Interchanging Structures Between KnowItAll and NIST Search and Basics on Using MS Interpreter

Význam tématu

Uplatnění hmotnostní spektrometrie často vyžaduje rychlou a spolehlivou výměnu struktur mezi analytickými nástroji. Integrace programů NIST Search a KnowItAll ChemWindow zajišťuje efektivní přenos molekulárních vzorců do grafických editorů a následnou interpretaci fragmentace. Tím se zkracuje doba analýzy a minimalizuje riziko chyb při manuálním přepisování.

Cíle a přehled studie

Článek prezentuje tři metody pro přenos struktur mezi NIST Search a ChemWindow: využití schránky, úpravu výchozí asociace souborů .mol v systému Windows a konfiguraci souboru autoimp.str. Dále ukazuje obousměrný přenos struktur a aplikaci NIST MS Interpreter k analýze EI fragmentace.

Použitá metodika a instrumentace

• NIST Search 20 pro akvizici a prohlížení masových spekter.
• KnowItAll ChemWindow pro kreslení, editaci a ukládání chemických struktur.
• NIST MS Interpreter pro vyhodnocení a vizualizaci fragmentačních mechanismů v EI spektru.
• Operační systém Microsoft Windows pro konfiguraci asociace souborů .mol a spouštění externích programů.

Hlavní výsledky a diskuse

• Popis tří uživatelsky přívětivých metod přenosu: Copy Structure to Clipboard + Paste Special, změna výchozí aplikace pro .mol soubory a úprava autoimp.str.
• Možnost zpětného přenosu struktur z ChemWindow do NIST Search s doporučením pro kresbu aromatických kruhů.
• Integrace struktury a spektra v MS Interpreter umožňuje barevné označení vysvětlených fragmentů a identifikaci nevysvětlených iontů.
• Rozpoznány limity: import více objektů současně a nesprávná interpretace aromatiky při použití kruhového symbolu.

Přínosy a praktické využití metody

Efektivní výměna dat mezi programy zrychluje pracovní postupy v laboratoři, snižuje manuální chyby a zlepšuje kvalitu interpretace masových spekter. Spojení s MS Interpreter přináší hlubší náhled do fragmentačních cest a usnadňuje publikaci i reportování výsledků.

Budoucí trendy a možnosti využití

• Automatizace přenosu dat pomocí skriptů, API a rozhraní command‐line.
• Rozšíření kompatibility na další kreslicí programy a databázové systémy.
• Využití strojového učení pro predikci fragmentačních vzorců a přiřazení iontů.
• Nasazení cloudových platforem pro sdílenou analýzu, centralizované ukládání a kolaborativní workflow.

Závěr

Popisované metody nabízejí jednoduché a flexibilní způsoby propojení NIST Search a KnowItAll ChemWindow a integraci s NIST MS Interpreter. Implementace těchto postupů přispívá k rychlejší a přesnější analýze hmotnostních spekter a podporuje pokročilé výzkumné i průmyslové aplikace.

Reference

• Little J. Mass Spec Interpretation Services: Handouts for Videos. 2022.
• Little J. Little Mass Spec and Sailing [online]. 2022.
• NIST MSSEARCH User Manual, kapitola 68. 2020.