Wiley Spectral Webinar Part IV: Advanced NIST Hybrid Search of EI and MS/MS Spectra
Prezentace | 2020 | James Little/Mass Spec Interpretation ServicesInstrumentace
Hybridní vyhledávání v masových spektrech přináší významné vylepšení identifikace neznámých sloučenin, které se liší pouze drobnými strukturálními modifikacemi. Kombinací porovnání fragmentačních iontů a spekter neutrálních ztrát získáme širší záběr potenciálních kandidátů, což zvyšuje šance na úspěšné určení analytického vzorku.
Prezentace se zaměřuje na pokročilé použití hybridního vyhledávání v NIST MS Search softwaru pro EI a MS/MS spektra. Hlavními body jsou nastavení parametrů, indexace knihoven (Wiley i uživatelských), příklad identifikace neznámé látky, porovnání s běžným EI vyhledáváním, představení tabulky DeltaMass a nástin postupů pro hybridní MS/MS vyhledávání.
Pro hybridní vyhledávání byly využity tyto nástroje:
Konfigurace zahrnovala zapnutí hybridního režimu, nastavení zobrazení sloupce DeltaMass a indexaci knihoven pro podporu spektrálních i strukturálních hledání.
Hybridní vyhledávání významně zlepšuje skóre shody, zejména při modifikacích jako výměna atomů (např. F za H, DeltaMass 18). Na příkladu benzylových derivátů bylo prokázáno, že hybridní režim odhalí podobné struktury, které standardní identitační vyhledávání přehlédne. Zobrazení neutrálních ztrát a zvýraznění posunů v middle display rychleji ukazuje klíčové fragmenty.
Hybridní vyhledávání umožňuje:
Další rozvoj bude směřovat k integraci vysoce přesných hmotnostních dat, rozšíření hybridních MS/MS knihoven a využití strojového učení pro predikci DeltaMass hodnot. Spolupráce s experty na organickou chemii a doplňkové techniky (NMR, IR) zvýší spolehlivost výsledků.
Hybridní vyhledávání v NIST MS Search je silný nástroj pro analytickou chemii, který kombinuje fragmentační i neutrální informace a rozšiřuje možnosti identifikace neznámých sloučenin. Úspěch vyžaduje správnou konfiguraci software, kvalitní spektrální knihovny a doplňkové informační zdroje.
Software
ZaměřeníVýrobceWiley
Souhrn
Význam tématu
Hybridní vyhledávání v masových spektrech přináší významné vylepšení identifikace neznámých sloučenin, které se liší pouze drobnými strukturálními modifikacemi. Kombinací porovnání fragmentačních iontů a spekter neutrálních ztrát získáme širší záběr potenciálních kandidátů, což zvyšuje šance na úspěšné určení analytického vzorku.
Cíle a přehled studie
Prezentace se zaměřuje na pokročilé použití hybridního vyhledávání v NIST MS Search softwaru pro EI a MS/MS spektra. Hlavními body jsou nastavení parametrů, indexace knihoven (Wiley i uživatelských), příklad identifikace neznámé látky, porovnání s běžným EI vyhledáváním, představení tabulky DeltaMass a nástin postupů pro hybridní MS/MS vyhledávání.
Použitá metodika a instrumentace
Pro hybridní vyhledávání byly využity tyto nástroje:
- NIST MS Search (verze 2.3) pro EI i MS/MS spektra
- AMDIS pro zpracování EI dat
- MS Interpreter pro modelování fragmentací
- Síťované EI GC–MS a LC–MS/MS systémy
- Řízené chemické ionizace a accurate mass měření pro určení molekulové hmotnosti
Konfigurace zahrnovala zapnutí hybridního režimu, nastavení zobrazení sloupce DeltaMass a indexaci knihoven pro podporu spektrálních i strukturálních hledání.
Hlavní výsledky a diskuse
Hybridní vyhledávání významně zlepšuje skóre shody, zejména při modifikacích jako výměna atomů (např. F za H, DeltaMass 18). Na příkladu benzylových derivátů bylo prokázáno, že hybridní režim odhalí podobné struktury, které standardní identitační vyhledávání přehlédne. Zobrazení neutrálních ztrát a zvýraznění posunů v middle display rychleji ukazuje klíčové fragmenty.
