The fully on-line automation of MOX-TMS derivatisation for metabolomics applications
Aplikace | 2016 | AnatuneInstrumentace
Metabolomická analýza často využívá GC-MS pro vysokou reprodukovatelnost a chromatografické rozlišení. Derivatizace metodou methoximace (MOX) a následná silylace trimethylsilylovou skupinou (TMS) zásadně zlepšuje těkavost, termostabilitu a vytváří charakteristické fragmenty pro identifikaci sloučenin. Příprava v anhydrobních podmínkách a odstranění proteinů zajišťují kvalitu chromatogramu.
Studie popisuje plně automatizovaný workflow precipitace bílkovin a on-line derivatizaci MOX-TMS sérových vzorků pomocí GERSTEL MPS 2 XL Dual head. Vzorky i blanky byly plně zpracovány a bez manuálního zásahu injikovány do GC/Q-TOF MS analytického systému.
Proces zahrnoval přidání methanolu pro precipitaci proteinů, centrifugaci (CF-200), následnou evaporaci (mVAP), methoximaci při 30 °C s interním standardem adonitol a silylaci pomocí MSTFA+1 % TMCS nebo TMSCN při 37 °C. Analýza proběhla na GC Agilent 7890B s kolonkou HP-5MS (30 m×0,25 mm×0,25 μm) v split režimu 10:1 a na Q-TOF 7200B v EI módu (35–500 m/z). Použité přístroje: GERSTEL MPS 2 XL Dual head, mVorx, mVAP a Anatune CF-200.
Interní standard adonitol 5TMS vykázal RSD 1 % pro TIC a 6 % pro extrahované iontové stopy. Dekonvoluce chromatogramů nástrojem Agilent MassHunter Unknowns Analysis odhalila v blanku 1517 komponent, v sérových replikátech 2623 a 2328 komponent, přičemž 642 až 1060 mělo shody v knihovnách NIST14/Wiley7 a přibližně 30 % představovalo TMS deriváty.
Automatizovaný protokol snižuje manuální zásahy, zkracuje dobu přípravy a zvyšuje reprodukovatelnost výsledků. Metoda je vhodná pro rutinní metabolomickou analýzu v biomedicínském výzkumu, klinickém testování a QA/QC aplikacích.
Očekává se rozšíření automatizace na další matice (např. moč, tkáně), integrace s novými derivatizačními reagenciemi a pokročilejšími dekonvolučními algoritmy. Potenciál má nasazení v high-throughput screeningových a klinických diagnostických laboratořích.
Vyvinutý plně automatizovaný on-line protokol precipitace proteinů a derivatizace MOX-TMS pro sérové vzorky prokázal vysokou přesnost, reprodukovatelnost a robustnost. Studie demonstruje schopnost identifikovat stovky metabolitů s minimálním manuálním zásahem.
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/HRMS, Příprava vzorků, GC/Q-TOF
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceAgilent Technologies, GERSTEL, Anatune
Souhrn
Význam tématu
Metabolomická analýza často využívá GC-MS pro vysokou reprodukovatelnost a chromatografické rozlišení. Derivatizace metodou methoximace (MOX) a následná silylace trimethylsilylovou skupinou (TMS) zásadně zlepšuje těkavost, termostabilitu a vytváří charakteristické fragmenty pro identifikaci sloučenin. Příprava v anhydrobních podmínkách a odstranění proteinů zajišťují kvalitu chromatogramu.
Cíle a přehled studie
Studie popisuje plně automatizovaný workflow precipitace bílkovin a on-line derivatizaci MOX-TMS sérových vzorků pomocí GERSTEL MPS 2 XL Dual head. Vzorky i blanky byly plně zpracovány a bez manuálního zásahu injikovány do GC/Q-TOF MS analytického systému.
Použitá metodika a instrumentace
Proces zahrnoval přidání methanolu pro precipitaci proteinů, centrifugaci (CF-200), následnou evaporaci (mVAP), methoximaci při 30 °C s interním standardem adonitol a silylaci pomocí MSTFA+1 % TMCS nebo TMSCN při 37 °C. Analýza proběhla na GC Agilent 7890B s kolonkou HP-5MS (30 m×0,25 mm×0,25 μm) v split režimu 10:1 a na Q-TOF 7200B v EI módu (35–500 m/z). Použité přístroje: GERSTEL MPS 2 XL Dual head, mVorx, mVAP a Anatune CF-200.
