V tomto technickém tipu od společnosti Phenomenex se budeme zabývat problematiku zkracování kolon v plynové chromatografii (GC) z pohledu řešení problémů. Hlavní otázkou je, zda je nutné kolonu pravidelně zkracovat a jaký má tento krok vliv na separační účinnost.Video popisuje osm hlavních důvodů pro zkrácení kolony ve formě typických chromatografických projevů a zároveň ukazuje správný postup zkracování.<h3>Proč zkracovat GC kolonu?</h3>Zkracování kolony slouží především k obnovení separační účinnosti odstraněním poškozených nebo kontaminovaných částí, typicky na začátku kolony (u nástřiku).<h5>1. Zvýšený šum, krvácení kolony, ghost píky, špatný tvar píků</h5><ul><li>Příčina: Kontaminace kolony</li><li>Odstranění kontaminované stacionární fáze na vstupu kolony obnoví její výkon.</li></ul><h5>2. Zvýšení základní linie (zejména při vysokých teplotách)</h5><ul><li>Příčina: krvácení kolony</li><li>Degradace stacionární fáze vlivem kyslíku nebo tepelného poškození vede ke zvýšení základní linie.</li></ul><h5>3. Nechtěné píky - tzv. ghost peaks (bez nástřiku vzorku)</h5><ul><li>Příčina: Zbytky vzorku nebo kontaminace</li><li>Látky zachycené na začátku kolony se uvolňují i bez nástřiku vzorku.</li></ul><h5>4. Chvostování píků (asymetrie)</h5><ul><li>Příčina: Poškozené nebo kontaminované části kolony</li><li>Tyto problémy vedou k adsorpčním efektům nebo špatnému proudění.</li></ul><h5>5. Posuny retenčních časů</h5><ul><li>Příčina: Kontaminace nebo poškození v blízkosti inletu</li><li>Zkrácení může mírně změnit retenční čas, ale zároveň odstranit jeho nestabilitu.</li></ul><h5>6. Šum a náhodné píky na základní linii</h5><ul><li>Příčina: Částice nebo degradovaná stacionární fáze</li><li>Tyto jevy mohou vést k nestabilitě detektoru a náhodným výkyvům signálu.</li></ul><h5>7. Drift nebo kolísání základní linie</h5><ul><li>Příčina: Kontaminace nebo oxidace kolony</li><li>Odstranění těchto částí stabilizuje základní linii.</li></ul><h5>8. Ztráta rozlišení a citlivosti</h5><ul><li>Příčina: Celková degradace kolony</li><li>Zkrácení odstraní nejvíce exponované části a obnoví účinnost kolony.</li></ul><h3>Jak správně zkrátit GC kolonu</h3>Kapilární GC kolona se skládá z:<ul><li>Vnější polyimidové vrstvy (ochrana)</li><li>Taveného křemene (fused silica) – křehké, ale pružné jádro</li></ul><h4>Postup krok za krokem</h4><h5>1. Naříznutí kolony</h5><ul><li>Použijte keramickou destičku (wafer)</li><li>Držte ji pod úhlem</li><li>Řez proveďte kolmo na osu kolony</li></ul><h5>2. Odlomení</h5><ul><li>Proveďte rychlý a rozhodný pohyb</li><li>Zajistí se čistý a rovný řez</li></ul><h5>3. Kontrola řezu</h5>Po zkrácení je nutná vizuální kontrola konce kolony.<h3>Příklady kvality řezu</h3><h4>Správný řez</h4><ul><li>Rovný, čistý konec</li><li>Zajišťuje správné utěsnění a připojení</li></ul><h4>Nesprávné řezy</h4><ul><li>Mírná nepravidelnost<ul><li>Malá vada na hraně</li><li>Může způsobit úniky a aktivní místa</li></ul></li><li>Hrubé / špatné řezy<ul><li>Nerovné okraje</li><li>Vedou k:<ul><li>netěsnostem</li><li>aktivním místům</li><li>chvostování píků</li></ul></li></ul></li></ul><h3>Závěr</h3>Zkracování GC kolony je jednoduchý, ale velmi účinný krok při řešení problémů. Odstraněním kontaminovaných nebo poškozených částí – zejména na začátku kolony – lze eliminovat řadu chromatografických problémů, včetně nestability základní linie, nechtěných píků a ztráty separační účinnosti.Správná technika řezu je zásadní, aby nedošlo ke vzniku dalších problémů, jako jsou netěsnosti nebo aktivní místa.

