ZÁKLADY INTERPRETACE HMOTNOSTNÍCH SPEKTER
Vědecké články | 2020 | Chemické listyInstrumentace
Massová spektrometrie je klíčová pro identifikaci a strukturální analýzu organických sloučenin, biopolymerů a přírodních produktů. Umožňuje rychlé stanovení molekulové hmotnosti, sumárního vzorce a fragmentačních vzorců, což je nezbytné ve farmacii, metabolomice, environmentální chemii či průmyslové kvalitativní kontrole.
Cílem referátu autorů Škultétyho, Nováka a Havlíčka je představit základy interpretace hmotnostních spekter s důrazem na elektronegativní ionizaci (EI), soft ionizační techniky a produktová spektra biopolymerů. Studie shrnuje fragmentační mechanismy, pravidla pro odštěpování iontů, interpretaci izotopových obálek a metodologii de novo sekvenování.
Hmotnostní spektrometrie usnadňuje rychlou identifikaci neznámých organických sloučenin, analýzu přírodních produktů, strukturální charakterizaci peptidů a dalších biopolymerů. Metoda je využívána v toxikologii, farmaceutickém výzkumu, kvalitativní kontrole potravin, metabolomice a environmentálních studiích.
Přehled základních principů interpretace hmotnostních spekter poskytuje komplexní návod pro kvalitativní a kvantitativní analýzu malých molekul i biopolymerů. Kombinace klasických fragmentačních pravidel, přesného měření hmotnosti, izotopových profilů a bioinformatických nástrojů umožňuje efektivní strukturální elucidaci.
GC/MSD, LC/MS
ZaměřeníVýrobceSouhrn
Význam tématu
Massová spektrometrie je klíčová pro identifikaci a strukturální analýzu organických sloučenin, biopolymerů a přírodních produktů. Umožňuje rychlé stanovení molekulové hmotnosti, sumárního vzorce a fragmentačních vzorců, což je nezbytné ve farmacii, metabolomice, environmentální chemii či průmyslové kvalitativní kontrole.
Cíle a přehled studie
Cílem referátu autorů Škultétyho, Nováka a Havlíčka je představit základy interpretace hmotnostních spekter s důrazem na elektronegativní ionizaci (EI), soft ionizační techniky a produktová spektra biopolymerů. Studie shrnuje fragmentační mechanismy, pravidla pro odštěpování iontů, interpretaci izotopových obálek a metodologii de novo sekvenování.
Použitá metodika a instrumentace
- Elektronová ionizace (EI) pro nízkomolekulární stabilní organické látky.
- Soft ionizační techniky: MALDI, ESI, fotoionizace.
- FT-ICR MS s metodami SORI-CID a IRMPD.
- Dissociační techniky pro biopolymery: CID, ECD, ETD.
- Verifikace struktur pomocí NMR, rentgenové krystalografie a kvantově-chemických výpočtů.
Hlavní výsledky a diskuse
- Fragmentační mechanismy: sigma, alfa a beta štěpení, McLaffertyho přesmyk, retro-Diels–Alder, orthoefekty.
- Dusíkové pravidlo a odd/even electron rule pro určení sudého či lichého počtu elektronů.
- Interpretace izotopových obálek a jemná izotopová struktura pro stanovení sumárního vzorce.
- Metoda per analogiam pro rychlou charakterizaci látek do 2000 Da.
- De novo sekvenování biopolymerů na základě b/y iontů, imoniových fragmentů a derivatizačních modifikací.
- Bioinformatické nástroje a databáze: MassBank, ReSpect, GNPS, NIST, CycloBranch a in silico predikce fragmentace.
Přínosy a praktické využití metody
Hmotnostní spektrometrie usnadňuje rychlou identifikaci neznámých organických sloučenin, analýzu přírodních produktů, strukturální charakterizaci peptidů a dalších biopolymerů. Metoda je využívána v toxikologii, farmaceutickém výzkumu, kvalitativní kontrole potravin, metabolomice a environmentálních studiích.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Další rozvoj vysoce rozlišující MS pro jemnou izotopovou strukturu.
- Integrace MS s umělou inteligencí a strojovým učením pro automatickou interpretaci spekter.
- Rozšíření molecular networking a in silico fragmentačních databází.
- Propojení s pokročilými strukturními technikami (NMR, krystalografie) a kvantově-chemickými metodami.
Závěr
Přehled základních principů interpretace hmotnostních spekter poskytuje komplexní návod pro kvalitativní a kvantitativní analýzu malých molekul i biopolymerů. Kombinace klasických fragmentačních pravidel, přesného měření hmotnosti, izotopových profilů a bioinformatických nástrojů umožňuje efektivní strukturální elucidaci.
Reference
- Hamming M. C., Foster N. G.: Interpretation of Mass Spectra of Organic Compounds, Academic Press, New York 1972.
- Zinkevich I. G., Ioffe B. V.: Interpretation of Mass Spectra of Organic Compounds, Leningradskoe Otdelenie, Leningrad 1986.
- McLafferty F. W., Turecek F.: Interpretation of Mass Spectra, University Science Books, Mill Valley 1993.
