MIDI Library Environmental Aerobes
Ostatní | | MIDIInstrumentace
Software
ZaměřeníVýrobceMIDI
Souhrn
Význam tématu
Databáze mastných kyselin mikroorganismů je klíčová pro spolehlivou a rychlou identifikaci bakteriálních kmenů v řadě oborů, od klinické mikrobiologie přes potravinářský průmysl až po environmentální monitoring.Cíle a přehled studie / článku
Představit obsah a rozsah knihovny RTSBA6 verze 6.21, která obsahuje více než 900 taxonů bakterií a aktinomycet, a vysvětlit její význam pro rutinní i výzkumné aplikace metodou analýzy mastných kyselin (FAME).Použitá metodika a instrumentace
- Metoda: Plynová chromatografie mastných kyselin membránových lipidů mikroorganismů.
- Instrumentace: Plynový chromatograf vybaven kapilárními kolonkami pro FAME analýzu, detektor plamenné ionizace (FID) a sofistikované softwarové vybavení pro porovnání profilů s databází RTSBA6.
Hlavní výsledky a diskuse
- Knihovna obsahuje detailní profily pro 916 taxonů pokrývajících široké spektrum bakteriálních rodů a podrodů.
- Jednotlivé záznamy zahrnují gram-pozitivní i gram-negativní bakterie, fakultativní, anaerobní i aerobní mikroorganismy.
- Díky rozdělení do genomoskupin a biotypů je možné dosáhnout vysoké úrovně rozlišení blízce příbuzných druhů.
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá a relativně levná identifikace kmenů bez nutnosti molekulárně-biologických postupů.
- Podpora QA/QC v potravinářství, výrobě léčiv či vodohospodářských zařízeních.
- Uplatnění v ekologických studiích k monitoringu složení mikrobiálních společenstev.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace umělé inteligence a strojového učení pro automatické rozpoznávání profilů.
- Rozšíření databáze o nové patogenní i průmyslově významné kmeny.
- Propojení FAME dat s genomickými a metabolomickými informacemi pro komplexnější taxonomii.
Závěr
Databáze RTSBA6 verze 6.21 představuje robustní nástroj pro identifikaci bakterií na základě FAME profilů. Její rozmanitost a detailní členění podporují široké spektrum aplikací v analytické chemii mikrobiologie.Reference
Nejsou uvedeny specifické literární zdroje.Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
MIDI Sherlock E-FAME Libraries
|MIDI|Ostatní
Sherlock E-FAME Libraries EBA1 – Growth on Blood Agar @ 30°C ETSA1 – Growth on TSA Agar @ 30°C Genus-species Achromobacter-denitrificans Achromobacter-xylosoxidans Acidovorax-avenae Acidovorax-delafieldii Acinetobacter-baumannii Acinetobacter-calcoaceticus Acinetobacter-haemolyticus Acinetobacter-johnsonii Acinetobacter-lwoffii Acinetobacter-radioresistens Actinobacillus-lignieresii Actinobacillus-ureae Aeromonas-hydrophila Aeromonas-salmonicida Alcaligenes-faecalis Amycolatopsis-orientalis Arthrobacter-globiformis Arthrobacter-oxydans Arthrobacter-pascens Aspergillus-brasiliensis…
Klíčová slova
staphylococcus, staphylococcusmicrobacterium, microbacteriumcorynebacterium, corynebacteriumbacillus, bacillusstreptococcus, streptococcuspseudomonas, pseudomonasneisseria, neisseriamethylobacterium, methylobacteriummycobacterium, mycobacteriumgenus, genusyersinia, yersiniaacinetobacter, acinetobactermoraxella, moraxellaenterobacter, enterobacterpaenibacillus
MIDI Library Clinical Aerobes
|MIDI|Ostatní
Library: RCLIN6 Entry 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37…
Klíčová slova
subgroup, subgroupbyce, bycestreptococcus, streptococcusstaphylococcus, staphylococcuslegionella, legionellacorynebacterium, corynebacteriumgrown, grownmycobacterium, mycobacteriumbacillus, bacilluspseudomonas, pseudomonasmedium, mediumenterobacter, enterobacterenterococcus, enterococcusmoraxella, moraxellaneisseria
MIDI Sherlock DNA libraries
2008|MIDI|Ostatní
DNA Library Lists – June 2008 The following Sherlock DNA libraries are described in this document: 1. D16S2, 500 bp, 16S rRNA gene bacterial library, version 2.10 2. MD16S2, 16S rRNA full gene bacterial library, version 2.10 3. FY28S2, 28S…
Klíčová slova
bacillus, bacilluscontinued, continuedpasteurella, pasteurellapseudomonas, pseudomonassphingomonas, sphingomonaslactobacillus, lactobacilluscytophaga, cytophagaaquaspirillum, aquaspirillumnocardia, nocardiahaemophilus, haemophilusactinoplanes, actinoplanesralstonia, ralstoniaalcaligenes, alcaligenesenterobacter, enterobacteragrobacterium
MIDI Library Broth-grown Anaerobes
|MIDI|Ostatní
Library: MOORE6 Version: 6.00 Entry 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35…
Klíčová slova
subgroup, subgroupclostridium, clostridiumeubacterium, eubacteriumlactobacillus, lactobacillusbacteroides, bacteroidespeptostreptococcus, peptostreptococcusbifidobacterium, bifidobacteriumruminococcus, ruminococcusfusobacterium, fusobacteriumprevotella, prevotellastreptococcus, streptococcuscampylobacter, campylobactertreponema, treponemaselenomonas, selenomonaspropionibacterium