LECO ChromaTOF Tile vyhledávání rozdílů v „omických“ GCxGC datech (22. Škola hmotnostní spektrometrie)

Po, 13.9.2021
| Originální článek z: LECO/Pavel Jiroš
Vyhodnocování a hledání rozdílů ve skupinách komplexní GCxGC dat je nyní pomocí nového software LECO ChromaTOF Tile otázka minut, místo hodin nebo dokonce dnů.
  • Foto: LECO: LECO ChromaTOF Tile vyhledávání rozdílů v „omických“ GCxGC datech (22. Škola hmotnostní spektrometrie)
  • Video: LecoCorporation: ChromaTOF Tile Product Video

Objem dat získaných pomocí GCxGC může rychle narůst nad zvladatelnou mez. Pokud chceme statisticky porovnávat i nejmenší rozdíly v naměřených datech, tak narážíme na lidské možnosti při vyhodnocování. Při opravdu důkladném porovnávání může jediný vzorek zabrat i několik týdnů usilovné práce a i tyto výsledky trpí falešnými pozitivitami z normálních chromatografických odchylek.

„ChromaTOF Tile je skvělá pomůcka, která zkrátila dobu porovnávání píků ve skupině z 10 dní na 10 minut. S tímto SW nástrojem jsme nyní schopni porovnávat skupiny vzorků s mnoha píky z komplexních studií, což by dříve bylo možno pouze za nasazení enormního lidského úsilí.“

ChromaTOF Tile přináší revoluci v analýze GCxGC dat. Tento software porovnává soubory GCxGC dat automaticky, rychle a snadno. Statisticky významné rozdíly vyplují na povrch, takže můžete věnovat méně času na odhalování rozdílů a více času tomu, co ty rozdíly znamenají.

„Já a celá moje výzkumná skupina na University of Washington v Seattlu s potěšením sleduje, jak náš výzkum dospěl k vzniku software ChromaTOF Tile, který pomáhá s interpretací výsledků nejen našich výzkumů. Očekáváme, že pro komunitu uživatelů techniky GCxGC bude tento nástroj velkým přínosem a pomůže vyřešit řadu problémů spojených s analýzou komplexních sad dat.“ (Robert E. Synovec, profesor chemie, University of Washington)

Problém:

Porovnávání sad chromatogramů může být únavný a zdlouhavý proces. Při nutnosti kompenzace chybného chromatografického zarovnání a s tisícovkami analytů může i automatická identifikace vzorků trvat dny, týdny nebo i měsíce. Zákazníci nás žádali o způsob, jak analýzu dat urychlit.

„Při zkoumání aerosolů nás běžně zajímají rozdíly mezi několika sadami vzorků, když například chceme porovnat různé zdroje nebo různé režimy stárnutí na vzduchu. Pro tyto účely se software ChromaTOF Tile rychle ukázal být velmi praktickým a přímočarým nástrojem k vyhodnocování komplexních GCxGC dat.“ (Elena Hartner, PhD studentka, Joint Mass Spectrometry Centre, University Rostock a Helmholtz Zentrum München)

Řešení:

S využitím dat zákazníků (reálných vzorků) jsme se pustili do hledání řešení. Při konzultacích s doktorem Robertem Synovecem jsme zjistili, že když použijeme Fisherovy poměry, můžeme data rozdělit na sadu regionů („dlaždic“) a potom porovnávat regionalizovaná data (podle dlaždic) namísto jednotlivých pixelů.

„Nejmodernější analytické metody, jako například komprehensivní 2D GC-TOF MS, mohou snadno generovat obrovské množství dat, ale teprve software ChromaTOF Tile nám umožní z těchto dat vybrat skutečně užitečné informace.“ (Hans-Gerd Janssen, vedoucí výzkumník Unilever Research, profesor interpretační analytické chemie, Wageningen University & Research a Ed Rosing, výzkumník v oblasti analýzy chuti, Unilever R&D)

LECO: ChromaTOF Tile - rozdělení dat na sadu regionů („dlaždic“)

Po zprůměrování hodnot v regionu náš software ChromaTOF Tile porovná dva odpovídající regiony a vyhodnotí rozdíl hodnot mezi nimi. Software grafickými prostředky ukazuje uživatelům indikátory nízkých až vysokých odchylek mezi regiony.

