GCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.
Autor
DataApex
DataApex
Česká společnost DataApex se od svého založení v roce 1991 věnuje vývoji chromatografického softwaru. DataApex se neustále snaží poskytovat uživatelům efektivní a aktuální nástroje pro zpracování chromatografických dat.
Tagy
Článek
Video
Software
Produkt
LinkedIn Logo

Základy integrace chromatogramu v chromatografickém softwaru Clarity

Út, 6.1.2026
| Originální článek z: DataApex
Strukturovaný přehled integrace chromatogramu v softwaru Clarity. Vysvětlení globálních a lokálních integračních parametrů, detekce píků, práce se základní linií a přenos integrace do metody.
Video placeholder
  • Foto: DataApex: Základy integrace chromatogramu v Clarity
  • Vide: DataApex: Clarity Tutorial - Peak Integration Overview 

 

Úvod

Tento článek přináší strukturované, technicky zaměřené vysvětlení základního pracovního postupu integrace chromatogramu, jak je prezentován v instruktážním videu pro chromatografický software Clarity. Text se zaměřuje na integrační algoritmus Wave, přičemž popsané principy jsou obecně platné i pro algoritmus Legacy, který je v softwaru Clarity rovněž k dispozici.

Přehled integrace v softwaru Clarity

Integrace chromatogramu se v Clarity provádí v okně Chromatogram, na kartě Integration. Integrační parametry jsou definovány pomocí tabulky, kde každý řádek představuje jednu integrační operaci nebo událost.

Clarity nabízí dva integrační algoritmy:

  • Wave algoritmus – moderní, adaptivní metoda detekce píků (použitá v tomto článku)
  • Legacy algoritmus – tradiční algoritmus zachovaný z důvodu kompatibility

Přestože se jednotlivé parametry mohou mírně lišit, základní integrační workflow je u obou algoritmů shodné.

Typický postup integrace

Integrace chromatogramu v Clarity probíhá v několika logických krocích. Ve většině běžných aplikací postačují první tři kroky k dosažení správné a reprodukovatelné integrace.

Krok 1: Nastavení integračního intervalu

Integrační interval definuje časový úsek chromatogramu, který bude zahrnut do vyhodnocení. Veškerý signál mimo tento interval je při detekci píků ignorován.

Hlavní body:

  • Interval se vybírá graficky přímo v chromatogramu
  • Po použití integrační funkce Clarity automaticky vytvoří nový řádek v integrační tabulce
  • Časy začátku a konce jsou převzaty z grafického výběru
  • Všechny hodnoty v integrační tabulce lze ručně upravit

Tento krok zajišťuje, že nedojde k ovlivnění integrace irelevantními oblastmi (např. rozpouštědlo, promývání kolony)

Krok 2: Detekce negativních píků

Pokud chromatogram obsahuje negativní píky (například vlivem chování detektoru, odečtu pozadí nebo specifických analytických postupů), je nutné aktivovat funkci Detect Negative Peaks.

Pokud tato volba není zapnuta, negativní píky nebudou zahrnuty do integrace, což může vést k neúplné nebo chybné kvantifikaci.

Krok 3: Nastavení globálních integračních parametrů

Globální parametry určují způsob detekce píků v rámci celého integračního intervalu. Tyto parametry definují základní citlivost a selektivitu integrace.

Globální šířka píku (Global Peak Width)
  • Reprezentuje nejužší očekávaný pík
  • Slouží k určení shlukování píků (bunching)
  • Klíčová pro rozlišení blízce eluujících píků
Globální práh (Global Threshold)
  • Definuje úroveň šumu
  • Signály pod touto úrovní jsou považovány za šum
  • Správné nastavení zabraňuje falešné detekci píků
Globální sklon základní linie (Global Baseline Slope)
  • Ovlivňuje určení začátků a konců píků
  • Pomáhá přizpůsobit integraci šikmým nebo driftujícím základním liniím

Ve většině rutinních aplikací jsou tyto globální parametry dostačující pro správnou integraci.

