Fully automated on-line Folch Extraction and trans-methylation of fatty acids in salmon tissue
Aplikace | 2015 | AnatuneInstrumentace
Automatizace extrakce lipidů metodou Folch a jejich přímé transmethylace zvyšuje reprodukovatelnost a snižuje analytickou variabilitu v metabolomických studiích. Precizní příprava vzorků je nezbytná pro přesné rozlišení biologických rozdílů v obsahu mastných kyselin.
Cílem byla implementace plně automatizovaného online postupu pro extrakci salmoní tkáně, přímé transmethylace mastných kyselin a jejich analýzu pomocí GC-QTOF MS. Studie porovnala klasickou homogenizaci s mechanickým rozrušením (beads beating) v rámci Folch extrakce.
Extrakce proběhla na 50 mg salmoní tkáně přidáním 1 mL směsi chloroform/methanol (2:1). Agitace na Gerstel mVORX po dobu 30 min a následná centrifugace umožnily oddělení organické fáze, kterou se následně vysušilo v Gerstel mVAP a rekonstituovalo v 100 µL toluenu. Transmethylace proběhla při 70 °C po dobu 30 min v přítomnosti 3N metanolické HCl. Produkt byl extrahován hexanem, oddělen od vodné fáze a horní organická vrstva injektována do GC-MS.
Vyvinutý plně automatizovaný postup pro online Folch extrakci a transmiselyaci mastných kyselin v salmoní tkáni prokázal vysokou reproducibilitu a efektivitu. Metoda je vhodná pro rutinní nasazení v laboratořích zaměřených na lipidomiku.
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/HRMS, Příprava vzorků, GC/Q-TOF
ZaměřeníPotraviny a zemědělství
VýrobceAgilent Technologies, GERSTEL, Anatune
Souhrn
Význam tématu
Automatizace extrakce lipidů metodou Folch a jejich přímé transmethylace zvyšuje reprodukovatelnost a snižuje analytickou variabilitu v metabolomických studiích. Precizní příprava vzorků je nezbytná pro přesné rozlišení biologických rozdílů v obsahu mastných kyselin.
Cíle a přehled studie
Cílem byla implementace plně automatizovaného online postupu pro extrakci salmoní tkáně, přímé transmethylace mastných kyselin a jejich analýzu pomocí GC-QTOF MS. Studie porovnala klasickou homogenizaci s mechanickým rozrušením (beads beating) v rámci Folch extrakce.
Použitá metodika
Extrakce proběhla na 50 mg salmoní tkáně přidáním 1 mL směsi chloroform/methanol (2:1). Agitace na Gerstel mVORX po dobu 30 min a následná centrifugace umožnily oddělení organické fáze, kterou se následně vysušilo v Gerstel mVAP a rekonstituovalo v 100 µL toluenu. Transmethylace proběhla při 70 °C po dobu 30 min v přítomnosti 3N metanolické HCl. Produkt byl extrahován hexanem, oddělen od vodné fáze a horní organická vrstva injektována do GC-MS.
Použitá instrumentace
- Gerstel MultiPurpose Sampler 2 XL Dual Head
- Gerstel Multiposition Vortexer mVORX
- Gerstel Multiposition Evaporation Station mVAP
- Anatune CF-200 Robotic Centrifuge
- Agilent 7890B Gas Chromatograph
- Agilent 7200B Q-TOF High-Resolution Accurate-Mass Mass Spectrometer
Hlavní výsledky a diskuse
- Chromatografické profily z klasické Folch extrakce a beads beating byly vysoce podobné.
- Bylo identifikováno několik klíčových mastných kyselin jako methyl tetradecanoate, methyl hexadecanoate, methyl stearate a omega-3 estery (9,12,15-octadecatrienoate, eicosapentaenoate, docosahexaenoate).
- Reprodukovatelnost byla pro obě metody výborná (RSD < 10 %).
Přínosy a praktické využití metody
- Robustní a plně automatizovaný postup minimalizuje chyby obsluhy.
- Standardizace přípravy vzorků podporuje rutinní analýzy v QA/QC a výzkumu.
