Uživatelské rozhraní obsahuje testy, které jsou spustitelné manuálně a slouží především pro kontrolu vybraných parametrů inletů a detektorů.
Plynový chromatograf pravidelně monitoruje a reportuje parametry (napětí, tlak, teplota…) vybraných modulů, mezi které patří například detektory, EPC moduly nebo topná tělesa.
GC systém je pravidelně monitorován, data jsou ukládána do vnitřní paměti a poté vyhodnocována. V případě, že získané výsledky (retenční čas, plocha píku, výška píku, tvar píku, šum, rozlišení…) se nacházejí mimo povolené rozmezí, je právě probíhající sekvence zastavena, a to z důvodu zabránění ztráty dalších vzorků.
GC systém sleduje životnost spotřebního materiálu, a to v závislosti na počtu provedených analýz a také doby použití. Příčinou velkého množství problémů je nadužívání spotřebního materiálu, a to především sept či linerů. V případě překročení doporučených hodnot systém vydá upozornění a doporučí výměnu, čímž se zabrání potencionálním problémům. Tato funkce zároveň zabrání i zbytečným výměnám sept či linerů, které některé laboratoře provádí v určitých periodách rutinně, a to bez ohledu na jejich reálné využití, což zbytečně zvyšuje náklady na provoz přístroje.
Ovládací panel plynového chromatografu zobrazuje podrobně popsané postupy pro provádění běžných úkonů údržby plynového chromatografu.
Agilent 8860 byl navržen tak, aby svým uživatelům poskytoval spolehlivé výsledky při rutinních analýzách, a to s minimálními požadavky na obsluhu a nízkými náklady na údržbu. Agilent 8860 nabízí plnohodnotnou elektronickou kontrolu průtoku všech plynů pro inlety i detektory, a to prostřednictvím EPC modulu (electronic pressure control). Jedná se již o šestou generaci této technologie, která umožňuje regulovat tlak s přesností 0,01 psi. Zaručena je tak výborná přesnost a opakovatelnost GC analýz. Retenční časy jsou tak získávány s opakovatelností lepší než 0,06 %. Opakovatelnost plochy píku je lepší než 2 %. Agilent 8860 je plně softwarově řízený plynový chromatograf s možností přímého nastavení metody prostřednictvím dotykového rozhraní integrovaném na předním panelu přístroje. Displej zobrazuje informace o právě probíhající analýze, sekvenci, nastavených podmínkách a stavu přístroje. Toto rozhraní také zprostředkovává přístup k údržbě přístroje.
Plynový chromatograf Agilent 8860 lze ovládat prostřednictvím všech dostupných verzí SW Agilent OpenLab CDS (Workstation, ChemStation a EZChrom). Pro analýzu a zpracování naměřených dat u jednoduchých aplikací lze využít nový software Agilent Data Analysis (DA) Express. Předností tohto softwaru je nejen velmi jednoduchá obsluha, ale také i nízka cena. Software DA Express je rozdělen do pěti oken.