MIDI Library Plate-grown Anaerobes

Význam tématu

Stabilní a rychlá identifikace anaerobních bakterií je klíčová v klinické diagnostice, průmyslové mikrobiologii a environmentálních studiích. Anaerobní mikroorganismy ovlivňují lidský mikrobiom, mohou být patogeny a zároveň nacházejí uplatnění v biotechnologických procesech, proto je jejich přesná klasifikace zásadní.

Cíle a přehled studie / článku

Cílem je představit knihovnu BHIBLA verze 3.80 spolu s metodou ANAER6, která poskytuje profil mastných kyselin (FAME) pro 156 kmenů anaerobních bakterií. Databáze usnadňuje rozlišení a identifikaci širokého spektra rodů a podskupin.

Použitá metodika a instrumentace

• Analýza mastných kyselin (FAME) extrahovaných z bakteriální biomasy.
• Separace pomocí plynové chromatografie (GC) a detekce plamenovou ionizací (FID) v rámci systému pro mikrobiální identifikaci (např. MIDI Sherlock).
• Validace přesnosti a konzistence dat prostřednictvím MIDI Calibration Mix.

Hlavní výsledky a diskuse

• Knihovna zahrnuje 156 záznamů napříč rody Actinomyces, Bacteroides, Clostridium, Fusobacterium, Prevotella, Streptococcus a dalšími.
• Použití podskupin GC subgroup A/B umožňuje lepší rozlišení příbuzných kmenů a zvýšení selektivity identifikace.
• Implementace standardního kalibračního mixu zajišťuje opakovatelnost a mezinárodní srovnatelnost výsledků.

Přínosy a praktické využití metody

• Urychlení a standardizace identifikace anaerobních patogenů v klinických laboratořích.
• Zvýšení spolehlivosti mikrobiologických testů v potravinářském, farmaceutickém i environmentálním sektoru.
• Možnost sdílení a porovnávání výsledků mezi různými pracovišti díky jednotné databázi.

Budoucí trendy a možnosti využití

• Propojení FAME metod s molekulárními technikami (sekvenování, MALDI-TOF) pro komplexní identifikaci.
• Pravidelná aktualizace databáze o nové kmeny, klinické a environmentální izoláty.
• Nasazení strojového učení pro automatizovanou klasifikaci a predikci fenotypových znaků bakterií.

Závěr

Knihovna BHIBLA verze 3.80 s metodou ANAER6 je robustním a rozsáhlým nástrojem pro FAME analýzu anaerobních bakterií. Díky standardizovanému přístupu významně zlepšuje přesnost, rychlost i reprodukovatelnost mikrobiologické identifikace.