Pokročilé úpravy integrace

V případech, kdy globální nastavení nestačí, nabízí Clarity nástroje pro lokální a pík-specifické doladění integrace.

Krok 4: Použití lokálních integračních parametrů

Lokální parametry se vztahují pouze na vybraný časový úsek chromatogramu. Využívají se zejména tehdy, když:

  • se tvary píků v průběhu analýzy výrazně liší
  • určitá oblast vyžaduje odlišnou citlivost
  • dochází k překryvu nebo nedostatečnému rozlišení píků

Clarity uživateli navrhne vhodné hodnoty parametrů, které lze dále upravit.

Krok 5: Operace specifické pro píky a základní linii

Pro finální doladění integrace lze použít:

  • pík-specifické integrační parametry
  • operace se základní linií

Tyto nástroje se obvykle používají k:

  • úpravě začátků a konců konkrétních píků
  • řešení atypických tvarů píků
  • zajištění konzistence u klíčových analytů

Tento krok je typický zejména pro složité chromatogramy nebo validované metody.

Logika integrační tabulky a pořadí operací

Každý řádek integrační tabulky představuje jednu integrační událost. Pořadí řádků je zásadní:

  • Operace se aplikují shora dolů
  • Pozdější řádky mohou upravovat výsledky předchozích kroků
  • Správné uspořádání zajišťuje předvídatelné a reprodukovatelné výsledky

Vícesignálové chromatogramy

U chromatogramů s více signály platí:

  • Každý signál má vlastní integrační tabulku
  • Integraci je nutné nastavit samostatně pro každý signál

Tím je zajištěna správná detekce a kvantifikace všech signálů.

Přenos integrace do metody a dalších chromatogramů

Jakmile integrační nastavení vyhovuje typickému chromatogramu, lze hotovou integrační tabulku:

  • přenést do analytické metody
  • použít pro další chromatogramy měřené za stejných podmínek

Tento postup podporuje konzistentní zpracování dat, validaci metod a dlouhodobou reprodukovatelnost výsledků.

Závěr

Integrace chromatogramu v softwaru Clarity je založena na jasně strukturovaném postupu, který začíná definicí integračního intervalu a globálních parametrů a v případě potřeby pokračuje lokálními a pík-specifickými úpravami.

Ve většině rutinních aplikací postačují:

  1. nastavení integračního intervalu
  2. aktivace detekce negativních píků
  3. úprava globálních parametrů

Porozumění hierarchii a pořadí integračních operací je klíčové pro tvorbu robustních metod a dosažení konzistentních analytických výsledků.

DataApex
LinkedIn Logo
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Acetaldehyde and Limonene in Recycled PET Using an HS-GCMS System (Carrier Gas: H2)

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/SQ, HeadSpace
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Aromatic Component Analysis of Gasoline According to ASTM D5580 Using the Brevis GC- 2050 Gas Chromatograph

Aplikace
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
GC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Micro GC Analysis of Permanent Gas Impurities in PEM Fuel Cell-Grade Hydrogen

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Průmysl a chemie

Quantification of 8 Disinfection Byproducts from Water by Liquid-Liquid Extraction and Gas Chromatography-MassSpectrometry

Aplikace
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Životní prostředí

Ultrasensitive and Powerful GC/MS/MS for Analyzing Multipesticides in Black Pepper and Dried Tea

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MS/MS, GC/QQQ, GC/MSD
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Navigace a přibližování chromatogramů v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Video

Navigace a přibližování chromatogramů v chromatografickém softwaru Clarity

Naučte se efektivně přibližovat, navigovat a udržet orientaci v chromatogramech v softwaru Clarity pomocí myši, klávesnice a náhledu chromatogramu.
DataApex
tag
share
more
Proč je moje výtěžnost vyšší než 100 %?
Článek | Akademie

Proč je moje výtěžnost vyšší než 100 %?

