Efektivní využití databází EI hmotnostních spekter při identifikaci neznámých látek - část III: AMDIS (NIST) pro zpracování souborů s EI hmotnostními spektry
- Foto: James Little: Efektivní využití databází EI hmotnostních spekter při identifikaci neznámých látek - část III: AMDIS (NIST) pro zpracování souborů s EI hmotnostními spektry
- Video: james little: Wiley Seminar: NIST AMDIS for Processing EI GC-MS Data
Knihovny hmotnostních spekter NIST, Wiley a uživatelské EI knihovny jsou velmi výkonnými nástroji pro identifikaci organických sloučenin ve složitých směsích pomocí plynové chromatografie s hmotnostní spektrometrií (GC-MS). Tato série webinářů ukáže použití softwarové sady NIST včetně NIST Search, AMDIS a MS Interpreter pro prohledávání knihoven EI. Tato série by měla být užitečná pro širokou škálu vědců zabývajících se výzkumem a vývojem v lékařských, environmentálních, průmyslových, forenzních a biologických oborech.
Webináře předvádějí jak verzi 3.0 (2023), tak verzi V2.4 vyhledávání NIST. Pokud používáte verzi V3.0, začněte částí 0. Pokud používáte verzi V2.4, začněte částí I.
Dnes se podíváme na:
Část III: AMDIS (NIST) pro zpracování souborů s EI hmotnostními spektry
- Soubory nápovědy a příručky
- Běžné příkazy/funkce systému Windows
- Základní informace o systému AMDIS
- Otevírání souborů
- Dekonvolutace spekter a získání ručního spektra pomocí LMB
- Vyhodnocení výsledků
- Externí vyhledávání komerčních/uživatelských knihoven pomocí NIST MS
- Nejisté píky
- Vykreslení chromatogramů vybraných iontů v normálním a logaritmickém měřítku
- Ruční získání spekter odečtených od pozadí
- Interní vyhledávání (bez struktur) v komerčních/uživatelských databázích
- Interní vyhledávání (bez struktur) v cílových knihovnách
- Optimalizace detekce píků
- Porovnání dvou chromatogramů z hlediska rozdílů
- Retenční indexy
- Problém bez chromatogramu/okna spektra
- Webový seminář Odkazy
- Poděkování
Podrobné materiály včetně tabulek jsou k dispozici v knihovně LabRulezGCMS library
Další díly této série jsou zaměřeny na:
- Část 0: Změny v programu EI NIST23 (V3.0) ( pouze video)
- Část I: Spektrální vyhledávání pomocí NIST MS Search
- Část II: Vyhledávání struktur pomocí MS Search a použití MS Interpreteru
- Část III: AMDIS (NIST) pro zpracování souborů s EI hmotnostními spektry (tato část)
- Část IV: Pokročilé hybridní vyhledávání EI a MS/MS spekter NIST
- Část V: Vytváření a sdílení uživatelských knihoven EI a MS/MS (tato část)
- Část VI: Vytváření a používání retenčních indexů v softwaru NIST
- Část VII: Sledování komplexní koelace pomocí AMDIS a vyhledávání NIST
Videa ve vyšší kvalitě si můžete stáhnout zde:
Další zdroje webinářů:
- Test Files Used In Part VII for Tracking Coelution in Complex Mixtures with AMDIS and NIST
- New NIST23 Brochures and Purchasing
- NIST23 ASMS Presentation Houston, TX
- NIST 23 Separation Science Article by David Sparkman
- NIST and AMDIS User Manuals
- NIST Approach for Creating Libraries
- Databases Listed in Version 3.0 (2023)
- ACD Free Software (structure drawing program personal/academic use)
- Mass Spec Calculator Professional (free structure drawing program)
- Using with Manufacturers Data Processing Software
- Delta Mass Table (Excel Format)
- Delta Mass Table (PDF format)
- Hybrid Search/ChemSpider/SciFinder for Illicit Drug Identifications
- Importing Mass Spectra to NIST Search Program
- MS_Interpreter Correlating Structure to Spectrum
- NIST Tutorials and Settings for AMDIS
- Example Files for Part III AMDIS Webinar
- Example Spectra/Structures in Library Format Parts I-V
- Wiley Library User Manual with Spectral Source Codes
- Using with Manufacturers Data Processing Software
- Components in Free MONA Libraries
- MONA Library in EI format
- MONA and Other Free Libraries, 60,829 EI Spectra (see read_me in zip file)
