MIDI Library Clinical Aerobes
Ostatní | | MIDIInstrumentace
Identifikace mikroorganismů v klinické a průmyslové praxi je zásadní pro správnou diagnostiku, epidemiologii i kontrolu kvality. Knihovna RCLIN6 představuje rozsáhlý referenční soubor profilů mastných kyselin bakteriálních buněčných stěn, umožňující rychlou a spolehlivou diferenciaci stovek bakteriálních druhů na základě jejich chemotaxonomického podpisu.
Cílem prezentace knihovny RCLIN6 ve verzi 6.20 je ukázat její rozsah, rozmanitost zahrnutých taxonů a použití při chromatografické analýze mastných kyselin. Text poskytuje seznam 593 záznamů zahrnujících Gram-negativní i Gram-pozitivní bakterie, patogeny i environmentální druhy.
Metoda je založena na extrakci a derivatizaci mastných kyselin z bakteriálních buněk do podoby metylesterů (FAME), následované separací na plynové chromatografii s plamenovou ionizační detekcí. Profil peaků je porovnáván se vzorci uloženými v softwaru Sherlock MIS nebo obdobných systémech pro rychlou identifikaci.
Knihovna obsahuje široké spektrum rodů a druhů včetně Achromobacter, Acinetobacter, Bacillus, Campylobacter, Enterobacteriaceae, Listeria, Mycobacterium, Pseudomonas, Streptococcus, Staphylococcus a mnoha dalších. Díky velkému počtu referencí lze dosáhnout vysoké přesnosti identifikace i u příbuzných biotypů.
Rozšiřování databáze o nové druhy a biotypy, integrace s hmotnostní spektrometrií (GC-MS) a nasazení pokročilých algoritmů strojového učení pro automatizovanou klasifikaci. Větší provázání s genomickými databázemi a on-line sdílení profilů umožní rychlejší reakci na nové patogeny.
Knihovna RCLIN6 verze 6.20 představuje robustní a osvědčený nástroj pro chemotaxonomickou identifikaci bakterií. Její rozsah a kvalita referencí zajišťují spolehlivé rozlišení stovek mikroorganismů a podporují široké spektrum aplikací v mikrobiologii.
Žádné specifické literární odkazy uvedeny v původním textu.
Software
ZaměřeníVýrobceMIDI
Souhrn
Význam tématu
Identifikace mikroorganismů v klinické a průmyslové praxi je zásadní pro správnou diagnostiku, epidemiologii i kontrolu kvality. Knihovna RCLIN6 představuje rozsáhlý referenční soubor profilů mastných kyselin bakteriálních buněčných stěn, umožňující rychlou a spolehlivou diferenciaci stovek bakteriálních druhů na základě jejich chemotaxonomického podpisu.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem prezentace knihovny RCLIN6 ve verzi 6.20 je ukázat její rozsah, rozmanitost zahrnutých taxonů a použití při chromatografické analýze mastných kyselin. Text poskytuje seznam 593 záznamů zahrnujících Gram-negativní i Gram-pozitivní bakterie, patogeny i environmentální druhy.
Použitá metodika a instrumentace
Metoda je založena na extrakci a derivatizaci mastných kyselin z bakteriálních buněk do podoby metylesterů (FAME), následované separací na plynové chromatografii s plamenovou ionizační detekcí. Profil peaků je porovnáván se vzorci uloženými v softwaru Sherlock MIS nebo obdobných systémech pro rychlou identifikaci.
Hlavní výsledky a diskuse
Knihovna obsahuje široké spektrum rodů a druhů včetně Achromobacter, Acinetobacter, Bacillus, Campylobacter, Enterobacteriaceae, Listeria, Mycobacterium, Pseudomonas, Streptococcus, Staphylococcus a mnoha dalších. Díky velkému počtu referencí lze dosáhnout vysoké přesnosti identifikace i u příbuzných biotypů.
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá a vysoce reprodukovatelná identifikace bakterií v klinických laboratořích.
- Podpora procesní kontroly v potravinářství a farmacii.
- Možnost sledování epidemiologických vztahů pomocí chemotaxonomických dat.