- Metoda je aplikovatelná na různé biologické i potravinové matice.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace s LC-MS pro komplexní lipidomické studie.
- Miniaturizace a paralelní zpracování vzorků pro vyšší propustnost.
- Využití v klinických studiích a průmyslovém monitoringu kvality potravin.
Závěr
Vyvinutý plně automatizovaný postup pro online Folch extrakci a transmiselyaci mastných kyselin v salmoní tkáni prokázal vysokou reproducibilitu a efektivitu. Metoda je vhodná pro rutinní nasazení v laboratořích zaměřených na lipidomiku.
Reference
- Folch J. et al., J. Biol. Chem. 1957, 226: 497-509
- Anatune Application Note AS 136, O’Connor S., Hawkins N.: Automated Derivatisation and Extraction of Fatty Acids using Gerstel MPS and Agilent 7890/7200 GC/Q-TOF
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
The Automated Derivatisation and Extraction of Fatty Acids using the Gerstel MPS Autosampler and Agilent 7890 / 7200 GC/Q-TOF
2014|Agilent Technologies|Aplikace
Chromatography Technical Note No AS136 The Automated Derivatisation and Extraction of Fatty Acids using the Gerstel MPS Autosampler and Agilent 7890 / 7200 GC/Q-TOF Sean O’Connor and Nathan Hawkins, Anatune Ltd. Girton, Cambridgeshire (UK). Introduction Instrumentation Precise extraction and measurement…
Klíčová slova
gerstel, gerstelmethyl, methylesters, estersfatty, fattyderivatisation, derivatisationagitator, agitatorfingerprinting, fingerprintingmps, mpstof, tofextraction, extractionacids, acidstertradecanoate, tertradecanoatemetabolic, metabolicmetabolomics, metabolomicsautomated
The Power of Fully Automated Sample Preparation for Metabolomics Applications: Proof of Concept
2016|Agilent Technologies|Aplikace
Chromatography Technical Note No AS158 The Power of Fully Automated Sample Preparation for Metabolomics Applications: Proof of Concept Camilla Liscio, Anatune Ltd. Girton, Cambridgeshire (UK). Introduction Sample preparation is a most crucial part of the whole analytical workflow. No matter…
Klíčová slova
dataset, datasetmethylation, methylationmarjoram, marjoramoregano, oreganoautomated, automatedmetabolomics, metabolomicsacids, acidstrans, transfatty, fattybrand, brandgerstel, gerstelprofessional, professionalpreparation, preparationfully, fullyresponsible
Design of Experiment (DoE) and GERSTEL MultiPurpose Sampler (MPS): a match made in heaven
2017|Agilent Technologies|AplikaceTechnické články
Anatune Ltd Unit 4, Wellbrook Court, Girton Road, Cambridge, CB3 0NA, UK Tel: +44 (0) 1223279210 Fax: +44 (0) 1223279253 Email: [email protected] Internet: www.anatune.co.uk Copyright © 2017 Anatune Ltd. All Rights Reserved. Anatune is a trademark of Anatune Ltd. Design…
Klíčová slova
picolinyl, picolinylderivatisation, derivatisationdoe, doehexanoate, hexanoatevariables, variablesscoping, scopingfatty, fattydesign, designoptimisation, optimisationoptimised, optimisedtrial, trialexperimental, experimentalacids, acidscentre, centrefactors
Automation of Derivatisation Workflows for GC-MS Metabolomics Applications
2017|Agilent Technologies|Aplikace
Chromatography Technical Note No AS165 Automation of Derivatisation Workflows for GC-MS Metabolomics Applications Camilla Liscio, Anatune Ltd. Girton, Cambridgeshire (UK). Introduction Gas chromatography-mass spectrometry is often used for metabolomics applications because of its reproducibility and chromatographic resolution power. However many…
Klíčová slova
derivatisation, derivatisationmox, moxtbdms, tbdmsmetabolomics, metabolomicstms, tmstmscn, tmscnworkflows, workflowsmultiposition, multipositionapplications, applicationsmstfa, mstfadeviation, deviationthree, threenorvalin, norvalintertbutyldimethylsilyl, tertbutyldimethylsilylgerstel