Zkracování GC kolony: význam, symptomy a správná technika

&nbsp;„Pokud viru vezmeme ‚nejlepší mutace‘, můžeme ho oslabit,“ říká biochemik Jiří Zahradník, který vede virologickou laboratoř v <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/309">BIOCEVu</a>. Zkušenosti z prestižního Weizmannova institutu v Izraeli přetavil do výzkumu, jehož cílem je předpovídat mutace virů ještě dřív, než se objeví v populaci – a možná tak jednou pomoci zastavit další pandemii dřív, než vůbec začne.Když se Jiří Zahradník v roce 2018 vydal na prestižní Weizmannův institut věd v izraelském Rechovotu, zaměřoval se na výzkum proteinových interakcí – tedy na to, jak spolu jednotlivé bílkoviny v buňkách „mluví“ a jak jejich vzájemné vazby ovlivňují životní procesy. V době, kdy rozvíjel metody in vitro evoluce a proteinového inženýrství, však svět zasáhla pandemie covidu-19. „Ze dne na den jsem musel odložit svůj původní výzkum a přejít na covidový,“ vzpomíná Zahradník. „Naštěstí se ukázalo, že nástroje, které jsem vyvíjel pro studium evoluce proteinů, se dají výborně použít i při zkoumání evoluce virů.“Tím se jeho práce přirozeně posunula směrem, který určil i jeho současné zaměření. Dnes vede laboratoř v BIOCEVu, společném výzkumném centru Univerzity Karlovy a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/10">Akademie věd ČR</a>, kde se jeho tým patřící k 1. lékařské fakultě UK věnuje vývoji a využití moderních evolučních metod a metod proteinového inženýrství ke studiu biologických jevů, které klasické postupy strukturní biologie nedokážou dobře zachytit. Výzkum je založen na vytváření alternativ k přirozeným proteinům – takových, které se lépe chovají v laboratorních podmínkách a umožňují detailněji zkoumat jejich vlastnosti i vzájemné interakce.<h4>Kultura spolupráce</h4>Zkušenosti z Izraele, kde podle něj panuje mimořádně otevřená a kooperativní vědecká kultura, si přivezl i do Česka. „Stačilo zvednout telefon a během pár hodin jsem měl potřebné vzorky. Všichni vědci tam přesně vědí, kdo na čem pracuje, a spolupráce je naprostou samozřejmostí,“ říká. Právě tento přístup se snaží přenést i do českého prostředí – do týmu, který propojuje biochemii, virologii a evoluční biologii a který dnes patří k nejzajímavějším pracovištím v oblasti molekulární virologie v Česku.Izrael je pro vědce v mnoha ohledech zemí zaslíbenou – špičkové zázemí, otevřená spolupráce, rychlost, s jakou se projekty rozbíhají. Ale i ráj má své limity. Na otázku, proč se po několika letech rozhodl vrátit do Česka, odpovídá bez váhání: „Moje partnerka tehdy řekla jasně, že v Izraeli žít nechce. A zpětně musím uznat, že měla pravdu. Naše životní podmínky jsou tady nesrovnatelně lepší.“Podle něj máme v Česku tendenci své prostředí podceňovat. „Máme pocit, že nic nefunguje a všechno je špatně, ale z mé zkušenosti to nemůže být dál od pravdy. Už jenom taková zdánlivá drobnost, jako je teplotní komfort v budovách, je u nás úplně jinde než třeba ve Španělsku, Británii, Americe, Izraeli nebo Japonsku, kde jsem nějakou dobu pobýval. A to nemluvím o zdravotní péči v Izraeli – měl jsem luxusní, velmi drahé pojištění, ale dostat se ke kvalitnímu ošetření byl obrovský problém. Často jsem musel doplácet částky, o kterých se nám tady ani nezdá.“Po návratu do Česka navázal na výzkum, který rozvíjel už na Weizmannově institutu. Na 1. LF UK bylo tehdy otevřené výběrové řízení, kam se přihlásil a uspěl. Nová pozice spadala pod Národní institut virologie a bakteriologie (NIVB), takže přirozeně pokračoval ve studiu viru SARS-CoV-2 a dalších respiračních patogenů. Součástí grantu, který získal, bylo i otevření nové laboratoře – moderního pracoviště s nejvyšším stupněm biologické bezpečnosti, tzv. BSL-3, kterou vybudovali s lékařkou a vědkyní Zorou Mělkovou a také ve spolupráci s Přírodovědeckou fakultou UK a docentkou Ruth Tachezy, koordinátorkou NIVB na Univerzitě Karlově.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_2_42556d1da3.