Seminář Wiley - Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter
Pá, 5.3.2021
| Originální článek z: Mass Spec Interpretation Services/James LittleMass Spec Interpretation Services/James Little: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter
V srpnu až září 2020 jsem pro Vás představil 5ti dílnou serii webinářu Wiley Webinar Series o vyhledávání v knihovně EI spekter NIST. Série demonstruje efektivní využití softwaru NIST, jako je MS Search, MS Interpreter a AMDIS s knihovnami Wiley, NIST a uživateli vytvořenými knihovnami.
Ve třetí části se podíváme na:
Prezentaci ke třetí části naleznete v knihovně LabRulezGCMS.
- Help files and manuals
- Common Windows commands/functions
- AMDIS essentials
- Opening files
- Deconvoluting spectra and obtaining manual spectrum using LMB
- Evaluating results
- Externalsearching of commercial/user libraries with NIST MS
- Uncertain peaks
- Plotting selected ion chromatograms in normal and log scale
- Manually obtaining background subtracted spectra
- Internalsearching (no structures) of commercial/user databases
- Internalsearching (no structures) of target libraries
- Optimizing peak detection
- Comparing two chromatograms for differences
- Retention indices
- Problemno chromatogram/spectrum window
- Webinar References
- Acknowledgements
Dalších částech se zaměříme na:
Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter
Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven
V předchozích částech Semináře jsme se zaměžili na:
James Little/Mass Spec Interpretation Services