Přínosy a praktické využití metody
Hybridní vyhledávání umožňuje:
- Identifikaci sloučenin chybějících v knihovnách
- Podporu návrhu mechanismů fragmentace
- Zrychlení práce v QA/QC a forenzní analýze
- Objevení strukturálně podobných modelových sloučenin
Budoucí trendy a možnosti využití
Další rozvoj bude směřovat k integraci vysoce přesných hmotnostních dat, rozšíření hybridních MS/MS knihoven a využití strojového učení pro predikci DeltaMass hodnot. Spolupráce s experty na organickou chemii a doplňkové techniky (NMR, IR) zvýší spolehlivost výsledků.
Závěr
Hybridní vyhledávání v NIST MS Search je silný nástroj pro analytickou chemii, který kombinuje fragmentační i neutrální informace a rozšiřuje možnosti identifikace neznámých sloučenin. Úspěch vyžaduje správnou konfiguraci software, kvalitní spektrální knihovny a doplňkové informační zdroje.
Reference
- James Little: Advanced NIST Hybrid Search of EI and MS/MS Spectra, Wiley Webinar Series (2020)
- NIST MS Search Software Manual
- AMDIS User Guide
- MS Interpreter Documentation
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Wiley Spectral Webinar Part II: Structure Searches with NIST MS Search and Using MS Interpreter
2020|Wiley|Prezentace
Wiley Spectral Webinar Part II: Structure Searches with NIST MS Search and Using MS Interprete 12/27/20 James Little [email protected] https://littlemsandsailing.wordpress.com/ Kingsport, TN Retired* Research Fellow, Eastman Chem. Co. 42 years experience unknown identification Now Consultant, MS Interpretation Services Specialties1 EI…
Klíčová slova
search, searchstructure, structurelmb, lmbinterpreter, interpreterwindow, windowcompare, comparelibraries, librariesselect, selectspectrum, spectrumnist, nistrmb, rmbtab, taboptions, optionsclipboard, clipboardprogram
Wiley Spectral Webinar Part I: Spectral Searches with NIST MS Search
2020|Wiley|Prezentace
Wiley Spectral Webinar Part I: Spectral Searches with NIST MS Searc 12/27/20 James Little [email protected] https://littlemsandsailing.wordpress.com/ Kingsport, TN Retired* Research Fellow, Eastman Chem. Co. 42 years experience unknown identification Now Consultant, MS Interpretation Services Specialties1 EI GC-MS, LC-MS/MS, Chemical Ionization,7…
Klíčová slova
search, searchlmb, lmbnist, nistlibraries, librariestour, tourpresearch, presearchwindow, windowcontinued, continuedtab, tabwindows, windowsstructure, structureprogram, programspectrum, spectrumhit, hitlibrary
Wiley Spectral Webinar Part V: Creating and Sharing User EI and MS/MS Libraries
2020|Wiley|Prezentace
Wiley Spectral Webinar Part V: Creating and Sharing User EI and MS/MS Libraries 12/27/20 James Little [email protected] https://littlemsandsailing.wordpress.com/ Kingsport, TN Retired* Research Fellow, Eastman Chem. Co. 42 years experience unknown identification Now Consultant, MS Interpretation Services Specialties1 EI GC-MS, LC-MS/MS,…
Klíčová slova
lmb, lmblibrary, librarynist, nistspectrum, spectrumsearch, searchuser, userentries, entriesprogram, programlibraries, librarieswindow, windowkeyboard, keyboardcomments, commentstags, tagswiley, wileyadded
Identification of Unknowns by GC-MS and LC-MS Using NIST Search with Commercial and User Libraries
2021|Wiley|Prezentace
Identification of Unknowns by GC-MS and LC-MS Using NIST Search with Commercial and User Libraries James Little Research Fellow, Eastman Chemical Company (41 years) Consultant, Mass Spectral Interpretation Services (4 years) [email protected] https://littlemsandsailing.wordpress.com/ Kingsport, TN ACS Conference, April 8, 2021…
Klíčová slova
eastman, eastmannist, nisthybrid, hybridsearch, searchhandout, handoutlibraries, librariesinterpreter, interpreterspectrum, spectrumcommercial, commercialcorrelating, correlatingunknown, unknownlibrary, librarycontractor, contractorentries, entriescorporate