V tomto technickém tipu od společnosti Phenomenex se budeme zabývat problematiku zkracování kolon v plynové chromatografii (GC) z pohledu řešení problémů. Hlavní otázkou je, zda je nutné kolonu pravidelně zkracovat a jaký má tento krok vliv na separační účinnost.Video popisuje osm hlavních důvodů pro zkrácení kolony ve formě typických chromatografických projevů a zároveň ukazuje správný postup zkracování.<h3>Proč zkracovat GC kolonu?</h3>Zkracování kolony slouží především k obnovení separační účinnosti odstraněním poškozených nebo kontaminovaných částí, typicky na začátku kolony (u nástřiku).<h5>1. Zvýšený šum, krvácení kolony, ghost píky, špatný tvar píků</h5><ul><li>Příčina: Kontaminace kolony</li><li>Odstranění kontaminované stacionární fáze na vstupu kolony obnoví její výkon.</li></ul><h5>2. Zvýšení základní linie (zejména při vysokých teplotách)</h5><ul><li>Příčina: krvácení kolony</li><li>Degradace stacionární fáze vlivem kyslíku nebo tepelného poškození vede ke zvýšení základní linie.</li></ul><h5>3. Nechtěné píky - tzv. ghost peaks (bez nástřiku vzorku)</h5><ul><li>Příčina: Zbytky vzorku nebo kontaminace</li><li>Látky zachycené na začátku kolony se uvolňují i bez nástřiku vzorku.</li></ul><h5>4. Chvostování píků (asymetrie)</h5><ul><li>Příčina: Poškozené nebo kontaminované části kolony</li><li>Tyto problémy vedou k adsorpčním efektům nebo špatnému proudění.</li></ul><h5>5. Posuny retenčních časů</h5><ul><li>Příčina: Kontaminace nebo poškození v blízkosti inletu</li><li>Zkrácení může mírně změnit retenční čas, ale zároveň odstranit jeho nestabilitu.</li></ul><h5>6. Šum a náhodné píky na základní linii</h5><ul><li>Příčina: Částice nebo degradovaná stacionární fáze</li><li>Tyto jevy mohou vést k nestabilitě detektoru a náhodným výkyvům signálu.</li></ul><h5>7. Drift nebo kolísání základní linie</h5><ul><li>Příčina: Kontaminace nebo oxidace kolony</li><li>Odstranění těchto částí stabilizuje základní linii.</li></ul><h5>8. Ztráta rozlišení a citlivosti</h5><ul><li>Příčina: Celková degradace kolony</li><li>Zkrácení odstraní nejvíce exponované části a obnoví účinnost kolony.</li></ul><h3>Jak správně zkrátit GC kolonu</h3>Kapilární GC kolona se skládá z:<ul><li>Vnější polyimidové vrstvy (ochrana)</li><li>Taveného křemene (fused silica) – křehké, ale pružné jádro</li></ul><h4>Postup krok za krokem</h4><h5>1. Naříznutí kolony</h5><ul><li>Použijte keramickou destičku (wafer)</li><li>Držte ji pod úhlem</li><li>Řez proveďte kolmo na osu kolony</li></ul><h5>2. Odlomení</h5><ul><li>Proveďte rychlý a rozhodný pohyb</li><li>Zajistí se čistý a rovný řez</li></ul><h5>3. Kontrola řezu</h5>Po zkrácení je nutná vizuální kontrola konce kolony.<h3>Příklady kvality řezu</h3><h4>Správný řez</h4><ul><li>Rovný, čistý konec</li><li>Zajišťuje správné utěsnění a připojení</li></ul><h4>Nesprávné řezy</h4><ul><li>Mírná nepravidelnost<ul><li>Malá vada na hraně</li><li>Může způsobit úniky a aktivní místa</li></ul></li><li>Hrubé / špatné řezy<ul><li>Nerovné okraje</li><li>Vedou k:<ul><li>netěsnostem</li><li>aktivním místům</li><li>chvostování píků</li></ul></li></ul></li></ul><h3>Závěr</h3>Zkracování GC kolony je jednoduchý, ale velmi účinný krok při řešení problémů. Odstraněním kontaminovaných nebo poškozených částí – zejména na začátku kolony – lze eliminovat řadu chromatografických problémů, včetně nestability základní linie, nechtěných píků a ztráty separační účinnosti.Správná technika řezu je zásadní, aby nedošlo ke vzniku dalších problémů, jako jsou netěsnosti nebo aktivní místa.