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_2_42556d1da3.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"><h4>Za dveřmi laboratoře, odkud nic nesmí ven</h4>Virologická laboratoř kategorie BSL-3 patří mezi ta nejbezpečnější zařízení pro práci s infekčními viry. Před každým, kdo chce dovnitř, stojí několik vrstev ochrany – od speciálního obleku a dýchací masky až po dvojí rukavice a systém přechodových místností s postupně se snižujícím tlakem. Veškeré pokusy se odehrávají v uzavřených laminárních boxech, odkud se žádný vzorek nesmí dostat mimo kontrolované prostředí. Použité materiály putují do průtahového autoklávu, kde projdou dekontaminací při vysokém tlaku a teplotě. Vzduch i voda se filtrují přes vícestupňové systémy, takže laboratoř zůstává uzavřeným ekosystémem.„Běžně pracujeme se SARS-CoV-2 nebo HIV. Máme ale i rukavicový box pro práci s ještě nebezpečnějšími původci onemocnění,“ říká Jiří Zahradník. Přístup sem mají jen vyškolení pracovníci. Každý nováček musí projít odborným školením, testem a zpočátku může pracovat jen pod dohledem zkušenějšího kolegy. V laboratoři může být maximálně šest lidí, obvykle ve dvojicích – kvůli bezpečnosti i přehledu. Mimo pracovní dobu a přítomnost personálu svítí na stropě germicidní lampy, které sterilizují prostor ultrafialovým světlem. Když je potřeba důkladnější čištění, laboratoř se uzavře a zaplní parami peroxidu vodíku. „Používáme osmiprocentní roztok, a to by vám klidně vybělilo tričko,“ směje se Jiří Zahradník.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_3_2e08bad2bd.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_3_2e08bad2bd.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="548"><h4>Kreativita potřebuje prostor</h4>Úspěch jeho výzkumu stojí nejen na moderním vybavení a schopném týmu, ale i na mezinárodních kontaktech, které si přivezl ze zahraničí. „Byly to právě vazby z mého dřívějšího působení na Weizmannově institutu a z koronavirového výzkumu. Díky nim jsme se mohli rychle zapojit do mezinárodních projektů a splnit pro začínající laboratoř nelehké cíle, které grant vyžadoval. Navazovali jsme na výzkum, který už běžel, věděli jsme, jaké otázky jsou aktuální a co můžeme ostatním týmům nabídnout,“ popisuje.Jedním z problémů, s nimiž se laboratoř potýká, je ale samotné umístění BIOCEVu ve Vestci-Jesenici u Prahy. „Studenti sem moc nechtějí. Říkají, že je to daleko, i když je to pořád v rámci Prahy, mnozí to berou jako komplikaci,“ přiznává. I pro něj osobně je to velký kontrast oproti Weizmannovu institutu. „To je úplně jiný svět, tamní kampus působí jako botanická zahrada – zelený, otevřený prostor, kde se věda dělá v prostředí, které samo podporuje kreativitu,“ přibližuje atmosféru místa, kde se vědci běžně setkávají venku, sedí na trávě, diskutují a vyměňují si nápady.„Izraelci si moc dobře uvědomují, že věda není továrna. Není to přímý, rutinní proces. Spousta důležitých myšlenek vzniká právě z neformálních rozhovorů mezi lidmi, kteří si šli jen na chvíli odpočinout od práce,“ podotýká s tím, že podobnou kulturu se snaží vytvářet i v BIOCEVu. „Díky univerzitě a menším grantům na udržitelnost se nám podařilo založit komunitní zahrádku. Výrazně nás v tom podpořil náš přednosta docent Jakoubek. Má správný drive a možná i trochu rebelský přístup. Takže jsme si v tomhle dobře rozuměli,“ směje se Zahradník.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_4_fc44d5f4a9.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: Zahradník - Chceme být vždy krok před virem" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_4_fc44d5f4a9.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"><h4>Úspěchy i překážku výzkumu</h4>Jinak byl ovšem jeho návrat na UK obrovskou logistickou a organizační výzvou. Díky grantu NIVB, pak Primus a nyní také Junior Star se ale všechny plány podařilo splnit. Teď stojí před další velkou výzvou. Připravuje žádost o ERC Consolidator Grant, v jejichž získávání se Univerzitě Karlově v poslední době daří. Jeden z nich nedávno směřoval i do BIOCEVu. „Respektive pro kolegyni, doktorku Galisovou, která ovšem na univerzitě nezůstane. Zčásti z osobních důvodů, ale také kvůli nedostatečné institucionální podpoře se rozhodla převést svůj ERC grant na univerzitu ve Freiburgu,“ upřesňuje Zahradník, který považuje tento případ za symptom širšího problému.