Agilent MassHunter Mass Profiler Software - Familiarization Guide

Význam tématu

MassHunter Mass Profiler Software představuje klíčový nástroj pro zpracování a analýzu dat z hmotnostní spektrometrie (GC/MS, LC/MS, LC/IM-MS). Umožňuje systematické vyhledávání, zarovnání, normalizaci a filtrování funkčních molekulárních „features“, což je zásadní pro metabolomické, proteomické a průmyslové aplikace včetně QA/QC.

Cíle a přehled studie / článku

Cílem průvodce je seznámit uživatele s hlavními kroky pracovního postupu: vytvořením projektu a metod, spuštěním analýzy, aplikací statistických nástrojů (PCA), identifikací sloučenin a exportem výsledků. Doprovodné příklady ilustrují využití v reálných datových sadách.

Použitá metodika a instrumentace

• MassHunter Mass Profiler Software (verze B.08.00) – komplexní platforma pro zpracování hmotnostně spektrometrických dat
• Molecular Feature Extractor (MFE) pro GC/MS a LC/MS, IM-MS Feature Extractor (IMFE) pro LC/IM-MS
• Algoritmy pro automatizované filtrování dle intenzity, RT tolerance, alignment a normalizaci (s interními standardy)
• Statistické moduly pro PCA, t-test a filtry výskytu („Feature occurrence histogramy“)
• Modul ID Browser pro identifikaci sloučenin a databázové vyhledávání
• Výstupní formáty: CEF, CSV, XLS, Target MS/MS inclusion list

Hlavní výsledky a diskuse

Software usnadňuje filtraci tisíců funkcí na základě kvality („Q-score“), frekvence výskytu a fold-change mezi skupinami. Interaktivní grafy „Feature Plot“, „Feature Table“ a „Feature Details“ nabízejí rychlý přehled o rozdílech mezi vzorky. PCA analýza umožňuje vizualizaci rozdělení vzorků a výběr nejdiferenciálnějších funkcí.

Přínosy a praktické využití metody

• Unifikovaný a modulární postup od importu surových dat po export do dalších nástrojů
• Vysoká flexibilita parametrů pro různé analytické cíle a typy dat
• Pokročilé statistické nástroje pro zvýšení relevance výsledků
• Snadná integrace do workflow pro identifikaci klíčových biomarkerů

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekává se rozšíření využití strojového učení pro automatizované vyhodnocení vzorů, zdokonalení algoritmů komprese a cloudových řešení pro sdílení a porovnávání dat v multi-institucionálních metabolomických a proteomických analýzách.

Závěr

MassHunter Mass Profiler Software poskytuje komplexní a intuitivní prostředí pro robustní analýzu hmotnostní spektrometrie. Díky široké škále nástrojů pro filtrování, statistiku, identifikaci i export podporuje efektivní zpracování dat od výzkumu po výrobní kontrolu.

Reference

• Agilent Technologies. MassHunter Mass Profiler Software – Familiarization Guide, rev. B.08.00, 2016.
• Agilent Technologies. MassHunter IM-MS Browser Software – Quick Start Guide, online dokumentace.