Zkracování GC kolony: význam, symptomy a správná technika

&nbsp;„Pokud viru vezmeme ‚nejlepší mutace‘, můžeme ho oslabit,“ říká biochemik Jiří Zahradník, který vede virologickou laboratoř v <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/309">BIOCEVu</a>. Zkušenosti z prestižního Weizmannova institutu v Izraeli přetavil do výzkumu, jehož cílem je předpovídat mutace virů ještě dřív, než se objeví v populaci – a možná tak jednou pomoci zastavit další pandemii dřív, než vůbec začne.Když se Jiří Zahradník v roce 2018 vydal na prestižní Weizmannův institut věd v izraelském Rechovotu, zaměřoval se na výzkum proteinových interakcí – tedy na to, jak spolu jednotlivé bílkoviny v buňkách „mluví“ a jak jejich vzájemné vazby ovlivňují životní procesy. V době, kdy rozvíjel metody in vitro evoluce a proteinového inženýrství, však svět zasáhla pandemie covidu-19. „Ze dne na den jsem musel odložit svůj původní výzkum a přejít na covidový,“ vzpomíná Zahradník. „Naštěstí se ukázalo, že nástroje, které jsem vyvíjel pro studium evoluce proteinů, se dají výborně použít i při zkoumání evoluce virů.“Tím se jeho práce přirozeně posunula směrem, který určil i jeho současné zaměření. Dnes vede laboratoř v BIOCEVu, společném výzkumném centru Univerzity Karlovy a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/10">Akademie věd ČR</a>, kde se jeho tým patřící k 1. lékařské fakultě UK věnuje vývoji a využití moderních evolučních metod a metod proteinového inženýrství ke studiu biologických jevů, které klasické postupy strukturní biologie nedokážou dobře zachytit. Výzkum je založen na vytváření alternativ k přirozeným proteinům – takových, které se lépe chovají v laboratorních podmínkách a umožňují detailněji zkoumat jejich vlastnosti i vzájemné interakce.<h4>Kultura spolupráce</h4>Zkušenosti z Izraele, kde podle něj panuje mimořádně otevřená a kooperativní vědecká kultura, si přivezl i do Česka. „Stačilo zvednout telefon a během pár hodin jsem měl potřebné vzorky. Všichni vědci tam přesně vědí, kdo na čem pracuje, a spolupráce je naprostou samozřejmostí,“ říká. Právě tento přístup se snaží přenést i do českého prostředí – do týmu, který propojuje biochemii, virologii a evoluční biologii a který dnes patří k nejzajímavějším pracovištím v oblasti molekulární virologie v Česku.Izrael je pro vědce v mnoha ohledech zemí zaslíbenou – špičkové zázemí, otevřená spolupráce, rychlost, s jakou se projekty rozbíhají. Ale i ráj má své limity. Na otázku, proč se po několika letech rozhodl vrátit do Česka, odpovídá bez váhání: „Moje partnerka tehdy řekla jasně, že v Izraeli žít nechce. A zpětně musím uznat, že měla pravdu. Naše životní podmínky jsou tady nesrovnatelně lepší.“Podle něj máme v Česku tendenci své prostředí podceňovat. „Máme pocit, že nic nefunguje a všechno je špatně, ale z mé zkušenosti to nemůže být dál od pravdy. Už jenom taková zdánlivá drobnost, jako je teplotní komfort v budovách, je u nás úplně jinde než třeba ve Španělsku, Británii, Americe, Izraeli nebo Japonsku, kde jsem nějakou dobu pobýval. A to nemluvím o zdravotní péči v Izraeli – měl jsem luxusní, velmi drahé pojištění, ale dostat se ke kvalitnímu ošetření byl obrovský problém. Často jsem musel doplácet částky, o kterých se nám tady ani nezdá.“Po návratu do Česka navázal na výzkum, který rozvíjel už na Weizmannově institutu. Na 1. LF UK bylo tehdy otevřené výběrové řízení, kam se přihlásil a uspěl. Nová pozice spadala pod Národní institut virologie a bakteriologie (NIVB), takže přirozeně pokračoval ve studiu viru SARS-CoV-2 a dalších respiračních patogenů. Součástí grantu, který získal, bylo i otevření nové laboratoře – moderního pracoviště s nejvyšším stupněm biologické bezpečnosti, tzv. BSL-3, kterou vybudovali s lékařkou a vědkyní Zorou Mělkovou a také ve spolupráci s Přírodovědeckou fakultou UK a docentkou Ruth Tachezy, koordinátorkou NIVB na Univerzitě Karlově.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_2_42556d1da3.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_2_42556d1da3.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"><h4>Za dveřmi laboratoře, odkud nic nesmí ven</h4>Virologická laboratoř kategorie BSL-3 patří mezi ta nejbezpečnější zařízení pro práci s infekčními viry. Před každým, kdo chce dovnitř, stojí několik vrstev ochrany – od speciálního obleku a dýchací masky až po dvojí rukavice a systém přechodových místností s postupně se snižujícím tlakem. Veškeré pokusy se odehrávají v uzavřených laminárních boxech, odkud se žádný vzorek nesmí dostat mimo kontrolované prostředí. Použité materiály putují do průtahového autoklávu, kde projdou dekontaminací při vysokém tlaku a teplotě. Vzduch i voda se filtrují přes vícestupňové systémy, takže laboratoř zůstává uzavřeným ekosystémem.„Běžně pracujeme se SARS-CoV-2 nebo HIV. Máme ale i rukavicový box pro práci s ještě nebezpečnějšími původci onemocnění,“ říká Jiří Zahradník. Přístup sem mají jen vyškolení pracovníci. Každý nováček musí projít odborným školením, testem a zpočátku může pracovat jen pod dohledem zkušenějšího kolegy. V laboratoři může být maximálně šest lidí, obvykle ve dvojicích – kvůli bezpečnosti i přehledu. Mimo pracovní dobu a přítomnost personálu svítí na stropě germicidní lampy, které sterilizují prostor ultrafialovým světlem. Když je potřeba důkladnější čištění, laboratoř se uzavře a zaplní parami peroxidu vodíku. „Používáme osmiprocentní roztok, a to by vám klidně vybělilo tričko,“ směje se Jiří Zahradník.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_3_2e08bad2bd.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_3_2e08bad2bd.