regionu a nabídne celkem 27 unikátních přednášek.
Článek | Nejbližší akce

Prague Meeting on Historical Perspectives of Mass Spectrometry - Den 2

Druhý den konference přinesl 17 špičkových přednášek a podívali jsme se na celou škálu možností a inovací v hmotnostní spektrometrii. Přidali se také mladí nadějní hmotnikáři a den zakončil praktický workshop.
Článek | Nejbližší akce

Konference CEEPC/IPM/CMSC 2022 (Den 2)

Druhý den společné konference o hmotnostní spektrometrii a proteomice v roce 2022 přinesl 17 přednášek, posterovou sekci a předání ceny Zdeňka Hermana.
 

Mohlo by Vás zajímat

Accurate Mass Library for Natural Products Based on Compounds Identified in Hemp Oil Using High-Resolution GC/Q-TOF

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/HRMS, GC/Q-TOF
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Analysis of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons (PAH) in Palm Oil by GC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Determination of Polycyclic aromatic hydrocarbons in soils using the EXTREVA ASE Accelerated Solvent Extractor and GC-MS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
GC/MSD, Příprava vzorků, GC/SQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Životní prostředí

Comprehensive Evaluation of Scotch Whisky Aroma Profiles Using SPME-GCxGC-TOFMS

Aplikace
| 2022 | LECO
Instrumentace
GCxGC, GC/MSD, SPME, GC/TOF
Výrobce
LECO
Zaměření
Potraviny a zemědělství

NEMC: Increasing Sample Throughput in Ultra-trade Environmental Analysis with the TSQ-9610 GC- MS/MS

Prezentace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Článek | Nejbližší akce

Program konference Prague Meeting on Historical Perspectives of Mass Spectrometry

Konference se ve dnech 13. - 14. 10. zaměří na historii, aktuální stav a perspektivy hmotnostní spektrometrie v našem regionu a nabídne celkem 27 unikátních přednášek.
Článek | Nejbližší akce

Prague Meeting on Historical Perspectives of Mass Spectrometry - Den 2

Druhý den konference přinesl 17 špičkových přednášek a podívali jsme se na celou škálu možností a inovací v hmotnostní spektrometrii. Přidali se také mladí nadějní hmotnikáři a den zakončil praktický workshop.
Článek | Nejbližší akce

Konference CEEPC/IPM/CMSC 2022 (Den 2)

Druhý den společné konference o hmotnostní spektrometrii a proteomice v roce 2022 přinesl 17 přednášek, posterovou sekci a předání ceny Zdeňka Hermana.
 

Mohlo by Vás zajímat

Accurate Mass Library for Natural Products Based on Compounds Identified in Hemp Oil Using High-Resolution GC/Q-TOF

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/HRMS, GC/Q-TOF
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Analysis of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons (PAH) in Palm Oil by GC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Determination of Polycyclic aromatic hydrocarbons in soils using the EXTREVA ASE Accelerated Solvent Extractor and GC-MS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
GC/MSD, Příprava vzorků, GC/SQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Životní prostředí

Comprehensive Evaluation of Scotch Whisky Aroma Profiles Using SPME-GCxGC-TOFMS

Aplikace
| 2022 | LECO
Instrumentace
GCxGC, GC/MSD, SPME, GC/TOF
Výrobce
LECO
Zaměření
Potraviny a zemědělství

NEMC: Increasing Sample Throughput in Ultra-trade Environmental Analysis with the TSQ-9610 GC- MS/MS

Prezentace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Článek | Nejbližší akce

Program konference Prague Meeting on Historical Perspectives of Mass Spectrometry

Konference se ve dnech 13. - 14. 10. zaměří na historii, aktuální stav a perspektivy hmotnostní spektrometrie v našem regionu a nabídne celkem 27 unikátních přednášek.
Článek | Nejbližší akce

Prague Meeting on Historical Perspectives of Mass Spectrometry - Den 2

Druhý den konference přinesl 17 špičkových přednášek a podívali jsme se na celou škálu možností a inovací v hmotnostní spektrometrii. Přidali se také mladí nadějní hmotnikáři a den zakončil praktický workshop.
Článek | Nejbližší akce

Konference CEEPC/IPM/CMSC 2022 (Den 2)

Druhý den společné konference o hmotnostní spektrometrii a proteomice v roce 2022 přinesl 17 přednášek, posterovou sekci a předání ceny Zdeňka Hermana.
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.