Při SPE očekáváme 100% výtěžnost, přesto se někdy setkáme s hodnotami vyššími než 100 %. Článek vysvětluje nejčastější příčiny a ukazuje, jak je systematicky identifikovat a řešit.
Phenomenex
tag
share
more
ISC 2026 – Brány pro registraci a nahrávání abstraktů jsou otevřeny!
Článek | Nejbližší akce

ISC 2026 – Brány pro registraci a nahrávání abstraktů jsou otevřeny!

Registrace a nahrávání abstraktů na ISC 2026 jsou otevřeny. Přihlaste se na chromatografické sympozium, letos 6. - 10. září v Praze a využijte zvýhodněnou registraci.
International Symposium on Chromatography - (ISC)
tag
share
more
Nová generace slunečního katalyzátoru přeměnuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů
Článek | Věda a výzkum

Nová generace slunečního katalyzátoru přeměnuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů

Vědci z CATRIN vyvinuli plazmonický fotokatalyzátor, který pomocí sluneční energie účinně přeměňuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů.
CATRIN
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Acetaldehyde and Limonene in Recycled PET Using an HS-GCMS System (Carrier Gas: H2)

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/SQ, HeadSpace
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Aromatic Component Analysis of Gasoline According to ASTM D5580 Using the Brevis GC- 2050 Gas Chromatograph

Aplikace
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
GC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Micro GC Analysis of Permanent Gas Impurities in PEM Fuel Cell-Grade Hydrogen

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Průmysl a chemie

Quantification of 8 Disinfection Byproducts from Water by Liquid-Liquid Extraction and Gas Chromatography-MassSpectrometry

Aplikace
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Životní prostředí

Ultrasensitive and Powerful GC/MS/MS for Analyzing Multipesticides in Black Pepper and Dried Tea

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MS/MS, GC/QQQ, GC/MSD
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Navigace a přibližování chromatogramů v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Video

Navigace a přibližování chromatogramů v chromatografickém softwaru Clarity

Naučte se efektivně přibližovat, navigovat a udržet orientaci v chromatogramech v softwaru Clarity pomocí myši, klávesnice a náhledu chromatogramu.
DataApex
tag
share
more
Proč je moje výtěžnost vyšší než 100 %?
Článek | Akademie

Proč je moje výtěžnost vyšší než 100 %?

Při SPE očekáváme 100% výtěžnost, přesto se někdy setkáme s hodnotami vyššími než 100 %. Článek vysvětluje nejčastější příčiny a ukazuje, jak je systematicky identifikovat a řešit.
Phenomenex
tag
share
more
ISC 2026 – Brány pro registraci a nahrávání abstraktů jsou otevřeny!
Článek | Nejbližší akce

ISC 2026 – Brány pro registraci a nahrávání abstraktů jsou otevřeny!

Registrace a nahrávání abstraktů na ISC 2026 jsou otevřeny. Přihlaste se na chromatografické sympozium, letos 6. - 10. září v Praze a využijte zvýhodněnou registraci.
International Symposium on Chromatography - (ISC)
tag
share
more
Nová generace slunečního katalyzátoru přeměnuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů
Článek | Věda a výzkum

Nová generace slunečního katalyzátoru přeměnuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů

Vědci z CATRIN vyvinuli plazmonický fotokatalyzátor, který pomocí sluneční energie účinně přeměňuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů.
CATRIN
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Acetaldehyde and Limonene in Recycled PET Using an HS-GCMS System (Carrier Gas: H2)

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/SQ, HeadSpace
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Aromatic Component Analysis of Gasoline According to ASTM D5580 Using the Brevis GC- 2050 Gas Chromatograph

Aplikace
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
GC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Micro GC Analysis of Permanent Gas Impurities in PEM Fuel Cell-Grade Hydrogen

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Průmysl a chemie

Quantification of 8 Disinfection Byproducts from Water by Liquid-Liquid Extraction and Gas Chromatography-MassSpectrometry

Aplikace
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Životní prostředí

Ultrasensitive and Powerful GC/MS/MS for Analyzing Multipesticides in Black Pepper and Dried Tea

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MS/MS, GC/QQQ, GC/MSD
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Navigace a přibližování chromatogramů v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Video

Navigace a přibližování chromatogramů v chromatografickém softwaru Clarity

Naučte se efektivně přibližovat, navigovat a udržet orientaci v chromatogramech v softwaru Clarity pomocí myši, klávesnice a náhledu chromatogramu.
DataApex
tag
share
more
Proč je moje výtěžnost vyšší než 100 %?
Článek | Akademie

Proč je moje výtěžnost vyšší než 100 %?