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="548"><h4>Kreativita potřebuje prostor</h4>Úspěch jeho výzkumu stojí nejen na moderním vybavení a schopném týmu, ale i na mezinárodních kontaktech, které si přivezl ze zahraničí. „Byly to právě vazby z mého dřívějšího působení na Weizmannově institutu a z koronavirového výzkumu. Díky nim jsme se mohli rychle zapojit do mezinárodních projektů a splnit pro začínající laboratoř nelehké cíle, které grant vyžadoval. Navazovali jsme na výzkum, který už běžel, věděli jsme, jaké otázky jsou aktuální a co můžeme ostatním týmům nabídnout,“ popisuje.Jedním z problémů, s nimiž se laboratoř potýká, je ale samotné umístění BIOCEVu ve Vestci-Jesenici u Prahy. „Studenti sem moc nechtějí. Říkají, že je to daleko, i když je to pořád v rámci Prahy, mnozí to berou jako komplikaci,“ přiznává. I pro něj osobně je to velký kontrast oproti Weizmannovu institutu. „To je úplně jiný svět, tamní kampus působí jako botanická zahrada – zelený, otevřený prostor, kde se věda dělá v prostředí, které samo podporuje kreativitu,“ přibližuje atmosféru místa, kde se vědci běžně setkávají venku, sedí na trávě, diskutují a vyměňují si nápady.„Izraelci si moc dobře uvědomují, že věda není továrna. Není to přímý, rutinní proces. Spousta důležitých myšlenek vzniká právě z neformálních rozhovorů mezi lidmi, kteří si šli jen na chvíli odpočinout od práce,“ podotýká s tím, že podobnou kulturu se snaží vytvářet i v BIOCEVu. „Díky univerzitě a menším grantům na udržitelnost se nám podařilo založit komunitní zahrádku. Výrazně nás v tom podpořil náš přednosta docent Jakoubek. Má správný drive a možná i trochu rebelský přístup. Takže jsme si v tomhle dobře rozuměli,“ směje se Zahradník.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_4_fc44d5f4a9.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_4_fc44d5f4a9.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"><h4>Úspěchy i překážku výzkumu</h4>Jinak byl ovšem jeho návrat na UK obrovskou logistickou a organizační výzvou. Díky grantu NIVB, pak Primus a nyní také Junior Star se ale všechny plány podařilo splnit. Teď stojí před další velkou výzvou. Připravuje žádost o ERC Consolidator Grant, v jejichž získávání se Univerzitě Karlově v poslední době daří. Jeden z nich nedávno směřoval i do BIOCEVu. „Respektive pro kolegyni, doktorku Galisovou, která ovšem na univerzitě nezůstane. Zčásti z osobních důvodů, ale také kvůli nedostatečné institucionální podpoře se rozhodla převést svůj ERC grant na univerzitu ve Freiburgu,“ upřesňuje Zahradník, který považuje tento případ za symptom širšího problému.„Když jsem se na to díval, téměř třetina všech ERC grantů z UK nakonec odchází jinam. To je, upřímně řečeno, poměrně alarmující a měla by to být pro univerzitní vedení jasná zpětná vazba, že by to chtělo nějakou systémovou změnu. Část úspěšných projektů dokonce nekončí ani v zahraničí, ale přechází na AV ČR. Jednoduše tam, kde mají lepší podmínky pro výzkum. Takže to není o odchodu ze země, ale o hledání funkčního prostředí,“ argumentuje vědec.Sám se potýká s podobným problémem. „Letos mi končí jeden z grantů a tím mi vypadnou z rozpočtu zhruba čtyři miliony korun. I když mám momentálně dva velké projekty – operační program Jan Amos Komenský pro mezisektorový výzkum a Junior Star – vznikne mi výrazný finanční propad. A zatím nevím, jak ho pokrýt,“ přiznává otevřeně. Na univerzitě podle něj totiž neexistuje možnost střádat si prostředky nebo pravidla pro situace, kdy vypadne grantové financování.<h4>Predikovat další pandemii</h4>Když se řeč vrátí k samotnému výzkumu, viditelně se nadchne. „V rámci grantu Junior Star pokračujeme dál – a je to opravdu fascinující. O SARS-CoV-2 dnes víme víc než o jakémkoli jiném viru. Je to nejstudovanější patogen v historii. A my jsme se rozhodli jít o krok dál. Snažíme zjistit, jestli bychom pomocí našich metod dokázali předpovědět mutace, které by mohly umožnit přenos nového koronaviru ze zvířat na člověka,“ popisuje. Zjednodušeně řečeno, jejich cílem je zmapovat, jak by mohl vzniknout další pandemický virus, a to ještě dřív, než k tomu vůbec dojde. Mají v plánu vytvořit mapu rizikových mutací – tedy takových, které by mohly představovat hrozbu pro člověka.Na rozdíl od výzkumníků, kteří sbírají vzorky v terénu, má Zahradníkův tým výhodu v laboratorním modelování. „Jsme schopni analyzovat desítky až stovky tisíc různých mutací, včetně těch, které zatím v přírodě nikdo nepozoroval. Můžeme tak modelovat scénáře, které teprve mohou nastat,“ pokračuje Zahradník. Právě díky tomu se k nim sekvence varianty Omikron dostala už druhý den po jejím objevení. Okamžitě ji začali zkoumat a byli mezi prvními, kdo popsal její základní vlastnosti.„Umíme predikovat mutace, které mají tzv. high fitness – tedy takové, které viru přinášejí výhodu,“ vysvětluje. „Pokud bychom dokázali tyto mutace zohlednit při vývoji vakcín, mohli bychom viru vlastně zabránit, aby si je vůbec ‚vybral‘. Místo abychom jen reagovali na nové varianty, mohli bychom aktivně ovlivňovat evoluční směr viru. To by mohlo zásadně změnit způsob, jak přemýšlíme o vakcínách i prevenci budoucích pandemií,“ shrnuje biochemik.<blockquote><h5>RNDr. Jiří Zahradník, Ph.D.</h5>Působí na 1. lékařské fakultě UK a pracovišti BIOCEV, kde vede laboratoř umožňující bezpečnou práci s vysoce infekčními viry. Pro svůj výzkum virových hrozeb získal grant Junior Star. Předtím působil na Weizmannově institutu věd v Izraeli, kde byl oceněn cenou za vynikající vědecké výsledky. Výzkumně se věnuje evoluci a adaptaci koronavirů, zejména jejich receptorových domén (RBD) a mechanismů, jimiž se přizpůsobují lidským buňkám. Cílem jeho výzkumu je porozumět tomu, jak a proč některé viry překračují bariéry, a přispět tak k prevenci budoucích pandemií. Sleduje i mutace, které mohou zvýšit infekčnost či přenos mezi druhy.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_5_81e736ddc9.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: RNDr. Jiří Zahradník, Ph.D." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_5_81e736ddc9.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"></blockquote>

