Supporting exposomics research with the Orbitrap Exploris GC 240 mass spectrometer
Aplikace | 2024 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Exposomika představuje komplexní přístup k hodnocení celoživotních environmentálních expozic a jejich účinků na lidské zdraví. Porozumění souhrnu chemických, fyzikálních a biologických vlivů, které se v průběhu života kumulují, je klíčové pro identifikaci negenetických příčin nemocí a pro návrh účinných preventivních opatření.
Cílem studie bylo demonstrovat schopnosti Orbitrap Exploris GC 240 hmotnostního spektrometru ve spojení s výkonným softwarovým prostředím pro efektivní, vysoce selektivní a necílený screening tisíců až stovek tisíc expozic v různých typech vzorků. Práce ukazuje řešení hlavních výzev exposomických analýz – od extrakce přes identifikaci až po kvantifikaci a retrospektivní vyhodnocování neznámých sloučenin.
Byla kombinována následující technologie:
Analytické postupy umožnily rozšířit počet detekovatelných expozic z původních stovek na až 100 000 chemických signálů ve vzorku. Vysoká selektivita a citlivost HRAM systému umožnila spolehlivou detekci nízkokoncentrovaných látek v různých komplexních matricích (biologické vzorky, voda, půda, vzduch). Software Compound Discoverer významně zrychlil proces anotace, strukturové elucece a kvantifikace, zároveň je možné retrospektivně vyhodnotit data pro nově objevené látky.
Metodika podporuje široké spektrum aplikací v environmentálních a bioanalytických laboratořích:
Očekává se další rozvoj nekonvenčních expozičních biomarkerů (např. slepá místa e-odpadu, mikroplasty, per- a polyfluorované látky) a integrace výsledků s genomickými a metabolomickými daty pro komplexní EWAS (exposomové asociační studie). Vylepšení softwarové podpory a rozšiřování HRAM spektrálních knihoven umožní ještě širší necílené screeningy a rychlejší validaci nových látek.
Představený workflow založený na Orbitrap Exploris GC 240 spolu s výkonným softwarem otevírá nové horizonty v exposomických výzkumech. Technologie poskytuje bezprecedentní citlivost, selektivitu a rozsah necílených analýz, umožňující detailní charakterizaci komplikovaných expozic a jejich vlivu na lidské zdraví.
1. Fuentes M. a kol. Operationalizing the Exposome Using Passive Silicone Samplers. Current Pollution Reports. 2022;8(1):1–29.
2. Thermo Fisher Scientific Technical Note 10730: Mass resolving power of 240 000: for confident compound identification. 2021.
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/Orbitrap, GC/HRMS
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Exposomika představuje komplexní přístup k hodnocení celoživotních environmentálních expozic a jejich účinků na lidské zdraví. Porozumění souhrnu chemických, fyzikálních a biologických vlivů, které se v průběhu života kumulují, je klíčové pro identifikaci negenetických příčin nemocí a pro návrh účinných preventivních opatření.
Cíle a přehled studie
Cílem studie bylo demonstrovat schopnosti Orbitrap Exploris GC 240 hmotnostního spektrometru ve spojení s výkonným softwarovým prostředím pro efektivní, vysoce selektivní a necílený screening tisíců až stovek tisíc expozic v různých typech vzorků. Práce ukazuje řešení hlavních výzev exposomických analýz – od extrakce přes identifikaci až po kvantifikaci a retrospektivní vyhodnocování neznámých sloučenin.
Použitá metodika a instrumentace
Byla kombinována následující technologie:
- Orbitrap Exploris GC 240 vysokého rozlišení (HRAM) pro necílené full scan akvizice s rozlišovací schopností až 240 000 při m/z 200 a přesností hmotnosti lepší než 1 ppm.
- Termo Scientific Compound Discoverer pro zpracování velkých necílených datových souborů, identifikaci neznámých sloučenin a statistickou analýzu.
- HRAM kontaminantová knihovna electron ionizačních spekter (přes 1200 spekter z 940 sloučenin), která umožňuje přesnou anotaci detekovaných znaků.
Hlavní výsledky a diskuse
Analytické postupy umožnily rozšířit počet detekovatelných expozic z původních stovek na až 100 000 chemických signálů ve vzorku. Vysoká selektivita a citlivost HRAM systému umožnila spolehlivou detekci nízkokoncentrovaných látek v různých komplexních matricích (biologické vzorky, voda, půda, vzduch). Software Compound Discoverer významně zrychlil proces anotace, strukturové elucece a kvantifikace, zároveň je možné retrospektivně vyhodnotit data pro nově objevené látky.
