GCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

Identification of metabolites in human plasma using GC-Orbitrap-MS after online derivatization

Aplikace | 2017 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/HRMS, GC/Orbitrap
Zaměření
Metabolomika, Klinická analýza
Výrobce
Thermo Fisher Scientific

Souhrn

Význam tématu


Plynulá chromatografie plynů (GC) kombinovaná s vysokorozlišovacím Orbitrap hmotnostním spektrometrem (GC-Orbitrap-MS) nabízí v oblasti metabolomiky klíčové výhody. Díky vysoké chromatografické i hmotnostní rozlišovací schopnosti a přístupu k rozsáhlým spektrometrickým knihovnám lze spolehlivě identifikovat široké spektrum polárních až polovodných metabolitů. Automatizované on-line derivatizační postupy navíc minimalizují variabilitu způsobenou nestabilitou derivátů a zvyšují reprodukovatelnost analýz.

Cíle a přehled studie


Cílem studie bylo demonstrovat schopnost GC-Orbitrap-MS pro kvalitativní screening metabolitů v lidské plazmě za použití on-line derivatizace. Autoři si kladli za úkol optimalizovat rychlý derivatizační protokol bez přídavného off-line čekání, zajistit vysokou přesnost hmotnostních měření a prověřit opakovatelnost detekce vybraných sloučenin.

Použitá instrumentace


  • GC systém TRACE 1310 s kapilární kolónou TraceGOLD TG-5SilMS (30 m × 0,25 mm × 0,25 µm)
  • Orbitrapová hmotnostní spektrometrie Q Exactive GC Orbitrap MS (EI, 70 eV, rozlišení 60 000 FWHM při m/z 200)
  • On-line derivatizátor Gerstel MultiPurpose Sampler (MPS) s Gerstel Maestro softwarem
  • Analytický software TraceFinder pro dekonvoluci, shodu spekter (SI) a filtraci vysokého rozlišení (HRF)


Použitá metodika


Vzorek lidské plazmy (20 µL) byl extrahován 300 µL methanolu, centrifugován a vysušen dusíkem. První derivatizační krok s methoxyaminem-HCl v pyridinu (80 °C, 15 min) proběhl off-line a poté bylo sucho doplněno vazebným činidlem MSTFA v MPS. Druhý krok silylace (80 °C, 15 min) proběhl on-line těsně před injekcí (split 5:1, 250 °C). Spektra byla snímána v režimu full-scan m/z 50–650 při sub-ppm přesnosti.

Hlavní výsledky a diskuse


Bylo detekováno zhruba 200 dekonvolvovaných stop s vysokou intenzitou. Identifikace proběhla porovnáním SI (>900) a HRF (>99 %) proti knihovně obsahující více než 850 metabolitů. Příklad: pyroglutamová kyselina 2TMS byla identifikována s kombinovaným skóre 97,8 %. Opakovatelnost vybraných sloučenin (např. ribóza 4TMS, myo-inositol 6TMS, cholesterol TMS) vykázala RSD 5–12 %, což odpovídá požadavkům metabolomických studií (<15 %). On-line derivatizace odstranila proměnnou dobu setrvání derivátů na autosampleru, a tím omezila variabilitu signálů.

Přínosy a praktické využití metody


Metoda umožňuje rychlý screening a spolehlivou identifikaci polárních i nepolárních metabolitů v komplexních biologických matricích. Automatizace derivatizace a vysoká hmotnostní přesnost zkracují čas analýzy, minimalizují chyby obsluhy a zvyšují homogenitu dat. Pro klinickou metabolomiku, toxikologii a farmakokinetiku takový přístup přináší vyšší průtok vzorků a lepší reprodukovatelnost.

Budoucí trendy a možnosti využití


Vývoj směruje k rozšíření knihoven s dalšími derivatizačními třídami a implementaci více kroků on-line přípravy v jednom běhu. Další vylepšení by mohla přinést softwarová umělá inteligence pro automatickou anotaci nových sloučenin a real-time kvantifikaci. Kombinace GC-Orbitrap-MS s datově bohatými přístupy snímání by mohla posunout metabolomiku nejen směrem ke schopnosti analyzovat ultra-trace sloučeniny, ale i k integraci výsledků s jinými spektroskopickými technikami.

Závěr


Studie prokázala, že on-line derivatizace ve spojení s vysokorozlišovacím Orbitrap spektrometrem poskytuje spolehlivou a reprodukovatelnou platformu pro identifikaci metabolitů v lidské plazmě. Klíčovými prvky jsou přesnost hmotnostních měření, rozsáhlá knihovna spekter a automatizované časově řízené přípravy vzorků.