Zahradník: Chceme být vždy krok před virem

<h4>S potěšením oznamujeme, že je nyní dostupná nová verze <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/305">Clarity Chromatografického Softwaru</a> 10.1.2!</h4>Tato menší aktualizace rozšiřuje portfolio systému Clarity o nové moduly pro řízení přístrojů.<h5>Nově přidané moduly pro řízení přístrojů</h5><ul><li>pomocné moduly Ecom</li><li>ICF moduly pro HTA</li><li>čerpadlo Spark</li></ul><h5>Aktualizované moduly pro řízení přístrojů</h5><ul><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/168">Ecom</a> HPLC</li><li>Knauer HPLC</li><li>Spark ICF moduly</li><li>YoungIn Chromass HPLC</li></ul><blockquote>Úplný seznam změn naleznete v dokumentu <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.dataapex.com/version_history?product=1">Changelogu</a>. Pro více informací o nových funkcích v systému Clarity doporučujeme přehled novinek verze 10.1.Software Clarity dokáže <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.dataapex.com/controls">řídit více než 1000 přístrojů</a>; jejich seznam je k dispozici online.</blockquote><h3>Podporované přístroje v Clarity (DataApex) – rychlý přehled</h3>Chromatografický software Clarity podporuje široké spektrum chromatografů a periferních zařízení prostřednictvím digitálního řízení (DD) a analogového sběru dat (A/D) pomocí modulu Colibrick.<h4>Plynové chromatografy (GC)</h4>Digitální integrace přes LAN/RS232 (mnohé přes ICF):<ul><li>Agilent: 5890, 6890, 7890, 8860, 8890, Intuvo 9000</li><li>Shimadzu: GC-2010/2014, Nexis GC-2030</li><li>Thermo Fisher: TRACE 1300/1310</li><li>PerkinElmer: Clarus 400–690</li></ul>Další podporované značky: Dani, Ellutia, Young In Chromass, Apix, Fuli, GOW-MAC (vybrané modely)<blockquote>Poznámka: Většina systémů Agilent 6890–8890 a Intuvo využívá LAN – ICF.</blockquote><h4>HPLC systémy</h4>Plné řízení systému nebo jednotlivých modulů:<ul><li>Agilent 1100–1290 Infinity II (ICF)</li><li>Shimadzu LC-10/20 a Nexera LC-40</li><li>PerkinElmer Flexar / NexSAR</li><li>Knauer Azura / BlueShadow / Smartline</li><li>Hitachi Chromaster / Primaide</li><li>Young In Chromass ChroZen</li><li>Sykam S500–S600, Watrex Streamline, Hanon LC7000–7300</li></ul><h4>HPLC moduly (čerpadla, detektory, termostaty kolon, frakční kolektory)</h4><ul><li>Čerpadla: Agilent 1100–1290, Knauer, Shimadzu, PerkinElmer, Sykam, SSI, Ecom</li><li>Detektory: VWD, DAD (PDA), RID, FLD, ELSD (Agilent, Shimadzu, Knauer, PerkinElmer, Young In Chromass, Ecom aj.)</li><li>Termostaty kolon: Agilent G1316x / G7116x, Shimadzu CTO-20/30/40, Knauer CT2.1, PerkinElmer Flexar</li><li>Frakční kolektory: Knauer FC 6.1, Teledyne FOXY, Ecom ECF 2096, Waters Fraction Collector II</li></ul><h4>Autosamplery</h4><ul><li>Agilent GC ALS (7673/7683/7693/8697), HPLC ALS moduly (G1313A–G7167C)</li><li>Shimadzu AOC-20 / AOC-5000+, SIL-10 / SIL-20 / SIL-40</li><li>CTC Analytics PAL, HTA autosamplery, Spark Alias/UHPLC, Knauer AS 6.1L</li><li>PerkinElmer Flexar / NexSAR</li></ul><h4>Další zařízení</h4><ul><li>GC×GC modulátory (např. GC×GC modulátor Univerzity Karlovy)</li><li>Ventily a přepínací moduly (Agilent, Knauer, Shimadzu, VICI-Valco)</li><li>Odplyňovače, průtokoměry, řídicí jednotky, rozhraní</li><li>LC-MS / GC-MS: Advion Expression CMS, Microsaic 4500 MiD, Markes BenchTOF aj.</li><li>Váhy (EA rozšíření): Mettler Toledo, Sartorius</li></ul><h4>Analogový sběr dat (Colibrick)</h4>Podpora A/D pro starší nebo analogové přístroje:<ul><li>GC: Agilent 5880/4890A, Varian 3xxx/3800/3900, PerkinElmer Clarus, Thermo TRACE, Shimadzu GC-14/9A, Scion 43x/45x/83xx/85xx aj.</li><li>HPLC detektory: Waters 2487/2489, ESA Corona, Hitachi L-series, JASCO FP/UV, Ecom LCD a další</li><li>Elementární a aminokyselinové analyzátory: Carlo Erba/Costech ECS, Biochrom 20/30+</li></ul>

