Agilent MassHunter Profinder

Profinder umožňuje rychlé zpracování dat z Agilent GC/MSD, GC/Q-TOF, LC/TOF a LC/Q-TOF, jehož cílem je zjistit možné rozdíly mezi jednotlivými vzorky či skupinami vzorků.

Vyhledávání píků ve vzorcích je založeno na unikátním algoritmu, tzv. Molecular Feature Extraction (MFE), kdy jsou jednotlivé sloučeniny extrahovány na základě hmotnostně-spektrometrických a chromatografických vlastností. Výsledkem je seznam látek zahrnující retenční čas, molekulovou hmotnost, m/z a jejich intenzity. Data mohou být dále zpracována v tzv. rekurzivním módu (Recursive MFE), při kterém jsou kromě přítomných sloučenin označeny také složky chybějící v jednotlivých vzorcích. V rekurzivním módu jsou nejprve propojeny komponenty tvořící jednotlivé sloučeniny napříč všemi vzorky, ze kterých je vytvořen seznam, který je následně použit pro opakovanou cílenou analýzu všech vzorků. Třetí možnost pak představuje tzv. Target MFE, kterou lze využít v případě, kdy jsou předem známy cílové sloučeniny. Při tomto typu analýzy jsou vzorky prohledány s využitím seznamu známých chemických vzorců. Tento přístup umožňuje vysoce selektivní a rychlé zprocesování dat.

Maximální urychlení zpracování dat je podpořeno intuitivním uživatelským rozhraním, který Profinder nabízí. Zpracovaná data je možné revidovat pomocí různých funkcí, které zahrnují např. možnost přeložení více chromatogramů přes sebe, označení vzorků ze stejné skupiny stejnou barvou pro rychlou orientaci ve velkém množství vzorků či možnost manuální reintegrace nalezených píků.

Agilent MassHunter Profinder Workflow

Výsledky získané v MassHunter Profinderu je možné snadno exportovat, a to např. v *.CSV formátu či ve formátu *.CEF, který umožňuje snadné propojení/přenesení dat primárně zpracovaných v Profinderu do dalších Agilentem podporovaných softwarů, jako je např. Mass Profiler Professional (MPP), ve kterém je následně možné pokročilé statistické zpracování a vizualizace dat. Data je možné také exportovat ve formátu *.PFA, který slouží k propojení se softwary jako je Omix Premium.

MassHunter Profinder nabízí řešení při profilování malých molekul, které nachází uplatnění v mnoha aplikacích jako je např. analýza potravin, nápojů, odpadních vod, polymerů či metabolitů. Kromě malých molekul je Profinder možné využít také např. při profilování intaktních proteinů. Pro tento případ Profinder obsahuje speciální algoritmus navržený pro několikanásobně nabitá spektra proteinů.

Ukázka vizualizace výsledků v MassHunter Profinderu. Data jsou uspořádána do několika oken, která je možno dle potřeb uživatele snadno přizpůsobit, tak aby bylo dosaženo maximální efektivity zpracovnání dat.

Profilování proteinů může být využito např. v analýze potravin či základním výzkumu proteinů. Profinder také podporuje kvalitativní flux analýzu dat získaných pomocí Agilent vysokorozlišovacích time-of-flight LC/MS přístrojů. V tomto případě je algoritmus založen na analýze stabilních isotopově značených iontů (isotopologů) a podporuje ¹³C, ¹⁵N nebo ²H isotopové značení. Výsledky jsou pak ve formátu *.PFA exportovány například do Agilent MassHunter VistaFlux softwaru.

MassHunter Profinder je volně dostupný při zakoupení licence softwaru MassHunter či MassProfiler Professional (MPP).