Při SPE očekáváme 100% výtěžnost, přesto se někdy setkáme s hodnotami vyššími než 100 %. Článek vysvětluje nejčastější příčiny a ukazuje, jak je systematicky identifikovat a řešit.
Phenomenex
tag
share
more
ISC 2026 – Brány pro registraci a nahrávání abstraktů jsou otevřeny!
Článek | Nejbližší akce

ISC 2026 – Brány pro registraci a nahrávání abstraktů jsou otevřeny!

Registrace a nahrávání abstraktů na ISC 2026 jsou otevřeny. Přihlaste se na chromatografické sympozium, letos 6. - 10. září v Praze a využijte zvýhodněnou registraci.
International Symposium on Chromatography - (ISC)
tag
share
more
Nová generace slunečního katalyzátoru přeměnuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů
Článek | Věda a výzkum

Nová generace slunečního katalyzátoru přeměnuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů

Vědci z CATRIN vyvinuli plazmonický fotokatalyzátor, který pomocí sluneční energie účinně přeměňuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů.
CATRIN
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Acetaldehyde and Limonene in Recycled PET Using an HS-GCMS System (Carrier Gas: H2)

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/SQ, HeadSpace
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Aromatic Component Analysis of Gasoline According to ASTM D5580 Using the Brevis GC- 2050 Gas Chromatograph

Aplikace
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
GC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Micro GC Analysis of Permanent Gas Impurities in PEM Fuel Cell-Grade Hydrogen

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Průmysl a chemie

Quantification of 8 Disinfection Byproducts from Water by Liquid-Liquid Extraction and Gas Chromatography-MassSpectrometry

Aplikace
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Životní prostředí

Ultrasensitive and Powerful GC/MS/MS for Analyzing Multipesticides in Black Pepper and Dried Tea

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MS/MS, GC/QQQ, GC/MSD
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství
 

Podobné články

Navigace a přibližování chromatogramů v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Video

Navigace a přibližování chromatogramů v chromatografickém softwaru Clarity

Naučte se efektivně přibližovat, navigovat a udržet orientaci v chromatogramech v softwaru Clarity pomocí myši, klávesnice a náhledu chromatogramu.
DataApex
tag
share
more
Proč je moje výtěžnost vyšší než 100 %?
Článek | Akademie

Proč je moje výtěžnost vyšší než 100 %?

Při SPE očekáváme 100% výtěžnost, přesto se někdy setkáme s hodnotami vyššími než 100 %. Článek vysvětluje nejčastější příčiny a ukazuje, jak je systematicky identifikovat a řešit.
Phenomenex
tag
share
more
ISC 2026 – Brány pro registraci a nahrávání abstraktů jsou otevřeny!
Článek | Nejbližší akce

ISC 2026 – Brány pro registraci a nahrávání abstraktů jsou otevřeny!

Registrace a nahrávání abstraktů na ISC 2026 jsou otevřeny. Přihlaste se na chromatografické sympozium, letos 6. - 10. září v Praze a využijte zvýhodněnou registraci.
International Symposium on Chromatography - (ISC)
tag
share
more
Nová generace slunečního katalyzátoru přeměnuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů
Článek | Věda a výzkum

Nová generace slunečního katalyzátoru přeměnuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů

Vědci z CATRIN vyvinuli plazmonický fotokatalyzátor, který pomocí sluneční energie účinně přeměňuje biomasu na suroviny pro výrobu bioplastů.
CATRIN
tag
share
more
Další projekty
LCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.