DataApex Clarity chromatografický software verze 10.1.2 je nyní k dispozici!

Akademie

Osobnosti

Věda a výzkum

Software

Video

Článek

Produkt

Česká společnost DataApex se od svého založení v roce 1991 věnuje vývoji chromatografického softwaru. DataApex se neustále snaží poskytovat uživatelům efektivní a aktuální nástroje pro zpracování chromatografických dat.

DataApex

Společnost Phenomenex je celosvětovým technologickým lídrem, který se zabývá vývojem nových řešení v oblasti analytické chemie, jež řeší požadavky analytiků na separace a purifikace v průmyslových, vládních a akademických laboratořích.

Phenomenex

Reportáže, rozhovory, zprávy o vědeckých projektech a studentských akcích ... Jsme online informační bránou Univerzity Karlovy.

Forum: magazín Univerzity Karlovy

Agilent Technologies

Wiley

Thousands of polymeric compounds and materials have been developed over the years to optimize the properties and performance of products spanning nearly every industry. There are a few areas where characterizing these products can be important: first is performing a quick polymer identification for recycling purposes; second is quality control to identify product defects or failures; and third is reverse engineering to facilitate product development in a highly competitive marketplace.
Infrared (IR) and Raman spectroscopy are especially useful for the analysis of polymers in an industrial setting because in most cases it does not require sample preparation or expensive consumables. Examples will be presented demonstrating the effectiveness of IR and Raman analysis in each of these categories.
Mass Spectrometry (MS) has become an indispensable tool for polymer analysis and has been widely used to study polymer structure and composition, end groups and additives, molecular weight distribution, and so on. MS analysis is extremely sensitive, allowing the detection and identification of minor polymer components and synthesis by-products, as well as low-level impurities and products of decomposition. Matrix Assisted Laser Desorption Ionization (MALDI) allows performing rapid MS analysis without lengthy pre-separation and with minimal sample preparation. MALDI MS can provide structural and copolymer composition information, as well as be used for imaging of polymer surfaces, characterization of complex polymer mixtures, and many other analytical tasks.
In this webinar, we will discuss several MS analytical techniques and their applications for polymer analysis using real-life examples from the industry and academia.
<blockquote>
Presenter: Sergey V. Shilov, Ph.D. (R&amp;D Product Manager for North America, Bruker Optics)
</blockquote>
<blockquote>
Dr. Sergey V. Shilov is the R&amp;D Product Manager for North America at Bruker Optics. Sergey joined Bruker in 2001. He is responsible for the support and development of new applications for the Bruker research FTIR systems. He received his Ph.D in 1992 from the Russian Academy of Sciences in Polymer Physics and his M.S. from St. Petersburg State University (Russia) in Physics in 1986. Alexander Von Humboldt foundation (Germany) awarded him research fellowship in 1996. Sergey published 37 papers in peer-reviewed journals. His research interests include time-resolved FTIR spectroscopy, surface science, polymer and life-science applications. 
</blockquote>
<blockquote>
Presenter: Kushal Modi (Business Development Manager, Polymers, and Industrial Chemicals, Bruker Applied Mass Spectrometry)
</blockquote>
<blockquote>
Kushal Modi has been serving the scientific community for over 10 years. He joined Bruker in 2022 under the Applied Mass Spectrometry division after a legacy with Waters Corporation. He is a leading expert as a Business Development Manager and is currently supporting the polymers and industrial chemical markets nationally. 
</blockquote>
<blockquote>
Presenter: Dr. Rebecca Pool (Editor Microscopy and Analysis, Wiley, Moderator)
</blockquote>
<blockquote>
Rebecca is news editor of Microscopy&amp;Analysis and a freelance science journalist with a doctorate in Materials Science. She has published in Wiley Analytical Science, Nature Photonics, SPIE Photonics Focus, Physics World, Sci Fi Generation, Engineering and Technology magazine, WorldSteel and more.
</blockquote>

Wiley Analytical Science: Effective Analysis of Polymers Using IR, Raman Spectroscopy, and MALDI-TOF Mass Spectrometry

Effective Analysis of Polymers Using IR, Raman Spectroscopy, and MALDI-TOF Mass Spectrometry

Examples will be presented demonstrating the effectiveness of IR and Raman analysis and will discuss several MS techniques and apps for polymer analysis.

