Seminář Wiley - Část 4: Pokročilé hybridní vyhledávání NIST EI a MS/MS Spekter

V srpnu až září 2020 jsem pro Vás představil 5ti dílnou serii webinářu Wiley Webinar Series o vyhledávání v knihovně EI spekter NIST. Série demonstruje efektivní využití softwaru NIST, jako je MS Search, MS Interpreter a AMDIS s knihovnami Wiley, NIST a uživateli vytvořenými knihovnami.

Ve čtvrté části se podíváme na:

Prezentaci ke čtvrté části naleznete v knihovně LabRulezGCMS.

• Webinar topics
• Help Files for NIST Search
• General Windows commands/functions
• Program description and my personal experience
• Hybrid generates score based on both fragments and neutral losses
• Setting up indices for EI hybrid search for Wiley and user libraries
• Saving configuration for EI hybrid search
• Hybrid search results for unknown
• Tip: See normal EI identity search results in hybrid search list
• “Mentally” merge information of hybrid and simple EI identity search
• Closer look at middle display of hybrid search
• Neutral loss display of hybrid search results
• Use available accurate mass data to support nominal mass hybrid search
• Hybrid search needs nominal MW of species to work properly
• Using NIST software to obtain proposed nominal MW
• View of hit list structure hybrid search options
• DeltaMass table
• Associating some simple structures with DeltaMass values
• Other things to consider using hybrid search for unknown identification
• NIST MSMS (tandem) hybrid searches
• Additional NIST MSMS (tandem) hybrid search menus
• Wiley MSMS (tandem) libraries
• Webinar references
• Acknowledgements

Poslední část série bude zaměřena na:

• Část 5: Vytváření a sdílení uživatelských EI a MS/MS knihoven

V předchozích částech Semináře jsme se zaměžili na:

• Část 1: Hledání spekter pomocí NIST MS Search

• Část 2: Hledání struktur pomocí NIST MS Search a používání MS Interpreter

• Část 3: AMDIS (NIST) pro zpracování datových souborů EI hmotnostních spekter