Reference


  1. Zarate E. a kol. Fully automated trimethylsilyl derivatisation protocol for metabolite profiling by GC-MS. Metabolites 2017, 7, 1.
  2. Villas-Boas S. a kol. Mass Spectrometry in metabolome analysis. Mass Spectrom. Rev. 2005, 24, 613–646.
  3. Koek M.M. a kol. Quantitative metabolomics based on gas chromatography mass spectrometry: Status and perspectives. Metabolomics 2011, 7, 307–328.
  4. Thermo Fisher Scientific. Orbitrap GC-MS HRAM Metabolomics Library (2017).
  5. Thermo Fisher Scientific. Application Notes AN10457, AN10488.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
Fully Automated Online Trimethylsilyl (TMS) Derivatization Protocol for Metabolite Profiling Using an Orbitrap GC-MS and High Resolution Accurate Mass Metabolomics Library
Fully Automated Online Trimethylsilyl (TMS) Derivatization Protocol for Metabolite Profiling Using an Orbitrap GC-MS and High Resolution Accurate Mass Metabolomics Library Xin Zheng1, Giulia Riccardino2, Jason Cole1, Paul Silcock3 1Thermo Fisher Scientific, Austin, Texas; 2Thermo Fisher Scientific, Runcorn, Cheshire INTRODUCTION…
Klíčová slova
derivatization, derivatizationonline, onlineincubators, incubatorsprotocol, protocolmetabolomics, metabolomicslibrary, libraryorbitrap, orbitraphram, hramautomated, automatedmetabolite, metabolitemass, massquan, quanrsh, rshtracefinder, tracefindertms
Understanding Synthetic Biology using the Q Exactive GC Orbitrap GC-MS and a High Resolution Accurate Mass Metabolomics Library for Untargeted Metabolomics
Understanding Synthetic Biology using the Q Exactive GC Orbitrap GC-MS and a High Resolution Accurate Mass Metabolomics Library for Untargeted Metabolomics Cristian Cojocariu1, Maria Vinaxia2, Mark Dunstan2, Adrian J. Jervis2, Paul Silcock1 and Nicholas J. W. Rattray2 Fisher Scientific, Runcorn,…
Klíčová slova
metabolomics, metabolomicsinducer, inducerhram, hramorbitrap, orbitrapcontributed, contributeddiscoverer, discovererlibrary, libraryuntargeted, untargetedexactive, exactiveiptg, iptgmetabolic, metaboliccompound, compoundscientific, scientificmetabolites, metabolitesusing
Untargeted Metabolomics Using Orbitrap-Based GC-MS
Untargeted Metabolomics Using Orbitrap-Based GC-MS
2016|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Stefan Weidt,2 Bogusia Pesko,2 Cristian Cojocariu,1 Paul Silcock,1 Richard J. Burchmore,2 and Karl Burgess2 Thermo Fisher Scientific, Runcorn, UK 2 Glasgow Polyomics, University of Glasgow, Glasgow, UK 1 Ap plica t ion Note 1 045 7 Untargeted Metabolomics Using Orbitrap-Based…
Klíčová slova
metabolomics, metabolomicsexactive, exactivefragment, fragmentmetabolites, metabolitesmass, masswere, weremetabolite, metabolitepeak, peakrat, ratunivariate, univariatebase, baseuntargeted, untargetedusing, usingdenotes, denotesderivatize
Metabolomics 2017: Back to the Future with Thermo Scientific™ Q Exactive™ GC Orbitrap™ GC-MS/MS
Back to the Future with Thermo Scientific™ Q Exactive™ GC Orbitrap™ GC-MS/MS 1 Proprietary & Confidential The world leader in serving science 2 1 Why GC/MS for Metabolomics? 2 Why High Resolution/Accurate Mass (HRAM) GC/MS for Metabolomics? 3 Tools for…
Klíčová slova
metabolomics, metabolomicsderivatization, derivatizationdeconvolution, deconvolutionidentification, identificationdiscoverer, discovererlibrary, libraryplugin, pluginserving, servingleader, leaderconfidential, confidentialunknown, unknownhram, hramrsh, rshtriplus, tripluscompound
Další projekty
LCMS
ICPMS
Sledujte nás
FacebookX (Twitter)LinkedInYouTube
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.