Polymers Using IR, Raman Spectroscopy, and MALDI-TOF MS

Join Agilent and GERSTEL for our annual virtual seminar discussing how you can assure safety, authenticity, and quality of alcoholic beverages. Sharing the latest in technology developments and capabilities, new applications, and customer stories. Topics include distilled beverages, wine and beer. There is something for everyone in this seminar series and we hope to see you there.
Attend live and receive an Agilent GC wine glass!
<h3>Presentation 1: Non-targeted and Targeted Analysis of Spirits Aroma/Flavor Compounds using DHS-GC(-GC)-MS</h3>
Chromatographic analysis of distilled spirits has witnessed a sea change over a recent short period of years. Previous approaches which relied on solvent extraction procedures to enrich the secondary aroma/flavor compounds from the dominant ethanol-water base, can now be replaced by solventless, automated instrumental methods. Such solventless approaches comprise Stir Bar Sorptive Extraction, Static and Dynamic Headspace and Large Volume Injection. These methods rely on the ability of a PTV (Programmable Temperature Vaporization) injector to enrich analytes of interest before transfer to the GC column, while venting unwanted matrix.
Complex GC-MS data files obtained in this way, can also be further processed by powerful filters such as Spectral Deconvolution followed by RI based isolation and verification of identities of aroma/flavor compounds. The sequential progress of the GC-MS data file through these various filters and finally into a chemometric software for investigative discrimination of samples is achieved by simple mouse clicks. This is a very attractive outcome for practicing flavor Chemists and could be regarded as the final fulfillment of what previously could only be an outcome to aspire to.
These solventless techniques can be so efficient, and sometimes give such complex GC-MS data files, that often an additional chromatographic dimension may be required, especially for detection of ultra-trace compounds. This is supplied by chromatographic heart cutting where elution segments from one column are transferred to a second column of different polarity for increased resolution. The necessary instrumental configurations required for this purpose are also available in fully automated format.
Key Learning Objectives/What attendees will learn:
<ul>
<li>Appreciation of how analysis of distilled spirits has moved into a more modern approach using solventless extraction techniques featuring full automation from sample treatment to GC injection.</li>
<li>Aroma Office in conjunction with MS Spectral Deconvolution will be introduced as a powerful combination for filtering and listing of aroma compounds from complex GC-MS data files.</li>
<li>Two-dimensional Gas Chromatography (2D-GC-GC) will also feature as a valuable tool for isolation of key compounds from interfering matrix in extremely complex data files.</li>
</ul>
Who Should Attend: Chemists and Technicians involved in aroma research and analysis
<blockquote>
Presenter: Dr. Kevin Mac Namara (Consultant)
</blockquote>
<blockquote>
Dr Kevin Mac Namara graduated from the National University of Ireland with a speciality in synthetic organic chemistry. He later joined the Irish Government Alcohol Monopoly and subsequently moved to Irish Distillers Group in 1981 as Head of Technical Development where he established a high profile centre for distilled spirits research. When Irish Distillers merged into the global Pernod Ricard Group in 1990 he assumed a much enlarged role and represented Ireland in EU alcohol affairs for many years before retiring in 2012.
</blockquote>
<h3>Presentation 2: A Variety of Extraction Techniques Used to Determine Analytes of Interest in Distilled Spirits</h3>
Analysis of distilled spirits using GC-MS can be challenging due to the multitude of flavor and aroma compounds that exist in the predominantly ethanol-water mixture. The optimal extraction technique or techniques must be able to isolate and pre-concentrate the analytes before introduction into the GC-MS to produce meaningful data. GERSTEL offers numerous automated sample introduction and extraction techniques including Static Headspace (SHS), Solid Phase Microextraction (SPME), Thermal Desorption (TD), Dynamic Headspace (DHS), and Thin Film Solid-Phase Microextraction (TF-SPME) and Pyrolysis. GERSTEL offers additional features to each extraction technique including Multiple Headspace Sample Enrichment (MHSE) and TDx Multidesorption that can provide significantly more mass on column and lower detection limits. GERSTEL also offers unique detection capabilities with the olfactory detection port (ODP) allowing the analyst to smell compounds as they elute from the GC column. With simultaneous mass spectral detection, key odor-active compounds can be identified in complex products.
Common challenges encountered when analyzing distilled spirits include reproducibility of batches, identifying and quantifying off-odors produced during the fermentation process, and consumer satisfaction, especially in the context of competitors, to name a few. This presentation will show how GERSTEL addresses these complex challenges by having a complete “toolbox” of extraction, introduction and detection options that can be combined and optimized as needed.
Key Learning Objectives/What attendees will learn:
<ul>
<li>Theory and applicability of SHS, SPME, SBSE, TF-SPME, DHS, and pyrolysis.</li>
<li>How to decide on the most optimal extraction technique based on research challenges.</li>
</ul>
Who Should Attend: Analytical chemists in the food, flavor, fragrance, and beverage industries
<blockquote>
Presenter: Megan Harper (Applications Scientist l, GERSTEL, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Megan Harper graduated from the University of Maryland Baltimore County in 2020 with a Bachelor of Science Degree in chemistry and received her Master of Science Degree in forensic science with an analytical chemistry track from Towson University in 2022. At GERSTEL, Inc., Harper applies her knowledge on sample extraction and introduction techniques to help solve complex problems for customers across the USA, including those involving distilled spirits.
</blockquote>