„Když jsem se na to díval, téměř třetina všech ERC grantů z UK nakonec odchází jinam. To je, upřímně řečeno, poměrně alarmující a měla by to být pro univerzitní vedení jasná zpětná vazba, že by to chtělo nějakou systémovou změnu. Část úspěšných projektů dokonce nekončí ani v zahraničí, ale přechází na AV ČR. Jednoduše tam, kde mají lepší podmínky pro výzkum. Takže to není o odchodu ze země, ale o hledání funkčního prostředí,“ argumentuje vědec.Sám se potýká s podobným problémem. „Letos mi končí jeden z grantů a tím mi vypadnou z rozpočtu zhruba čtyři miliony korun. I když mám momentálně dva velké projekty – operační program Jan Amos Komenský pro mezisektorový výzkum a Junior Star – vznikne mi výrazný finanční propad. A zatím nevím, jak ho pokrýt,“ přiznává otevřeně. Na univerzitě podle něj totiž neexistuje možnost střádat si prostředky nebo pravidla pro situace, kdy vypadne grantové financování.<h4>Predikovat další pandemii</h4>Když se řeč vrátí k samotnému výzkumu, viditelně se nadchne. „V rámci grantu Junior Star pokračujeme dál – a je to opravdu fascinující. O SARS-CoV-2 dnes víme víc než o jakémkoli jiném viru. Je to nejstudovanější patogen v historii. A my jsme se rozhodli jít o krok dál. Snažíme zjistit, jestli bychom pomocí našich metod dokázali předpovědět mutace, které by mohly umožnit přenos nového koronaviru ze zvířat na člověka,“ popisuje. Zjednodušeně řečeno, jejich cílem je zmapovat, jak by mohl vzniknout další pandemický virus, a to ještě dřív, než k tomu vůbec dojde. Mají v plánu vytvořit mapu rizikových mutací – tedy takových, které by mohly představovat hrozbu pro člověka.Na rozdíl od výzkumníků, kteří sbírají vzorky v terénu, má Zahradníkův tým výhodu v laboratorním modelování. „Jsme schopni analyzovat desítky až stovky tisíc různých mutací, včetně těch, které zatím v přírodě nikdo nepozoroval. Můžeme tak modelovat scénáře, které teprve mohou nastat,“ pokračuje Zahradník. Právě díky tomu se k nim sekvence varianty Omikron dostala už druhý den po jejím objevení. Okamžitě ji začali zkoumat a byli mezi prvními, kdo popsal její základní vlastnosti.„Umíme predikovat mutace, které mají tzv. high fitness – tedy takové, které viru přinášejí výhodu,“ vysvětluje. „Pokud bychom dokázali tyto mutace zohlednit při vývoji vakcín, mohli bychom viru vlastně zabránit, aby si je vůbec ‚vybral‘. Místo abychom jen reagovali na nové varianty, mohli bychom aktivně ovlivňovat evoluční směr viru. To by mohlo zásadně změnit způsob, jak přemýšlíme o vakcínách i prevenci budoucích pandemií,“ shrnuje biochemik.<blockquote><h5>RNDr. Jiří Zahradník, Ph.D.</h5>Působí na 1. lékařské fakultě UK a pracovišti BIOCEV, kde vede laboratoř umožňující bezpečnou práci s vysoce infekčními viry. Pro svůj výzkum virových hrozeb získal grant Junior Star. Předtím působil na Weizmannově institutu věd v Izraeli, kde byl oceněn cenou za vynikající vědecké výsledky. Výzkumně se věnuje evoluci a adaptaci koronavirů, zejména jejich receptorových domén (RBD) a mechanismů, jimiž se přizpůsobují lidským buňkám. Cílem jeho výzkumu je porozumět tomu, jak a proč některé viry překračují bariéry, a přispět tak k prevenci budoucích pandemií. Sleduje i mutace, které mohou zvýšit infekčnost či přenos mezi druhy.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_5_81e736ddc9.jpg" alt="Forum Magazín Univerzity Karlovy / Michal Novotný: RNDr. Jiří Zahradník, Ph.D." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Forum_Magazin_Univerzity_Karlovy_Zahradnik_Chceme_byt_vzdy_krok_pred_virem_5_81e736ddc9.jpg 234w," sizes="100vw" width="1400" height="933"></blockquote>