„Při provádění studií zjišťování biomarkerů nás zkreslení v datech (např. batch effects) může snadno svést na špatnou cestu. Možnosti analýzy PCA v softwaru ChromaTOF Tile nabízí rychlý a výkonný způsob, jak zobrazit strukturu vašich dat, včetně inherentních zkreslení obsažených v této struktuře. To dává uživatelům příležitost zanést kompenzace pro tato zkreslení, před nebo po statistické analýze, a zlepšit tak robustnost zjištění hledaných biomarkerů.“ (Heather D. Bean, doc. na School of Life Science, Arizona State University)

Tyto grafické teplotní mapy snadno a rychle sdělí uživatelům, které oblasti mají vysoké odchylky, případně které oblasti ho mají nejvíce zajímat. Uživatelé nemusejí ztrácet čas hledáním odlehlých bodů v datech. Ve vizuální prezentaci lze vidět, kde jsou rozdíly a která data jsou v porovnání důležitá.

LECO: ChromaTOF Tile - grafické teplotní mapy

Spektroskopická společnost Jana Marka Marci
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis and Characterization of ARC’s Injet Methanizer for Permanent Gases, Carbon Dioxide, and Light Hydrocarbons

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
GC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Estimation of Ethylene Oxide and Ethylene Chlorohydrin in Sesame Seeds Using Agilent 8890 GC and 7000D Triple Quadupole MS System

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Fast Pesticide Residue Analysis in Food with a Benchtop GC-TOFMS

Aplikace
| 2021 | LECO
Instrumentace
GC/MSD, GC/TOF
Výrobce
Agilent Technologies, LECO
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Trace Level Quantitation of 6 Nitrosamines in Metformin API by Dynamic Headspace GC-MS/MS

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, HeadSpace, GC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Determination of Volatile Organic Compounds in Water by Purge and Trap Gas Chromatography/Mass Spectrometry

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, Purge and Trap, GC/SQ
Výrobce
Agilent Technologies, Tekmar Teledyne
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Nejbližší akce | Webináře

První severoamerické GCxGC Symposium & Workshop

Bezplatný 4 denní virtuální seminář zaměřený na techniku GCxGC a spojení GCxGC s hmotnostními spektrometry LECO Pegasus 4D, BT 4D a HRT+4D.
Článek | Webináře

Webináře: Food, Flavor, and Aroma Forum a GC×GC-HR-TOFMS for untargeted screening of Breathomics

Rádi bychom Vás tímto pozvali na nejbližší webináře věnované problematice analýzy potravin a dechu a využití technologií GCxGC ve spojení s TOF a HR TOF spektromery LECO.
Článek | Nejbližší akce

Program 22. Školy hmotnostní spektrometrie 2021

Dnes odpoledne byl zahájen 22. ročník konference zaměřené především na hmotnostní spektrometrii a separační techniky, Školy hmotnostní spektrometrie. Přinášíme kompletní program v roce 2021.
Článek | Nejbližší akce

22. Škola hmotnostní spektrometrie 2021 - den 5

Poslední pátý den konference patřil plynové chromatografii ve pojení s MS, aplikacím hmotnostní spektrometrie v praxi, ocenění mladých analytiků a ukončení konference.
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis and Characterization of ARC’s Injet Methanizer for Permanent Gases, Carbon Dioxide, and Light Hydrocarbons

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
GC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Estimation of Ethylene Oxide and Ethylene Chlorohydrin in Sesame Seeds Using Agilent 8890 GC and 7000D Triple Quadupole MS System

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Fast Pesticide Residue Analysis in Food with a Benchtop GC-TOFMS

Aplikace
| 2021 | LECO
Instrumentace
GC/MSD, GC/TOF
Výrobce
Agilent Technologies, LECO
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Trace Level Quantitation of 6 Nitrosamines in Metformin API by Dynamic Headspace GC-MS/MS

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, HeadSpace, GC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Determination of Volatile Organic Compounds in Water by Purge and Trap Gas Chromatography/Mass Spectrometry

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, Purge and Trap, GC/SQ
Výrobce
Agilent Technologies, Tekmar Teledyne
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Nejbližší akce | Webináře

První severoamerické GCxGC Symposium & Workshop

Bezplatný 4 denní virtuální seminář zaměřený na techniku GCxGC a spojení GCxGC s hmotnostními spektrometry LECO Pegasus 4D, BT 4D a HRT+4D.
Článek | Webináře

Webináře: Food, Flavor, and Aroma Forum a GC×GC-HR-TOFMS for untargeted screening of Breathomics

Rádi bychom Vás tímto pozvali na nejbližší webináře věnované problematice analýzy potravin a dechu a využití technologií GCxGC ve spojení s TOF a HR TOF spektromery LECO.
Článek | Nejbližší akce

Program 22. Školy hmotnostní spektrometrie 2021

Dnes odpoledne byl zahájen 22. ročník konference zaměřené především na hmotnostní spektrometrii a separační techniky, Školy hmotnostní spektrometrie. Přinášíme kompletní program v roce 2021.
Článek | Nejbližší akce