Budoucí trendy a možnosti využití
Rozšiřování databáze o nové druhy a biotypy, integrace s hmotnostní spektrometrií (GC-MS) a nasazení pokročilých algoritmů strojového učení pro automatizovanou klasifikaci. Větší provázání s genomickými databázemi a on-line sdílení profilů umožní rychlejší reakci na nové patogeny.
Závěr
Knihovna RCLIN6 verze 6.20 představuje robustní a osvědčený nástroj pro chemotaxonomickou identifikaci bakterií. Její rozsah a kvalita referencí zajišťují spolehlivé rozlišení stovek mikroorganismů a podporují široké spektrum aplikací v mikrobiologii.
Reference
Žádné specifické literární odkazy uvedeny v původním textu.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
MIDI Sherlock E-FAME Libraries
|MIDI|Ostatní
Sherlock E-FAME Libraries EBA1 – Growth on Blood Agar @ 30°C ETSA1 – Growth on TSA Agar @ 30°C Genus-species Achromobacter-denitrificans Achromobacter-xylosoxidans Acidovorax-avenae Acidovorax-delafieldii Acinetobacter-baumannii Acinetobacter-calcoaceticus Acinetobacter-haemolyticus Acinetobacter-johnsonii Acinetobacter-lwoffii Acinetobacter-radioresistens Actinobacillus-lignieresii Actinobacillus-ureae Aeromonas-hydrophila Aeromonas-salmonicida Alcaligenes-faecalis Amycolatopsis-orientalis Arthrobacter-globiformis Arthrobacter-oxydans Arthrobacter-pascens Aspergillus-brasiliensis…
Klíčová slova
staphylococcus, staphylococcusmicrobacterium, microbacteriumcorynebacterium, corynebacteriumbacillus, bacillusstreptococcus, streptococcuspseudomonas, pseudomonasneisseria, neisseriamethylobacterium, methylobacteriummycobacterium, mycobacteriumgenus, genusyersinia, yersiniaacinetobacter, acinetobactermoraxella, moraxellaenterobacter, enterobacterpaenibacillus
MIDI Library Environmental Aerobes
|MIDI|Ostatní
Library: RTSBA6 Entry 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37…
Klíčová slova
subgroup, subgroupbacillus, bacilluspseudomonas, pseudomonasxanthomonas, xanthomonasstaphylococcus, staphylococcusmrsa, mrsalactobacillus, lactobacilluscorynebacterium, corynebacteriumaxonopodis, axonopodisvibrio, vibriorhodococcus, rhodococcusnocardia, nocardiapaenibacillus, paenibacillusmycobacterium, mycobacteriummicrobacterium
MIDI Sherlock DNA libraries
2008|MIDI|Ostatní
DNA Library Lists – June 2008 The following Sherlock DNA libraries are described in this document: 1. D16S2, 500 bp, 16S rRNA gene bacterial library, version 2.10 2. MD16S2, 16S rRNA full gene bacterial library, version 2.10 3. FY28S2, 28S…
Klíčová slova
bacillus, bacilluscontinued, continuedpasteurella, pasteurellapseudomonas, pseudomonassphingomonas, sphingomonaslactobacillus, lactobacilluscytophaga, cytophagaaquaspirillum, aquaspirillumnocardia, nocardiahaemophilus, haemophilusactinoplanes, actinoplanesralstonia, ralstoniaalcaligenes, alcaligenesenterobacter, enterobacteragrobacterium
MIDI Library Broth-grown Anaerobes
|MIDI|Ostatní
Library: MOORE6 Version: 6.00 Entry 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35…
Klíčová slova
subgroup, subgroupclostridium, clostridiumeubacterium, eubacteriumlactobacillus, lactobacillusbacteroides, bacteroidespeptostreptococcus, peptostreptococcusbifidobacterium, bifidobacteriumruminococcus, ruminococcusfusobacterium, fusobacteriumprevotella, prevotellastreptococcus, streptococcuscampylobacter, campylobactertreponema, treponemaselenomonas, selenomonaspropionibacterium