The Automated Derivatisation and Extraction of Fatty Acids using the Gerstel MPS Autosampler and Agilent 7890 / 7200 GC/Q-TOF
Aplikace | 2014 | AnatuneInstrumentace
Precizní extrakce a kvantifikace mastných kyselin je zásadní pro metabolomické studie, neboť i drobné chemické změny mohou indikovat významné biologické procesy.
Automatizace přípravy vzorků minimalizuje variabilitu a zvyšuje reprodukovatelnost dat, což je klíčové pro porovnávací analýzy a fingerprinting.
Cílem bylo zautomatizovat derivatizaci a extrakci mastných kyselin (FAME) z rostlinného materiálu (sušené oregano), využitím systému Gerstel MPS s integrovaným horkým agitátorem a analyzovat je na systému Agilent 7890B GC / 7200 Q-TOF MS.
Primárně se hodnotila efektivita přípravy vzorku, reprodukovatelnost a kvalita dat pro metabolomické aplikace.
Automatizace zajistila konzistentní přípravu vzorků a rychlý přechod k analýze.
Použitím LVI bylo možné vnést větší objem extraktu bez ztráty analytu díky ochlazovanému CIS a postupnému ventingu rozpouštědla.
TIC chromatogram ukázal přítomnost FAME a dalších nepolárních složek z oregana, což umožňuje netargetovou fingerprint analýzu.
Extrahované ionty m/z 74.0366 (McLafferty rearrangement) posloužily k rychlému screeningu mastných kyselin.
Reprodukovatelnost je doložena CV hodnotami 3.9–6.9 % pro jednotlivé FAME (C14–C22), průměrný %CV 8.2 %.
Automatizované workflow lze rozšířit o další moduly (vortexer, centrifuga) a protokoly pro komplexní lipidomiku či analýzu polarních metabolitů.
Integrace s pokročilými datovými platformami a AI nástroji umožní zrychlené vyhodnocení neznámých metabolitů a netargetové screeningy.
Automatizovaný systém Gerstel MPS ve spojení s GC/Q-TOF nabízí robustní a reprodukovatelné řešení pro analýzu mastných kyselin.
Výsledná data jsou vhodná pro cílené i necílené studie, přičemž vysoké rozlišení MS umožňuje rychlé vyhledání analytů a potvrzení jejich identity.
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/HRMS, Příprava vzorků, GC/Q-TOF
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceAgilent Technologies, GERSTEL, Anatune
Souhrn
Význam tématu
Precizní extrakce a kvantifikace mastných kyselin je zásadní pro metabolomické studie, neboť i drobné chemické změny mohou indikovat významné biologické procesy.
Automatizace přípravy vzorků minimalizuje variabilitu a zvyšuje reprodukovatelnost dat, což je klíčové pro porovnávací analýzy a fingerprinting.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem bylo zautomatizovat derivatizaci a extrakci mastných kyselin (FAME) z rostlinného materiálu (sušené oregano), využitím systému Gerstel MPS s integrovaným horkým agitátorem a analyzovat je na systému Agilent 7890B GC / 7200 Q-TOF MS.
Primárně se hodnotila efektivita přípravy vzorku, reprodukovatelnost a kvalita dat pro metabolomické aplikace.
Použitá metodika a instrumentace
- Vzorek: cca 5–6 mg lyofilizovaného oregana ve 2 mL vialu
- Derivatizace: 500 µL methanolické HCl, 70 °C, 15 min, agitace 500 rpm
- Extrakce: 500 µL hexan + 500 µL voda, vzorkování 10 µL horní nepolární vrstvy (FAMEs)
- Injekce: Large Volume Injection (LVI) s Gerstel CIS4, pomalé vnášení a solvent venting
- Gerstel Dual Head MPS 2 XL-xt s Heated Agitator a TDU
- Agilent 7890B GC
- Agilent 7200 Q-TOF MS
- Software: Agilent MassHunter B07.00, Gerstel Maestro 1.4.18.25/3.5
Hlavní výsledky a diskuse
Automatizace zajistila konzistentní přípravu vzorků a rychlý přechod k analýze.
Použitím LVI bylo možné vnést větší objem extraktu bez ztráty analytu díky ochlazovanému CIS a postupnému ventingu rozpouštědla.
TIC chromatogram ukázal přítomnost FAME a dalších nepolárních složek z oregana, což umožňuje netargetovou fingerprint analýzu.
Extrahované ionty m/z 74.0366 (McLafferty rearrangement) posloužily k rychlému screeningu mastných kyselin.