22. Škola hmotnostní spektrometrie 2021 - den 5

Poslední pátý den konference patřil plynové chromatografii ve pojení s MS, aplikacím hmotnostní spektrometrie v praxi, ocenění mladých analytiků a ukončení konference.
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis and Characterization of ARC’s Injet Methanizer for Permanent Gases, Carbon Dioxide, and Light Hydrocarbons

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
GC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Estimation of Ethylene Oxide and Ethylene Chlorohydrin in Sesame Seeds Using Agilent 8890 GC and 7000D Triple Quadupole MS System

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Fast Pesticide Residue Analysis in Food with a Benchtop GC-TOFMS

Aplikace
| 2021 | LECO
Instrumentace
GC/MSD, GC/TOF
Výrobce
Agilent Technologies, LECO
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Trace Level Quantitation of 6 Nitrosamines in Metformin API by Dynamic Headspace GC-MS/MS

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, HeadSpace, GC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Determination of Volatile Organic Compounds in Water by Purge and Trap Gas Chromatography/Mass Spectrometry

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, Purge and Trap, GC/SQ
Výrobce
Agilent Technologies, Tekmar Teledyne
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Nejbližší akce | Webináře

První severoamerické GCxGC Symposium & Workshop

Bezplatný 4 denní virtuální seminář zaměřený na techniku GCxGC a spojení GCxGC s hmotnostními spektrometry LECO Pegasus 4D, BT 4D a HRT+4D.
Článek | Webináře

Webináře: Food, Flavor, and Aroma Forum a GC×GC-HR-TOFMS for untargeted screening of Breathomics

Rádi bychom Vás tímto pozvali na nejbližší webináře věnované problematice analýzy potravin a dechu a využití technologií GCxGC ve spojení s TOF a HR TOF spektromery LECO.
Článek | Nejbližší akce

Program 22. Školy hmotnostní spektrometrie 2021

Dnes odpoledne byl zahájen 22. ročník konference zaměřené především na hmotnostní spektrometrii a separační techniky, Školy hmotnostní spektrometrie. Přinášíme kompletní program v roce 2021.
Článek | Nejbližší akce

22. Škola hmotnostní spektrometrie 2021 - den 5

Poslední pátý den konference patřil plynové chromatografii ve pojení s MS, aplikacím hmotnostní spektrometrie v praxi, ocenění mladých analytiků a ukončení konference.
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis and Characterization of ARC’s Injet Methanizer for Permanent Gases, Carbon Dioxide, and Light Hydrocarbons

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
GC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Estimation of Ethylene Oxide and Ethylene Chlorohydrin in Sesame Seeds Using Agilent 8890 GC and 7000D Triple Quadupole MS System

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, GC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Fast Pesticide Residue Analysis in Food with a Benchtop GC-TOFMS

Aplikace
| 2021 | LECO
Instrumentace
GC/MSD, GC/TOF
Výrobce
Agilent Technologies, LECO
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Trace Level Quantitation of 6 Nitrosamines in Metformin API by Dynamic Headspace GC-MS/MS

Aplikace
| 2021 | Shimadzu
Instrumentace
GC/MSD, GC/MS/MS, HeadSpace, GC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Determination of Volatile Organic Compounds in Water by Purge and Trap Gas Chromatography/Mass Spectrometry

Aplikace
| 2021 | Agilent Technologies
Instrumentace
GC/MSD, Purge and Trap, GC/SQ
Výrobce
Agilent Technologies, Tekmar Teledyne
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Nejbližší akce | Webináře

První severoamerické GCxGC Symposium & Workshop

Bezplatný 4 denní virtuální seminář zaměřený na techniku GCxGC a spojení GCxGC s hmotnostními spektrometry LECO Pegasus 4D, BT 4D a HRT+4D.
Článek | Webináře

Webináře: Food, Flavor, and Aroma Forum a GC×GC-HR-TOFMS for untargeted screening of Breathomics

Rádi bychom Vás tímto pozvali na nejbližší webináře věnované problematice analýzy potravin a dechu a využití technologií GCxGC ve spojení s TOF a HR TOF spektromery LECO.
Článek | Nejbližší akce

Program 22. Školy hmotnostní spektrometrie 2021

Dnes odpoledne byl zahájen 22. ročník konference zaměřené především na hmotnostní spektrometrii a separační techniky, Školy hmotnostní spektrometrie. Přinášíme kompletní program v roce 2021.
Článek | Nejbližší akce

22. Škola hmotnostní spektrometrie 2021 - den 5

Poslední pátý den konference patřil plynové chromatografii ve pojení s MS, aplikacím hmotnostní spektrometrie v praxi, ocenění mladých analytiků a ukončení konference.
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.