- McLafferty F. W.: Org. Mass Spectrom. 15, 114 (1980).
- Tureček F., Hanus V.: Mass Spectrometry Reviews 3, 85 (1984).
- Nibbering N. M. M.: J. Am. Soc. Mass Spectrom. 15, 956 (2004).
- Schwarz H.: Topics in Current Chemistry, Vol. 73, Springer, Berlin 1978.
- Splitter J. S., Turecek F.: Applications of Mass Spectrometry to Organic Sterochemistry, Wiley, NJ, USA 1995.
- Tureček F.: Collect. Czech. Chem. Commun. 52, 1928 (1987).
- Beavis R. C.: Anal. Chem. 65, 496 (1993).
- Holčapek M., Jirásko R., Lísa M.: J. Chromatogr. A 1217, 3908 (2010).
- Chu I. K. et al.: Int. J. Mass Spectrom. 390, 24 (2015).
- Grimme S.: J. Chem. Theory Comp. 15, 2847 (2019).
- Domon B., Costello C. E.: Glycoconj. J. 5, 397 (1988).
- Kind T., Fiehn O.: BMC Bioinf. 8, 20 (2007).
- Horai H. et al.: J. Mass Spectrom. 45, 703 (2010).
- Sawada Y. et al.: Phytochemistry 82, 38 (2012).
- Bouslimani A., Sanchez L. M., Garg N., Dorrestein P. C.: Nat. Prod. Rep. 31, 718 (2014).
- Huan T. et al.: Anal. Chem. 87, 10619 (2015).
- Allard P.-M. et al.: Anal. Chem. 88, 3317 (2016).
- Novák J., Lemr K., Schug K. A., Havlíček V.: J. Am. Soc. Mass Spectrom. 26, 1780 (2015).
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
ŘEŠENÉ PŘÍKLADY INTERPRETACE PRODUKTOVÝCH SPEKTER PEPTIDŮ
2020||Vědecké články
Chem. Listy 114, 200−208 (2020) Referát ŘEŠENÉ PŘÍKLADY INTERPRETACE PRODUKTOVÝCH SPEKTER PEPTIDŮ tidů2. Spektrum neznámého lineárního peptidu, jehož sekvence je řešena v kap. 2, bylo naměřeno s nízkým rozlišením. Ostatní příklady pak zahrnují hmotnostní spektra s vysokým rozlišením. Profil kolizního…
Klíčová slova
peptid, peptidcyklického, cyklickéhopeptidu, peptidureferát, referátpeptidů, peptidůřetězcem, řetězcemcyklický, cyklickýneribozomálních, neribozomálníchpostranním, postrannímlineárního, lineárníhosekvencí, sekvencípíky, píkydatabáze, databázelineární, lineárnípřípadě
ÚVOD DO TANDEMOVÉ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE
2020||Vědecké články
Chem. Listy 114, 133−144 (2020) Referát ÚVOD DO TANDEMOVÉ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE Martin Sadílek 1. Úvod a definice University of Washington, Seattle, WA 98195-1700, Spojené státy americké [email protected] Lidová moudrost, že „ve dvou se to lépe táhne“, platí i v oblasti…
Klíčová slova
iontů, iontůhmotnostní, hmotnostníaktivaci, aktivacireferát, referátths, thselektronu, elektronupro, prodisociace, disociaceenergie, energienízký, nízkýaktivace, aktivaceprostoru, prostoruenergií, energiíhmotnostních, hmotnostníchrozpady
HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE NÁMELOVÝCH ALKALOIDŮ
1998||Vědecké články
Chem. Listy 92, 538 - 547 (1998) HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE NÁMELOVÝCH ALKALOIDŮ 1. Uvod PETR HALADA3, ALEXANDR JEGOROV b , MIROSLAV RYSKAC a VLADIMÍR HAVLÍČEK 3 Námelové alkaloidy představují skupinu přírodních látek se širokým spektrem biologických aktivit podmíněných interakcí s různými…
Klíčová slova
alkaloidy, alkaloidyalkaloidů, alkaloidůnámelové, námelovénámelových, námelovýchspektrech, spektrechpři, přiionizací, ionizacíjsou, jsouionty, iontypředevším, předevšímstruktur, strukturdosud, dosudpřírodních, přírodníchergoliny, ergolinyergopeptinů
ELEKTRONOVÁ IONIZACE
2020||Vědecké články
Chem. Listy 114, 101−105 (2020) Referát ELEKTRONOVÁ IONIZACE Karel Lemr a Lucie Borovcová kál-kationtu (molekulového iontu), výjimečně vznikají ionty se sudým počtem elektronů např. NO+: M + eF– → M+● + eF– + eS– Nedochází ke srážce částic, a proto…
Klíčová slova
elektronu, elektronuionizace, ionizaceionizační, ionizačníelektronů, elektronůreferát, referátlátky, látkyenergie, energieionty, iontyelektronová, elektronováenergii, energiianalyzované, analyzovanépři, přiiontů, iontůkomůrky, komůrkyjeho