Pixabay/Bruno/Germany: 3rd Annual Alcoholic Beverages Virtual Symposium - Spirits

3rd Annual Alcoholic Beverages Virtual Symposium - Spirits

Non-targeted and Targeted Analysis of Spirits Aroma/Flavor Compounds using DHS-GC(-GC)-MS. Extraction Techniques Used to Determine Analytes of Interest

This Seminar is designed to help chemists and lab managers become more familiar with the workings of Agilent’s newest software - OpenLab CDS.
Participants will listen to an Agilent expert and watch a series of live demonstrations.They will have amble opportunity to ask their own specific questions during the course of this seminar. Customers that are new to OpenLab CDS or are using an older software package from Agilent such as ChemStation would benefit from seeing the future of their laboratory software.
<blockquote>
Presenter: Richard Mutkoski (Laboratory Informatics Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Richard Mutkoski began with Agilent (HP) in 1995. He has been an Application Engineer in Agilent’s Laboratory Informatics for the past 18 years. Prior to his career at Agilent Rich spent 12 years in a variety of small pharmaceutical firms in both R&amp;D and QA/QC capacities affording him first-hand knowledge of those workflows, bottlenecks and challenges.
</blockquote>

Agilent Technologies: Get The Most Out of Your OpenLab CDS System – An Exploration of Agilent’s Newest Chromatography Data System

Get The Most Out of Your OpenLab CDS System – An Exploration of Agilent’s Newest Chromatography Data System

Become more familiar with the workings of Agilent’s newest software - OpenLab CDS.

Get The Most Out of Your OpenLab CDS System

Learn about the function and advantages of the new control panel including creating instruments, creating projects, activity logs, storage types and paths.
Learn the basic operations of user privileges including assigning permissions and roles, and license utilities.
<blockquote>
Presenter: Richard Mutkoski (Laboratory Informatics Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Richard Mutkoski has been a field representative for over 27 years for both hardware and software. In his current role as an Informatics Application Engineer, Rich presents technical solutions of the OpenLab suite of products to customers worldwide. Prior to his tenure at Agilent Rich spent 15 years in a variety of Pharma QA/QC and R&amp;D positions providing him a unique understanding of those workflows, bottlenecks and challenges.
</blockquote>

Agilent Technologies: Openlab CDS ChemStation Edition - Getting Started

Openlab CDS ChemStation Edition - Getting Started

Learn about the function and advantages of the new control panel including creating instruments, creating projects, activity logs, storage types and paths.

The FDA guidance for Computer System Assurance (CSA) is intended to reduce the time and effort of the Computerized System Validation (CSV) process without compromising regulatory compliance or data integrity.
The regulated life science industries generally consider the CSV process as burdensome and as a hindrance to adopting new automation technologies that could greatly improve the efficiency and productivity of their business. In this presentation we will examine the six major points of the CSA guidance and how they can be used to improve your CSV process. We will also examine Agilent’s validation services, our process efficiencies, and how we intend to integrate elements of the CSA guidance.
<blockquote>
Presenter: Michael Korbel (Sr. Compliance Consultant, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Michael has over 22 years of experience in regulated environments in the pharmaceutical and bio-tech industries. Half of Michael&#39;s career has been spent on the customer side of the industry in both IT and laboratory positions, supporting, qualifying, and validating regulated instruments and computerized systems. The other half has been spent providing consultative compliance service programs from the vendor side of the industry. His experience includes technical support and validation of both standalone and enterprise laboratory informatics systems, as well as instrument qualification, preventive maintenance, and relocation services. Michael’s current role at Agilent Technologies is to create new compliance consulting services for our regulated customers and implement them globally. Michael holds a B.S. in Biology, with minors in Chemistry and Environmental Science.
</blockquote>

Agilent Technologies: New FDA guidance “Computer System Assurance” and Agilent Validation Service Offerings

New FDA guidance “Computer System Assurance” and Agilent Validation Service Offerings

The six major points of the CSA guidance and how they can be used to improve your CSV process.

New FDA guidance “Computer System Assurance”

Now that you are using the OpenLab CDS system, why are you still using Excel?
Unlock the incredible calculation potential of your system. You have run a triplicate injection of standards and would like to determine the percent recovery of your samples against the average of those standards. This session will introduce you to the method of being able to do just that within OpenLab CDS WITHOUT the use of Excel.
<blockquote>
Presenter: Richard Mutkoski (Laboratory Informatics Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Richard Mutkoski has been a field representative for over 27 years for both hardware and software. In his current role as an Informatics Application Engineer, Rich presents technical solutions of the OpenLab suite of products to customers worldwide. Prior to his tenure at Agilent Rich spent 15 years in a variety of Pharma QA/QC and R&amp;D positions providing him a unique understanding of those workflows, bottlenecks and challenges.
</blockquote>

Agilent Technologies: Calculate Percent Recovery of Samples in OpenLab CDS

Calculate Percent Recovery of Samples in OpenLab CDS

The method of being able to do just that within OpenLab CDS WITHOUT the use of Excel.