Přínosy a praktické využití metody
Metodika podporuje široké spektrum aplikací v environmentálních a bioanalytických laboratořích:
- Necílené sledování širokého rozsahu kontaminantů pro epidemiologické studie a expoziční vědy.
- Retrospektivní analýzy pro nově definované rizikové látky bez opětovné akvizice vzorků.
- Rychlé odhalení neočekávaných expozic a biomarkerů expozice.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se další rozvoj nekonvenčních expozičních biomarkerů (např. slepá místa e-odpadu, mikroplasty, per- a polyfluorované látky) a integrace výsledků s genomickými a metabolomickými daty pro komplexní EWAS (exposomové asociační studie). Vylepšení softwarové podpory a rozšiřování HRAM spektrálních knihoven umožní ještě širší necílené screeningy a rychlejší validaci nových látek.
Závěr
Představený workflow založený na Orbitrap Exploris GC 240 spolu s výkonným softwarem otevírá nové horizonty v exposomických výzkumech. Technologie poskytuje bezprecedentní citlivost, selektivitu a rozsah necílených analýz, umožňující detailní charakterizaci komplikovaných expozic a jejich vlivu na lidské zdraví.
Reference
1. Fuentes M. a kol. Operationalizing the Exposome Using Passive Silicone Samplers. Current Pollution Reports. 2022;8(1):1–29.
2. Thermo Fisher Scientific Technical Note 10730: Mass resolving power of 240 000: for confident compound identification. 2021.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Versatile, highly sensitive and reproducible: How Orbitrap Exploris GC 240 strengthens metabolomics
2021|Thermo Fisher Scientific|Ostatní
CASE STUDY 10750 Versatile, highly sensitive and reproducible: How Orbitrap Exploris GC 240 strengthens metabolomics Introduction Over the last decade, metabolomics has demonstrated immense potential in accelerating biomarker research in human health and disease. The metabolome, influenced by both genetic…
Klíčová slova
metabolomics, metabolomicsbowden, bowdenresearch, researchteam, teamworkflows, workflowslaboratory, laboratorynew, newtowards, towardsprojects, projectsomics, omicsfisher, fisherexpansive, expansivestudies, studiesenvironmental, environmentalsuite
ADVANCING EXPOSOMICS RESEARCH
2016|Agilent Technologies|Brožury a specifikace
Integrating workflows and Bioinformatics for Exposome and Environmental Health Research ADVANCING EXPOSOMICS RESEARCH EXPOSOMICS AND ENVIRONMENTAL HEALTH RESEARCH Agilent empowers exposome and environmental health research with leading analytical products and solutions across omics technologies. This enables a deeper understanding of…
Klíčová slova
exposome, exposomeexposures, exposuresenvironmental, environmentalresearch, researchhealth, healthagilent, agilentomics, omicsexposure, exposureexposomics, exposomicselucidate, elucidateworkflows, workflowsbiochemical, biochemicalbiology, biologyprofiler, profilergene
Using the Blood Exposome to Discover Causes of Disease
2015|Agilent Technologies|Technické články
Using the Blood Exposome to Discover Causes of Disease Technical Overview Clinical Research Authors Introduction Stephen M. Rappaport, Ph.D. Of the 52.8 million world-wide deaths in 2010, approximately two-thirds were caused by chronic diseases, mainly cardiovascular disease (> 15 million)…
Klíčová slova
biomarkers, biomarkersexposome, exposomeexposures, exposuresexposure, exposuredisease, diseasecausal, causalewas, ewaselectrophiles, electrophilesbiology, biologyblood, bloodfiehn, fiehnaxis, axisbiochemical, biochemicalrelationships, relationshipshealthy
Thermo Scientific Orbitrap Exploris GC 240 Mass Spectrometer - eBook
2020|Thermo Fisher Scientific|Příručky
eBook Thermo Scientific Orbitrap Exploris GC 240 Mass Spectrometer Contents Foreword Overview Specifications Breakthrough performance of the Orbitrap Exploris GC for analytical testing and scientific research applications This study explores the power of high resolution and accurate mass using Orbitrap-based…
Klíčová slova
orbitrap, orbitrappci, pcimass, massoregano, oreganoexploris, exploristhermo, thermoscientific, scientificmetabolomics, metabolomicsdata, datacompound, compoundchemical, chemicalidentification, identificationion, ionspectrum, spectrumscan