Analyzujte GC×GC TOF-MS data pomocí Fisherových poměrů v ChromaTOF Tile software

Objem dat získaných pomocí GCxGC může rychle narůst nad zvladatelnou mez. Pokud chceme statisticky porovnávat i nejmenší rozdíly v naměřených datech, tak narážíme na lidské možnosti při vyhodnocování. Při opravdu důkladném porovnávání může jediný vzorek zabrat i několik týdnů usilovné práce a i tyto výsledky trpí falešnými pozitivitami z normálních chromatografických odchylek.

„Celá moje výzkumná skupina na University of Washington v Seattlu s potěšením sleduje , jak software ChromaTOF Tile pomáhá s interpretací výsledků našich výzkumů. Očekáváme, že pro komunitu uživatelů GCxGC bude tento nástroj pro analýzu dat velkým přínosem a pomůže vyřešit řadu problémů spojených s analýzou sad komplexních dat.“

Robert E. Synovec (profesor chemie, University of Washington)

ChromaTOF Tile přináší revoluci v analýze GCxGC dat. Tento software porovnává soubory GCxGC dat automaticky, rychle a snadno. Statisticky významné rozdíly vytáhne a zvýrazní a vy tak můžete věnovat méně času pracnému hledání rozdílů a více času tomu, co tyto rozdíly znamenají.

„Nejmodernější analytické metody, jako například komplexní dvojrozměrná GCxGC-TOF MS analýza, mohou snadno generovat obrovské množství dat, ale teprve software ChromaTOF Tile nám umožní z těchto dat vybrat skutečně užitečné informace.

Hans-Gerd Janssen (vedoucí výzkumník Unilever Research, profesor interpretační analytické chemie, Wageningen University & Research a Ed Rosing, výzkumník v oblasti analýzy chuti, Unilever R&D)

Princip

Problém: Porovnávání sad chromatogramů může být únavný a zdlouhavý proces. Při nutnosti kompenzace chromatografických variací a tisícovek analytů může i automatická identifikace vzorků trvat dny, týdny nebo i měsíce. Zákazníci nás žádali o způsob, jak analýzu dat urychlit.

Řešení: S využitím dat zákazníků (reálných vzorků) jsme se pustili do hledání řešení. Při konzultacích s prof. Robertem Synovecem jsme zjistili, že když použijeme Fisherovy poměry, můžeme data rozdělit na sadu regionů („dlaždic“) a potom porovnávat regionalizovaná data (podle dlaždic) namísto jednotlivých pixelů.

LECO: ChromaTOF Tile - rozdělení dat na sadu regionů („dlaždic“)

Po zprůměrování hodnot v regionu náš software ChromaTOF Tile porovná dva odpovídající regiony a vyhodnotí rozdíl hodnot mezi nimi. Software grafickými prostředky ukazuje uživatelům indikátory nízkých až vysokých odchylek mezi regiony.

„Při zkoumání aerosolů nás běžně zajímají rozdíly mezi několika sadami vzorků, když například chceme porovnat různé zdroje nebo různé režimy stárnutí na vzduchu. Pro tyto účely se software ChromaTOF Tile rychle ukázal být velmi praktickým a přímočarým nástrojem k vyhodnocování komplexních GCxGC dat.“

Elena Hartner (postgraduální studentka, Joint Mass Spectrometry Centre, University Rostock a Helmholtz Zentrum München)

Tyto grafické teplotní mapy snadno a rychle sdělí uživatelům, které oblasti mají vysoké odchylky, případně které oblasti ho mají nejvíce zajímat. Uživatelé nemusejí ztrácet čas hledáním odlehlých bodů v datech. Ve vizuální prezentaci lze vidět, kde jsou rozdíly a která data jsou v porovnání důležitá.

LECO: ChromaTOF Tile - grafické teplotní mapy

ChromaTOF Tile nemění dodaná data. Porovnáváním dlaždic/regionů namísto pixelů lépe ukazuje jen významné rozdíly mezi dodanými sadami dat.

„Při provádění studií zjišťování biomarkerů nás zkreslení v datech (např. efekt jednotlivých batch) může snadno nasměrovat špatným směrem. Možnosti PCA analýzy v softwaru ChromaTOF Tile nabízí rychlý a výkonný způsob, jak zobrazit strukturu vašich dat, včetně inherentních zkreslení obsažených v této struktuře. To dává uživatelům příležitost zanést kompenzace pro tato zkreslení, před nebo po statistické analýze, a zlepšit tak robustnost hledaní biomarkerů.“

Heather D. Bean (docentka na School of Life Science, Arizona State University)

Přehled literatury a webinářů software ChromaTOF Tile v knihovně LabRulezGCMS

• 22. Škola MS: ChromaTOF Tile uživatelsky přívětivé vyhledávání rozdílů v „omických“ datech měřených v GC×GC (Prezentace | 2021)

• Comprehensive Evaluation of Pesto Aroma Profiles Using SPME-GCxGC-TOFMS (Aplikace | 2022 | LECO)

• ChromaTOF Tile - Turning GCxGC Data into Chemistry (Brožury a specifikace | 2021)

• Statistical Differentiation of Pesto Products Using SPME-GCxGC-TOFMS and ChromaTOF Tile Software (Aplikace | 2022)

• Differentiation of Regular and Barrel-Aged Maple Syrups with ChromaTOF Tile (Aplikace | 2021)

• LECO PEGASUS BT Series GC-TOFMS (Brožury a specifikace | 2022)

• LECO Corporate Product Overview (Ostatní | 2022)

• FOOD TESTING APPLICATIONS eBook (Příručky | 2020)

1. Enhanced GC-MS Workflow Solutions Webinar - GC-MS Analysis Workflow

• ZÁZNAM | Proběhlo St, 30.11.2022

Naučte se ověřené přístupy pro vylepšení vašich jednorozměrných a GCxGC aplikací v plynové chromatografii (GC-MS a GCxGC-MS) od GC-TOFMS odborníků v této sbírce krátkých webinářů.

2. 1st North American GCxGC Symposium & Workshop - Day 1: General GCxGC - Discovery-Based Analysis of GC×GC-TOFMS Data using Tile-Based Fisher Ratio Software

• ZÁZNAM | Proběhlo Po, 14.9.2020

Bezplatný 4 denní virtuální seminář zaměřený na techniku GCxGC a spojení GCxGC s hmotnostními spektrometry LECO Pegasus 4D, BT 4D a HRT+4D.