Konfigurace plynového chromatografu může využívat až 4 samostatné kanály.
Nástřikový port neobsahuje žádné pohyblivé části, umožňuje zpětný proplach a jeho teplota může být nastavena až na hodnotu 110 °C, a to pro zabránění diskriminace vyšších uhlovodíků.
Vzorky mohou být dávkovány manuálně stříkačkou, před inlet může být předsazen vícepozicový selekční ventil, různé druhy filtrů, redukční ventil nebo zplyňovací zařízení, které umožní dávkovat i vzorky zkapalněného zemního plynu či LPG.
Vnitřní objem TCD detektoru je pouze 200 nL, což zabraňuje rozšiřování elučních zón analytů. Detekční limity se pohybují na hladině 0,5 ppm pro kapilární a 10 ppm pro mikronáplňové kolony.
Plynový chromatograf Agilent 990 je dostupný nejen v běžné verzi pro laboratorní použití, ale také i v mobilní variantě s kufrem o rozměrech 26,9 x 40,6 x 53,8 cm. Kufr obsahuje dvě vyměnitelné, dobíjecí baterie, každá z nich při běžných podmínkách zajistí provoz přibližně na 8 hodin. Součástí kufru jsou i opětovně naplnitelné tlakové lahve o objemu 150 ml.