Improving Confidence in Compound Identification Using Agilent Curated Databases and Libraries

Význam tématu

Identifikace cílových a neznámých sloučenin s vysokou důvěrou je zásadní pro laboratorní praxi v potravinářství, životním prostředí, farmaceutickém výzkumu a forenzním toxikologickém vyšetřování. Kvalitní databáze a referenční knihovny s autentickými, manuálně validovanými záznamy a spektry minimalizují falešné nálezy a zrychlují analýzu.

Cíle a přehled studie článku

White Paper popisuje komplexní proces tvorby a správy Agilent Accurate Mass Personal Compound Databases and Libraries PCDL. Dokument vysvětluje výběr sloučenin, sběr a kůraci záznamů o sloučeninách, akvizici přesných hmotnostních spekter a finální vizuální kvalifikaci knihoven.

Použitá metodika a instrumentace

Analýza a kůrace spekter probíhá podle přísných standardních operačních postupů SOP

• LC/Q-TOF a IM-Q-TOF MS s ESI pro LC/MS/MS spektra ve třech kolizních energiích
• GC/Q-TOF MS v módu EI pro GC/MS spektra s bohatou fragmentací a izotopickým rozložením
• Kalibrace a ladění MS přístrojů a pravidelné kontroly kvality pomocí standardů nejvyšší čistoty
• Softwarové nástroje Agilent MassHunter Qualitative Analysis, PCDL Manager, Pathways to PCDL, Mass Profiler a další

Hlavní výsledky a diskuse

Agilent vyvinul čtyřstupňový proces tvorby PCDL knihoven

1. Spolupráce s oborovými experty na výběr relevantních sloučenin
2. Manuální ověření chemických identifikátorů, synonym, vzorců a CAS reg. čísel z důvěryhodných zdrojů
3. Akvizice přesných hmotnostních spekter za různých podmínek (polarity, energie, addukty, IM CCS)
4. Automatizovaná a ruční kůrace spekter s kontrolou shody fragmentních vzorců, odfiltrováním šumu a impurit

Výsledkem jsou vysoce kvalitní databázové položky, obsahující strukturu, RTs, fragmentní spektra, izotopické informace a případně kolizní průřezy.

Přínosy a praktické využití metody

PCDL knihovny poskytují až čtyři úrovně potvrzení identifikace sloučenin: přesná hmotnost, izotopické rozložení, fragmentační spektrum a retenční čas, s možností přidání kolizního průřezu. Knihovny jsou plně přizpůsobitelné a podporují retrospective data mining, cílené workflow pro potraviny, životní prostředí, forenzní toxikologii nebo metabolomiku.

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekává se rozšíření databází o nové sloučeniny, vylepšení automatizované kůrace s využitím strojového učení, začlenění dalších dimenzí separace a rozvoj integrovaných workflow pro komplexní screening a metabolické dráhy.

Závěr

Pečlivá curation a validace referenčních dat značně zvyšují spolehlivost a konzistenci výsledků analytických metod založených na hmotnostní spektrometrii. Agilent PCDL knihovny nabízejí uživatelům robustní a přizpůsobitelnou platformu pro rychlou a přesnou identifikaci sloučenin.