This seminar introduces a powerful feature in OpenLab CDS: Custom Calculator.
OpenLab CDS users or chromatographers thinking of moving to OpenLab CDS from another data system can see how this unique feature allows the addition of user defined chromatography calculations directly into the OpenLab CDS data system.
<blockquote>
Presenter: Kathleen O&#39;Dea (Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Kathleen O’Dea has a 20 year history with Agilent’s OpenLab products. As an Informatics Application Engineer, Kathleen has visited customers around the world in a wide variety of market areas, helping them to select and implement OpenLab software products.
</blockquote>

Agilent Technologies: Introducing the Custom Calculator in OpenLab CDS

Introducing the Custom Calculator in OpenLab CDS

Powerful feature in OpenLab CDS: Custom Calculator.

Are you an analyst, manager, or reviewer who needs to get work done but may not be in the lab?
Especially important today, remote access is a key feature that can increase productivity, reduce compliance costs and is a key part of a disaster recovery plan. This virtual seminar introduces options for thin client technology enabling all Masshunter, ChemStation or OpenLab CDS products to be accessed outside the lab, whether this is at from nearby desks, across sites, or from home.
<blockquote>
Presenter: Mike Ratto (Lab Informatics Applications Specialist, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Mike Ratto has been with Agilent for 29 years as a field representative for both hardware and software products. In his current role as an Informatics Application Specialist, Mike presents technical solutions of OpenLab family of products to customers all over the world.
</blockquote>

Agilent Technologies: Agilent Software products and Architecture to enable work from home options

Agilent Software products and Architecture to enable work from home options

Options for thin client technology enabling all Masshunter, ChemStation or OpenLab CDS products to be accessed outside the lab.

Agilent Software products and Architecture to enable work

Are you an analyst, manager, or reviewer who follows the social distancing guidelines but need to get work done without full access to your lab?
Especially important today, Remote Access is a key feature that can increase productivity, reduce compliance costs and can be an integral part of a disaster recovery plan. This virtual seminar introduces options using “Thin Client technology which enables all Masshunter, ChemStation or OpenLab CDS products to be accessed outside the lab, whether this is at from nearby desks, across sites, or from home.
Our learning objectives during this 1 hour session are as follows:
<ul>
<li>An introduction to “Thin Client” technology
</li>
<li>Data and instrument access options from lab, office or home with OpenLab
</li>
<li>Learn technology options that support Social Distancing in the laboratory
</li>
</ul>
<blockquote>
Presenter: Mike Ratto (Lab Informatics Applications Specialist, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Mike Ratto has been with Agilent for 29 years as a field representative for both hardware and software products. In his current role as an Informatics Application Specialist, Mike presents technical solutions of OpenLab family of products to customers all over the world.
</blockquote>

Agilent Technologies: OpenLab CDS/ECM Remote Access Solutions to support Social Distancing in the Lab

OpenLab CDS/ECM Remote Access Solutions to support Social Distancing in the Lab

Options using “Thin Client technology which enables all Masshunter, ChemStation or OpenLab CDS products to be accessed outside the lab.

OpenLab CDS/ECM Remote Access Solutions

Agilent has a suite of products that help you advance your laboratory operations and meet new social distancing guidelines.
Crosslab Connect can utilize data collected in OpenLab ECM to capture lab-wide instrument utilization data and present them in dashboards helping you increase efficiency with data driven decisions concerning your instrument assets. iLab operations software is a web based lab and instrument management tool that can help you schedule and share instrument resources so only a planned amount of users can use the intended space or equipment.
<blockquote>
Presenter: Melissa Zeier (Applications Expert, Lab Productivity Solutions)
</blockquote>
<blockquote>
Melissa has been in the drug development, testing, and laboratory services industries for approximately 15 years. She began her career in big pharma working in high throughput biomarker testing, then moved into the pre-clinical contract testing field specializing in chiral analyte method development for LC-MS/MS. Melissa transitioned to auditing GLP bioanalytical studies before exercising her expertise in the pharma and biopharma sectors as a business intelligence analyst, driving product and service development in the pre-clinical testing industry for a top 3 preclinical CRO prior to joining Agilent. Now, with Agilent, Melissa works in a presales capacity to assist with technical topics and conversations about laboratory productivity solutions. Melissa has a B.S. in Chemistry with minors in Cellular Biology and Mathematics, an M.S. in Analytical Chemistry, and an M.A. in Applied Economics.
</blockquote>
<blockquote>
Presenter: Rick Chrisos (Account Manager, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Rick primarily works with enterprise research administration and lab operations across the United States. Dual-wielding as a newly minted member of the Informatics Product Specialist and Team Lead for iLab Operations Software Americas, Rick is responsible for designing solutions to enable his clients to digitize their lab into a virtual landscape. Outside of his role with Agilent, Rick enjoys an active outdoor lifestyle as a “New Englander” and can often be seen accompanied by his dogs. Rick holds a B.S. in Business Administration &amp; Marketing from University of Massachusetts, Amherst.​
</blockquote>

Agilent Technologies: Advance Laboratory Operations by Measuring Instrument Utilization and Scheduling Assets to Meet Social Distancing

Advance Laboratory Operations by Measuring Instrument Utilization and Scheduling Assets to Meet Social Distancing

Suite of products that help you advance your laboratory operations and meet new social distancing guidelines.