GC/MS Metabolites Library
Aplikace | | GL SciencesInstrumentace
V oblasti metabolomické analýzy hraje plynová chromatografie spojená s hmotnostní spektrometrií klíčovou roli při identifikaci a kvantifikaci malých molekul. Derivatisace trimethylsilylací umožňuje zlepšit těkavost i termickou stabilitu metabolitů jako jsou aminokyseliny, organické kyseliny, cukry a mastné kyseliny, což vede k rozšíření analytického rozsahu a citlivosti metody.
Cílem technické poznámky bylo vytvořit rozsáhlou knihovnu přibližně 400 běžných metabolitů derivatizovaných na trimethylsilylové sloučeniny a demonstrovat jejich detekci pomocí GC-MS na koloně InertCap 5MS/NP. Popis zahrnuje postup derivatisace, chromatografické a spektrometrické podmínky, stejně jako výsledný seznam látek s retencí a indexy.
Bylo detekováno a charakterizováno přibližně 400 derivatizovaných metabolitů včetně aminokyselin, organických kyselin, sacharidů a lipidických prekurzorů. Retenční indexy vypočtené vůči n-alkanům pokrývají rozsah od 1000 (C10) do 3600 (C38). Metoda ukázala vysokou reprodukovatelnost retencí a spolehlivou detekci i polárních sloučenin.
Další rozvoj zahrnuje rozšíření knihovny o nové třídy metabolitů, integraci s vysokorozlišující hmotnostní spektrometrií, automatizaci derivatisace a kvantitativní aplikace v rámci metabolických toků. Vznikají také pokročilé bioinformatické nástroje pro automatizovanou identifikaci na základě retenčních indexů a spektrálních dat.
Popisovaný postup derivatisace a rozsáhlá GC-MS knihovna poskytují robustní a přenositelné řešení pro analytickou chemii metabolitů. Implementace této metodiky zefektivňuje identifikaci a podporuje výzkum i rutinní analýzu v široké škále aplikací.
GC/MSD, GC kolony, Spotřební materiál
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceGL Sciences
Souhrn
Význam tématu
V oblasti metabolomické analýzy hraje plynová chromatografie spojená s hmotnostní spektrometrií klíčovou roli při identifikaci a kvantifikaci malých molekul. Derivatisace trimethylsilylací umožňuje zlepšit těkavost i termickou stabilitu metabolitů jako jsou aminokyseliny, organické kyseliny, cukry a mastné kyseliny, což vede k rozšíření analytického rozsahu a citlivosti metody.
Cíle a přehled studie
Cílem technické poznámky bylo vytvořit rozsáhlou knihovnu přibližně 400 běžných metabolitů derivatizovaných na trimethylsilylové sloučeniny a demonstrovat jejich detekci pomocí GC-MS na koloně InertCap 5MS/NP. Popis zahrnuje postup derivatisace, chromatografické a spektrometrické podmínky, stejně jako výsledný seznam látek s retencí a indexy.
Použitá metodika a instrumentace
- Derivatisace: krok 1 Methoximation reagenty v pyridinu při 30 °C po dobu 90 minut; krok 2 trimethylsilylace pomocí MSTFA při 37 °C po dobu 30 minut.
- Chromatografie: plynový chromatograf spojený s hmotnostním spektrometrem; kolona InertCap 5MS/NP o rozměrech 0,25 mm I.D. × 30 m, tloušťka filmu 0,25 µm.
- Teplotní program: počáteční stupeň 80 °C (2 min), zvyšování 15 °C/min do 330 °C (doba zůstání 13 min).
- Přenášecí plyn helium za konstantního tlaku 75 kPa, injekce rozděleným vstřikem 1 µL, split ratio 5 mL/min.
- Detekce: ionizační zdroj 250 °C, ionizační napětí 70 eV, rozsah skenování m/z 85 – 500.
Hlavní výsledky a diskuse
Bylo detekováno a charakterizováno přibližně 400 derivatizovaných metabolitů včetně aminokyselin, organických kyselin, sacharidů a lipidických prekurzorů. Retenční indexy vypočtené vůči n-alkanům pokrývají rozsah od 1000 (C10) do 3600 (C38). Metoda ukázala vysokou reprodukovatelnost retencí a spolehlivou detekci i polárních sloučenin.