Reprodukovatelnost je doložena CV hodnotami 3.9–6.9 % pro jednotlivé FAME (C14–C22), průměrný %CV 8.2 %.
Přínosy a praktické využití metody
- Výrazné snížení spotřeby rozpouštědel a pracovní náročnosti díky plné automatizaci
- Vyšší reprodukovatelnost a kvalita dat pro komparativní metabolomiku a fingerprinting
- Možnost retrospektivní analýzy díky full-scan vysokém rozlišení Q-TOF
- Potenciál pro rozšíření na další derivatizační a extrakční protokoly (Folch, Fiehn)
Budoucí trendy a možnosti využití
Automatizované workflow lze rozšířit o další moduly (vortexer, centrifuga) a protokoly pro komplexní lipidomiku či analýzu polarních metabolitů.
Integrace s pokročilými datovými platformami a AI nástroji umožní zrychlené vyhodnocení neznámých metabolitů a netargetové screeningy.
Závěr
Automatizovaný systém Gerstel MPS ve spojení s GC/Q-TOF nabízí robustní a reprodukovatelné řešení pro analýzu mastných kyselin.
Výsledná data jsou vhodná pro cílené i necílené studie, přičemž vysoké rozlišení MS umožňuje rychlé vyhledání analytů a potvrzení jejich identity.
Reference
- O’Connor S., Hawkins N. Automated Derivatisation and Extraction of Fatty Acids using the Gerstel MPS Autosampler and Agilent 7890/7200 GC/Q-TOF MS, Anatune Ltd. 2014.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Fully automated on-line Folch Extraction and trans-methylation of fatty acids in salmon tissue
2015|Agilent Technologies|Aplikace
Chromatography Technical Note No AS157 Fully automated on-line Folch Extraction and trans-methylation of fatty acids in salmon tissue Camilla Liscio, Anatune Ltd. Girton, Cambridgeshire (UK). Introduction Instrumentation Metabolomics focuses on the characterisation of small-molecule metabolite profiles (Molecular weight < 2000…
Klíčová slova
folch, folchextraction, extractionbeating, beatingsalmon, salmonfully, fullytissue, tissuebeads, beadsautomated, automatedderivatisation, derivatisationfatty, fattygerstel, gerstelmultiposition, multipositionmetabolomics, metabolomicsintense, intenseacids
The Power of Fully Automated Sample Preparation for Metabolomics Applications: Proof of Concept
2016|Agilent Technologies|Aplikace
Chromatography Technical Note No AS158 The Power of Fully Automated Sample Preparation for Metabolomics Applications: Proof of Concept Camilla Liscio, Anatune Ltd. Girton, Cambridgeshire (UK). Introduction Sample preparation is a most crucial part of the whole analytical workflow. No matter…
Klíčová slova
dataset, datasetmethylation, methylationmarjoram, marjoramoregano, oreganoautomated, automatedmetabolomics, metabolomicsacids, acidstrans, transfatty, fattybrand, brandgerstel, gerstelprofessional, professionalpreparation, preparationfully, fullyresponsible
The fully on-line automation of MOX-TMS derivatisation for metabolomics applications
2016|Agilent Technologies|Aplikace
Chromatography Technical Note No AS164S The fully on-line automation of MOX-TMS derivatisation for metabolomics applications Camilla Liscio, Anatune Ltd., Girton, Cambridgeshire (UK). Introduction Metabolomics studies often rely on gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) as analytical platform because of its reproducibility and…
Klíčová slova
mox, moxtms, tmsmetabolomics, metabolomicsderivatisation, derivatisationmultiposition, multipositionprecipitation, precipitationsilylation, silylationfully, fullyanhydrous, anhydrousgerstel, gerstelpresence, presenceunknowns, unknownsderivatives, derivativesprotein, proteinautomated
Automation of Derivatisation Workflows for GC-MS Metabolomics Applications
2017|Agilent Technologies|Aplikace
Chromatography Technical Note No AS165 Automation of Derivatisation Workflows for GC-MS Metabolomics Applications Camilla Liscio, Anatune Ltd. Girton, Cambridgeshire (UK). Introduction Gas chromatography-mass spectrometry is often used for metabolomics applications because of its reproducibility and chromatographic resolution power. However many…
Klíčová slova
derivatisation, derivatisationmox, moxtbdms, tbdmsmetabolomics, metabolomicstms, tmstmscn, tmscnworkflows, workflowsmultiposition, multipositionapplications, applicationsmstfa, mstfadeviation, deviationthree, threenorvalin, norvalintertbutyldimethylsilyl, tertbutyldimethylsilylgerstel