Zahradník: Chceme být vždy krok před virem

<h4>S potěšením oznamujeme, že je nyní dostupná nová verze <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/305">Clarity Chromatografického Softwaru</a> 10.1.2!</h4>Tato menší aktualizace rozšiřuje portfolio systému Clarity o nové moduly pro řízení přístrojů.<h5>Nově přidané moduly pro řízení přístrojů</h5><ul><li>pomocné moduly Ecom</li><li>ICF moduly pro HTA</li><li>čerpadlo Spark</li></ul><h5>Aktualizované moduly pro řízení přístrojů</h5><ul><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/168">Ecom</a> HPLC</li><li>Knauer HPLC</li><li>Spark ICF moduly</li><li>YoungIn Chromass HPLC</li></ul><blockquote>Úplný seznam změn naleznete v dokumentu <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.dataapex.com/version_history?product=1">Changelogu</a>. Pro více informací o nových funkcích v systému Clarity doporučujeme přehled novinek verze 10.1.Software Clarity dokáže <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.dataapex.com/controls">řídit více než 1000 přístrojů</a>; jejich seznam je k dispozici online.</blockquote><h3>Podporované přístroje v Clarity (DataApex) – rychlý přehled</h3>Chromatografický software Clarity podporuje široké spektrum chromatografů a periferních zařízení prostřednictvím digitálního řízení (DD) a analogového sběru dat (A/D) pomocí modulu Colibrick.<h4>Plynové chromatografy (GC)</h4>Digitální integrace přes LAN/RS232 (mnohé přes ICF):<ul><li>Agilent: 5890, 6890, 7890, 8860, 8890, Intuvo 9000</li><li>Shimadzu: GC-2010/2014, Nexis GC-2030</li><li>Thermo Fisher: TRACE 1300/1310</li><li>PerkinElmer: Clarus 400–690</li></ul>Další podporované značky: Dani, Ellutia, Young In Chromass, Apix, Fuli, GOW-MAC (vybrané modely)<blockquote>Poznámka: Většina systémů Agilent 6890–8890 a Intuvo využívá LAN – ICF.</blockquote><h4>HPLC systémy</h4>Plné řízení systému nebo jednotlivých modulů:<ul><li>Agilent 1100–1290 Infinity II (ICF)</li><li>Shimadzu LC-10/20 a Nexera LC-40</li><li>PerkinElmer Flexar / NexSAR</li><li>Knauer Azura / BlueShadow / Smartline</li><li>Hitachi Chromaster / Primaide</li><li>Young In Chromass ChroZen</li><li>Sykam S500–S600, Watrex Streamline, Hanon LC7000–7300</li></ul><h4>HPLC moduly (čerpadla, detektory, termostaty kolon, frakční kolektory)</h4><ul><li>Čerpadla: Agilent 1100–1290, Knauer, Shimadzu, PerkinElmer, Sykam, SSI, Ecom</li><li>Detektory: VWD, DAD (PDA), RID, FLD, ELSD (Agilent, Shimadzu, Knauer, PerkinElmer, Young In Chromass, Ecom aj.)</li><li>Termostaty kolon: Agilent G1316x / G7116x, Shimadzu CTO-20/30/40, Knauer CT2.1, PerkinElmer Flexar</li><li>Frakční kolektory: Knauer FC 6.1, Teledyne FOXY, Ecom ECF 2096, Waters Fraction Collector II</li></ul><h4>Autosamplery</h4><ul><li>Agilent GC ALS (7673/7683/7693/8697), HPLC ALS moduly (G1313A–G7167C)</li><li>Shimadzu AOC-20 / AOC-5000+, SIL-10 / SIL-20 / SIL-40</li><li>CTC Analytics PAL, HTA autosamplery, Spark Alias/UHPLC, Knauer AS 6.1L</li><li>PerkinElmer Flexar / NexSAR</li></ul><h4>Další zařízení</h4><ul><li>GC×GC modulátory (např. GC×GC modulátor Univerzity Karlovy)</li><li>Ventily a přepínací moduly (Agilent, Knauer, Shimadzu, VICI-Valco)</li><li>Odplyňovače, průtokoměry, řídicí jednotky, rozhraní</li><li>LC-MS / GC-MS: Advion Expression CMS, Microsaic 4500 MiD, Markes BenchTOF aj.</li><li>Váhy (EA rozšíření): Mettler Toledo, Sartorius</li></ul><h4>Analogový sběr dat (Colibrick)</h4>Podpora A/D pro starší nebo analogové přístroje:<ul><li>GC: Agilent 5880/4890A, Varian 3xxx/3800/3900, PerkinElmer Clarus, Thermo TRACE, Shimadzu GC-14/9A, Scion 43x/45x/83xx/85xx aj.</li><li>HPLC detektory: Waters 2487/2489, ESA Corona, Hitachi L-series, JASCO FP/UV, Ecom LCD a další</li><li>Elementární a aminokyselinové analyzátory: Carlo Erba/Costech ECS, Biochrom 20/30+</li></ul>