Přínosy a praktické využití metody
- Komplexní knihovna usnadňuje rychlou a jednoznačnou identifikaci širokého spektra metabolitů.
- Standardizovaný retenční index umožňuje přenositelnost výsledků mezi laboratořemi.
- Metoda nachází uplatnění v klinické metabolomice, potravinářském výzkumu, toxikologii i farmaceutickém vývoji.
Budoucí trendy a možnosti využití
Další rozvoj zahrnuje rozšíření knihovny o nové třídy metabolitů, integraci s vysokorozlišující hmotnostní spektrometrií, automatizaci derivatisace a kvantitativní aplikace v rámci metabolických toků. Vznikají také pokročilé bioinformatické nástroje pro automatizovanou identifikaci na základě retenčních indexů a spektrálních dat.
Závěr
Popisovaný postup derivatisace a rozsáhlá GC-MS knihovna poskytují robustní a přenositelné řešení pro analytickou chemii metabolitů. Implementace této metodiky zefektivňuje identifikaci a podporuje výzkum i rutinní analýzu v široké škále aplikací.
Reference
- GL Sciences Inc. Technical Note GT081 GC/MS Metabolites Library
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Analysis and Retention Indices of 61 Organic Solvent Components by Nitrogen Carriers
|GL Sciences|Technické články
GC Technical Note Analysis and Retention Indices of 61 Organic Solvent Components by Nitrogen Carriers GT126 GL Sciences Inc. The retention index is a relatively representative index of the retention ratio of straight-chain alkanes and is used to study constituents…
Klíčová slova
retention, retentionacetate, acetateindex, indexcellosolve, cellosolvealkanes, alkanescresol, cresolalcohol, alcoholtime, timexylene, xyleneisoamyl, isoamylisobutyl, isobutylethyl, ethylwarming, warmingmethyl, methylisopropyl
G166766A Agilent Fiehn GC/MS Metabolomics RTL Library: List of Compounds
2013|Agilent Technologies|Brožury a specifikace
G166766A Agilent Fiehn GC/MS Metabolomics RTL Library: List of Compounds Data Sheet 800 Metabolite library for more compound identification The Agilent Fiehn GC/MS metabolomics RTL Library is the most comprehensive commercially available GC/MS library of metabolite spectra. This expanding library…
Klíčová slova
pubchem, pubchemacid, acidcas, cascompound, compoundmethyl, methylbeta, betatrans, transriboside, ribosidehyoscyamine, hyoscyaminecatechin, catechindihydrocarveol, dihydrocarveolbenzoquinone, benzoquinonealcohol, alcoholpropofol, propofolmelezitose
Analysis of Residual Solvent Components in Drugs - Using InertCap 624
|GL Sciences|Aplikace
GC Technical Note Analysis of Residual Solvent Components in Drugs - Using InertCap 624 GT035 GL Sciences Inc. This application note is an example of the analysis of components subject to the Guideline for Residual Solvents in Pharmaceuticals. According to…
Klíčová slova
straight, straightretention, retentioncarbons, carbonsalkane, alkanechain, chaincomponents, componentstime, timeindex, indexalcohol, alcoholprecede, precederesidual, residualinterest, interestsample, samplenote, noteenlarged
Analytical and Retention Index of Pesticide Residues in Foods Using InertCap Pesticides
|Shimadzu|Aplikace
GC Technical Note GT062 GL Sciences Inc. Analytical and Retention Index of Pesticide Residues in Foods – Using InertCap Pesticides This application details the use of an InertCap Pesticides GC-capillary column to determine the retention times and retention indices of…
Klíčová slova
vii, viiiii, iiiretention, retentionindex, indexdecomposition, decompositionsciences, sciencesmetabolite, metabolitebhc, bhcoxospoconazole, oxospoconazolepyriminobackmethyl, pyriminobackmethylethyl, ethylmethyl, methyldimethenamide, dimethenamidemin, mincompound