Hlavní výsledky a diskuse
Interní standard adonitol 5TMS vykázal RSD 1 % pro TIC a 6 % pro extrahované iontové stopy. Dekonvoluce chromatogramů nástrojem Agilent MassHunter Unknowns Analysis odhalila v blanku 1517 komponent, v sérových replikátech 2623 a 2328 komponent, přičemž 642 až 1060 mělo shody v knihovnách NIST14/Wiley7 a přibližně 30 % představovalo TMS deriváty.
Přínosy a praktické využití metody
Automatizovaný protokol snižuje manuální zásahy, zkracuje dobu přípravy a zvyšuje reprodukovatelnost výsledků. Metoda je vhodná pro rutinní metabolomickou analýzu v biomedicínském výzkumu, klinickém testování a QA/QC aplikacích.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření automatizace na další matice (např. moč, tkáně), integrace s novými derivatizačními reagenciemi a pokročilejšími dekonvolučními algoritmy. Potenciál má nasazení v high-throughput screeningových a klinických diagnostických laboratořích.
Závěr
Vyvinutý plně automatizovaný on-line protokol precipitace proteinů a derivatizace MOX-TMS pro sérové vzorky prokázal vysokou přesnost, reprodukovatelnost a robustnost. Studie demonstruje schopnost identifikovat stovky metabolitů s minimálním manuálním zásahem.
Reference
- Camilla Liscio: Chromatography Technical Note No AS164S, Anatune Ltd., 2016
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Automation of Derivatisation Workflows for GC-MS Metabolomics Applications
2017|Agilent Technologies|Aplikace
Chromatography Technical Note No AS165 Automation of Derivatisation Workflows for GC-MS Metabolomics Applications Camilla Liscio, Anatune Ltd. Girton, Cambridgeshire (UK). Introduction Gas chromatography-mass spectrometry is often used for metabolomics applications because of its reproducibility and chromatographic resolution power. However many…
Klíčová slova
derivatisation, derivatisationmox, moxtbdms, tbdmsmetabolomics, metabolomicstms, tmstmscn, tmscnworkflows, workflowsmultiposition, multipositionapplications, applicationsmstfa, mstfadeviation, deviationthree, threenorvalin, norvalintertbutyldimethylsilyl, tertbutyldimethylsilylgerstel
PrepAhead: how to master your time with GERSTEL Maestro software
2018|Agilent Technologies|Aplikace
Anatune Ltd Unit 4, Wellbrook Court, Girton Road, Cambridge, CB3 0NA, UK Tel: +44 (0) 1223279210 Fax: +44 (0) 1223279253 Email: [email protected] Internet: www.anatune.co.uk Copyright © 2018 Anatune Ltd. All Rights Reserved. Anatune is a trademark of Anatune Ltd. PrepAhead:…
Klíčová slova
prepahead, prepaheadmaestro, maestrofunction, functiontablets, tabletssamples, samplesswab, swabuntargeted, untargetedmetabolomics, metabolomicsfreshly, freshlyskin, skinsample, samplepreparation, preparationdisease, diseasedowntime, downtimederivatisation
Fully automated on-line Folch Extraction and trans-methylation of fatty acids in salmon tissue
2015|Agilent Technologies|Aplikace
Chromatography Technical Note No AS157 Fully automated on-line Folch Extraction and trans-methylation of fatty acids in salmon tissue Camilla Liscio, Anatune Ltd. Girton, Cambridgeshire (UK). Introduction Instrumentation Metabolomics focuses on the characterisation of small-molecule metabolite profiles (Molecular weight < 2000…
Klíčová slova
folch, folchextraction, extractionbeating, beatingsalmon, salmonfully, fullytissue, tissuebeads, beadsautomated, automatedderivatisation, derivatisationfatty, fattygerstel, gerstelmultiposition, multipositionmetabolomics, metabolomicsintense, intenseacids
A fully automated offline solution for the analysis of amino acids by GC-MS
2017|Agilent Technologies|Aplikace
Chromatography Technical Note No AS175 A fully automated offline solution for the analysis of amino acids by GC-MS Camilla Liscio, Nathan Hawkins, Anatune Ltd., Girton, Cambridgeshire, UK. Introduction determination in limited volume samples (e.g., dried blood spots or rodent plasma).…
Klíčová slova
amino, aminosmartspe, smartspeacid, acidacids, acidsfully, fullyalanine, alaninetriptophan, triptophangerstel, gerstelhistidine, histidineglutamine, glutamineaminobutyric, aminobutyricmetabolic, metabolicautomated, automatedsarcosine, sarcosinehydroxyproline