Agilent G3835AA MassHunter Mass Profiler Professional Software - Overview and Data Import Quick Start Guide

Význam tématu

Mass Profiler Professional (MPP) je klíčovým nástrojem pro analýzu komplexních chromatograficko-hmotnostních dat. Umožňuje rychlé zpracování velkých datových souborů z různých MS platforem a je nepostradatelné pro obory jako metabolomika, proteomika, přírodní produkty či environmentální monitoring.

Cíle a přehled studie

Rychlý úvodní průvodce popisuje hlavní funkce MPP: import dat, filtrování, zarovnání, normalizaci a baseline korekci. Zaměřuje se na první kroky s demonstračním projektem „Malaria“, který obsahuje osm vzorků (kontrolní i infikované) a umožňuje osvojit si základní pracovní postup (workflow).

Použitá metodika

• Import dat skrze Data Import Wizard: výběr datového zdroje a souborů (.cef, .mzData, .txt, atd.)
• Filtrování entit dle intenzity, hmotnostního rozsahu, počtu iontů a nábojových stavů
• Retenční a hmotnostní zarovnání s uživatelsky definovanými tolerancemi
• Statistické sumarizace přítomnosti a absence entit v jednotlivých vzorcích (Sample Summary)
• Normalizace vůči vybraným algoritmům nebo externím škálám
• Baseline korekce vůči mediánu všech vzorků nebo vybraným kontrolám

Použitá instrumentace

• Agilent Mass Profiler Professional Software (vydání 2012)
• Kompatibilita s LC/MS a GC/MS přístroji Agilent
• Integrace s MassHunter Qualitative Analysis a osobními databázemi (METLIN, NIST, Fiehn)

Hlavní výsledky a diskuse

Správné nastavení parametrů importu a zpracování vede k vysoce reprodukovatelným seznamům molekulárních entit. Demonstrační data ukázala vyváženou distribuci počtu entit mezi kontrolními a infikovanými vzorky. Data lze okamžitě vizualizovat pomocí profilových grafů, scatter plotů nebo heatmap a posoudit efektivitu zarovnání a normalizace.

Přínosy a praktické využití metody

• Rychlé zpracování rozsáhlých datových souborů přímo na PC
• Pokročilá chemometrie pro objev biomarkerů a diferenciální analýzu
• Možnost budovat a exportovat klasifikační modely pro predikci třídy vzorků
• Integrované cesty k biologickým interpretacím skrze pathway analýzy

Budoucí trendy a možnosti využití

Další vývoj MPP směřuje k automatizaci workflow, cloudovému zpracování a hlubší AI-analýze dat. Plánovaná je rozšířená integrace s veřejnými databázemi, multilevel datová fúze a podpora pokročilých nelineárních přediktivních modelů.

Závěr

MPP nabízí komplexní řešení od importu dat až po pokročilou statistickou a prediktivní analýzu. Díky modulárnímu workflow a široké sadě nástrojů je ideální pro rychlou exploratorní i kvantitativní analýzu MS dat s vysokou reprodukovatelností.

Reference

• Agilent Mass Profiler Professional Manual, Agilent, 2009
• Unbiased Differential Analysis Workflow, Agilent publ. 5990-7067EN, 2011
• Qualitative Analysis Familiarization Guide, Agilent publ. G3336-90018, 2011
• Quantitative Analysis Familiarization Guide, Agilent publ. G3335-90061, 2010