Metabolomics of Opiate-Induced Changes in Murine Brain by GC/Q-TOF
Aplikace | 2013 | Agilent TechnologiesInstrumentace
Metabolomika poskytuje přímé informace o biochemickém stavu organismu a umožňuje identifikovat metabolické dráhy ovlivněné léčivy. V případě opiátů se metabolomické změny v mozkové tkáni mohou podílet na mechanismech závislosti, bolesti a tolerance. Studium rozdílů mezi myšími kmeny s různou citlivostí na morfin může odhalit biomarkery a cíle pro terapeutické zásahy.
Cílem popsané práce bylo použití netargetovaného GC/Q-TOF metabolomického přístupu k porovnání změn v mozkových metabolitech dvou kmenů myší (morfin-citlivý C57BL/6 a morfin-rezistentní 129Sv1) po aplikaci morfinu. Studie usilovala o identifikaci klíčových sloučenin, jejichž hladina se statisticky významně liší mezi ošetřenými a kontrolními skupinami a mezi kmeny.
Metabolity extrahované z mozkového kmene metodou Folch byly derivatizovány pomocí methoximace a silylace (MSTFA + TMCS). Analýza proběhla na GC 7890B spojené s Q-TOF 7200 (EI a PCI režimy). Data se zpracovávala dekonvolucí špiček v MassHunter Qualitative, identifikací ve Fiehn RTL a NIST knihovnách, potvrzením vzorců pomocí FFA/MFG a strukturálním ověřením v Molecular Structure Correlator. Statistické vyhodnocení (PCA, Volcano ploty) a filtraci významných změn zabezpečilo Agilent Mass Profiler Professional.
Pomocí PCA byly zřejmé odlišné klastrování kontrolních a morfinem ošetřených skupin u obou kmenů a také interkmenové rozdíly.
Adenosin se výrazně snížil pouze u morfinem ošetřených citlivých myší (p<0,05). U srovnání kmenů bez morfinu bylo nalezeno 21 metabolitů s významnými rozdíly, včetně adenosinu 5’-monofosfátu, glycerové kyseliny, cholesterolu a neurotransmiteru N-acetylaspartylglutamátu.
U neznámé špičky byla pomocí EI a PCI MS/MS určena empirická formule, chemické addukty v PCI potvrdily molekulární ion a MSC v ChemSpider poskytl strukturu α-hydroxiglutarové kyseliny, která akumulovala v rezistentním kmenu.
Popisovaný workflow kombinuje citlivé měření ve full scanu, přesnou hmotnost, MS/MS selektivitu a pokročilou datovou analýzu. Umožňuje odhalit slabě zastoupené metabolity a potvrdit jejich identitu bez dodatečných standardů. Metoda je použitelná v neurofarmakologii, toxikologii i farmakogenomice.
Netargetovaná GC/Q-TOF metabolomika prokázala citlivost a specifitu při odhalování metabolických změn vyvolaných morfinem a mezi geneticky odlišnými kmeny myší. Workflow potvrzuje vysokou hodnotu kombinace přesné hmotnosti, MS/MS a pokročilého softwaru pro odhalení nových biologických markerů.
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/HRMS, GC/Q-TOF
ZaměřeníMetabolomika, Klinická analýza
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Metabolomika poskytuje přímé informace o biochemickém stavu organismu a umožňuje identifikovat metabolické dráhy ovlivněné léčivy. V případě opiátů se metabolomické změny v mozkové tkáni mohou podílet na mechanismech závislosti, bolesti a tolerance. Studium rozdílů mezi myšími kmeny s různou citlivostí na morfin může odhalit biomarkery a cíle pro terapeutické zásahy.
Cíle a přehled studie
Cílem popsané práce bylo použití netargetovaného GC/Q-TOF metabolomického přístupu k porovnání změn v mozkových metabolitech dvou kmenů myší (morfin-citlivý C57BL/6 a morfin-rezistentní 129Sv1) po aplikaci morfinu. Studie usilovala o identifikaci klíčových sloučenin, jejichž hladina se statisticky významně liší mezi ošetřenými a kontrolními skupinami a mezi kmeny.
Použitá metodika a instrumentace
Metabolity extrahované z mozkového kmene metodou Folch byly derivatizovány pomocí methoximace a silylace (MSTFA + TMCS). Analýza proběhla na GC 7890B spojené s Q-TOF 7200 (EI a PCI režimy). Data se zpracovávala dekonvolucí špiček v MassHunter Qualitative, identifikací ve Fiehn RTL a NIST knihovnách, potvrzením vzorců pomocí FFA/MFG a strukturálním ověřením v Molecular Structure Correlator. Statistické vyhodnocení (PCA, Volcano ploty) a filtraci významných změn zabezpečilo Agilent Mass Profiler Professional.
Použitá instrumentace
- Agilent 7890B GC
- Agilent 7200 GC/Q-TOF MS
- MassHunter Qualitative Analysis, Mass Profiler Professional, Molecular Structure Correlator
Hlavní výsledky a diskuse
Pomocí PCA byly zřejmé odlišné klastrování kontrolních a morfinem ošetřených skupin u obou kmenů a také interkmenové rozdíly.
Adenosin se výrazně snížil pouze u morfinem ošetřených citlivých myší (p<0,05). U srovnání kmenů bez morfinu bylo nalezeno 21 metabolitů s významnými rozdíly, včetně adenosinu 5’-monofosfátu, glycerové kyseliny, cholesterolu a neurotransmiteru N-acetylaspartylglutamátu.
U neznámé špičky byla pomocí EI a PCI MS/MS určena empirická formule, chemické addukty v PCI potvrdily molekulární ion a MSC v ChemSpider poskytl strukturu α-hydroxiglutarové kyseliny, která akumulovala v rezistentním kmenu.
Přínosy a praktické využití metody
Popisovaný workflow kombinuje citlivé měření ve full scanu, přesnou hmotnost, MS/MS selektivitu a pokročilou datovou analýzu. Umožňuje odhalit slabě zastoupené metabolity a potvrdit jejich identitu bez dodatečných standardů. Metoda je použitelná v neurofarmakologii, toxikologii i farmakogenomice.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace LC/MS a GC/MS pro širší pokrytí polarních i nepolárních metabolitů.
- Rozšíření databází s RT locked knihovnami a hlubší využití AI pro strukturu sloučenin.
- Kombinace metabolomiky s transkriptomikou a proteomikou pro komplexní pohled na biologické účinky léčiv.
Závěr
Netargetovaná GC/Q-TOF metabolomika prokázala citlivost a specifitu při odhalování metabolických změn vyvolaných morfinem a mezi geneticky odlišnými kmeny myší. Workflow potvrzuje vysokou hodnotu kombinace přesné hmotnosti, MS/MS a pokročilého softwaru pro odhalení nových biologických markerů.
Reference
- Folch J., Lees M., Sloane Stanley G.H. A simple method for the isolation and purification of total lipids from animal tissues. J Biol Chem. 226, 497–509 (1957).
- Liang D., Liao G., Wang J., Usuka J., Guo Y.Y., Peltz G., Clark J.D. A genetic analysis of opioid-induced hyperalgesia in mice. Anesthesiology. 104, 1054–1062 (2006a).
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Metabolomics of Carbon-Fixing Mutants of Cyanobacteria by GC/Q-TOF
2013|Agilent Technologies|Aplikace
Metabolomics of Carbon-Fixing Mutants of Cyanobacteria by GC/Q-TOF Application Note Biofuel Authors Dong Hee Chung, Christine Rabinovitch-Deere, and Shota Atsumi Department of Chemistry University of California-Davis, Davis, CA Sofia Aronova Agilent Technologies, Inc. Santa Clara, CA Abstract Mutants of the…
Klíčová slova
mutants, mutantsmetabolomics, metabolomicsmetabolite, metabolitecyanobacteria, cyanobacteriadifferences, differencesmass, masswild, wildstrains, strainsdeconvolution, deconvolutionwere, weremasshunter, masshunterpathways, pathwaysuntargeted, untargetedmetabolic, metabolicfiehn
Olive Oil Characterization using Agilent GC/Q-TOF MS and Mass Profiler Professional Software
2012|Agilent Technologies|Aplikace
Olive Oil Characterization using Agilent GC/Q-TOF MS and Mass Profiler Professional Software Application Note Food Testing & Agriculture Authors Abstract Stephan Baumann, A model was constructed that predicts whether an olive oil will pass the extra virgin Sofia Aronova sensory…
Klíčová slova
olive, olivemodel, modelscents, scentsoil, oilclassification, classificationfold, foldstatistical, statisticalwhether, whethermass, masspredict, predictnist, nistdata, datasensory, sensoryevoo, evooprofiler
Characterization and Classification of Heroin from Illicit Drug Seizures Using the Agilent 7200 GC/Q-TOF
2014|Agilent Technologies|Aplikace
Characterization and Classification of Heroin from Illicit Drug Seizures Using the Agilent 7200 GC/Q-TOF Application Note Forensics Authors Abstract Koluntaev Dmitry An untargeted GC/Q-TOF analysis approach has been used to successfully differen- InterLab Inc. tiate street heroin samples that may…
Klíčová slova
heroin, heroinhydrocotarnine, hydrocotarninealkaloids, alkaloidsstreet, streetpapaverine, papaverinecodeine, codeineprediction, predictionpca, pcasni, snitolycaine, tolycaineminor, minortwo, twomeconine, meconinemorphine, morphinewere
Metabolic Profiling of Yeast Sterols Using the Agilent 7200 Series GC/Q-TOF System
2012|Agilent Technologies|Aplikace
Metabolic Profiling of Yeast Sterols Using the Agilent 7200 Series GC/Q-TOF System Application Note Metabolomics Authors Abstract Manhong Wu, Robert St. Onge, Metabolic profiling of yeast sterols to precisely determine enzymatic targets for new potential antifungal drugs was performed using…
Klíčová slova
ergosterol, ergosterolantifungal, antifungalzymosterol, zymosterollanosterol, lanosterolsqualene, squalenetotarol, totarolfluconazole, fluconazoleaccumulated, accumulatedmetabolites, metabolitesterbinafine, terbinafineyeast, yeastbiosynthesis, biosynthesissterols, sterolsuntargeted, untargetedmass