DataApex Clarity chromatografický software verze 10.1.2 je nyní k dispozici!

Akademie

Osobnosti

Věda a výzkum

Software

Video

Článek

Produkt

Česká společnost DataApex se od svého založení v roce 1991 věnuje vývoji chromatografického softwaru. DataApex se neustále snaží poskytovat uživatelům efektivní a aktuální nástroje pro zpracování chromatografických dat.

DataApex

Společnost Phenomenex je celosvětovým technologickým lídrem, který se zabývá vývojem nových řešení v oblasti analytické chemie, jež řeší požadavky analytiků na separace a purifikace v průmyslových, vládních a akademických laboratořích.

Phenomenex

Reportáže, rozhovory, zprávy o vědeckých projektech a studentských akcích ... Jsme online informační bránou Univerzity Karlovy.

Forum: magazín Univerzity Karlovy

Agilent Technologies

Bruker

Thermo Fisher Scientific

Your quest for a lab system to increase the automation and achieve a higher throughput is now compromised by the requirements for remote working and social distancing.
At the same time, a lab cannot operate without people actually being physically in the lab. So how can we minimize staff presence on premises while maintaining operations? In this session, we will discuss how to balance these two objectives and how to optimize working remotely including discussions around data security and operative aspects. Key Learning Objectives. Learn what it takes to successfully implement an end-to-end solution to manage all content, context, and results in the lab. Discuss aspects to consider to evaluate, implement and operate a remote Lab Workflow solution. Tips for how to make physical and digital processes come together.
<blockquote>
Presenter: Nicolas Louvet (Software Product Manager, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Nicolas Louvet joined Agilent Technologies in 2005 as an ELN Services Consultant in the Software &amp; Informatics Division, became the Product Manager for OpenLab ELN, and currently serves as the Software Product Manager for SLIMS. He has more than 15 years of experience working directly with clients needing to digitalize their laboratory processes. His area of expertise is focused on workflow and content management in the laboratory.
</blockquote>

Agilent Technologies: Laboratory Workflow Solutions: What to expect when you’re away from the lab?

Laboratory Workflow Solutions: What to expect when you’re away from the lab?

How to balance these two objectives and how to optimize working remotely including discussions around data security and operative aspects.

What to expect when you’re away from the lab?

The modern laboratory has data collected and reported from a variety of different instruments and locations.
Agilent’s Enterprise Content Manager can store that data and make metadata available for searching through a variety of data specific filters or customized PDF templates. The Metadata ReUse program can then help query and combine that data into an XML/Excel format for further reporting.
Key Learning Objectives
<ul>
<li>Introduction to the ECM-XT Web Client Interface
</li>
<li>MetaData Reuse tool features overview
</li>
<li>XML/Excel Export function of the the MetaData Reuse Tool
</li>
</ul>
<blockquote>
Presenter: Richard Mutkoski (Laboratory Informatics Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Richard Mutkoski began with Agilent (HP) in 1995. He has been an Application Engineer in Agilent’s Laboratory Informatics for the past 18 years. Prior to his career at Agilent Rich spent 12 years in a variety of small pharmaceutical firms in both R&amp;D and QA/QC capacities affording him first-hand knowledge of those workflows, bottlenecks and challenges.
</blockquote>

Agilent Technologies: The Power of Using Existing Meta-Data for Lab Wide Reporting

The Power of Using Existing Meta-Data for Lab Wide Reporting

Introduction to the ECM-XT Web Client Interface.

The promises of the digital lab are enticing but getting there sometimes seems daunting.
This presentation will discuss how to digitize lab operations from start to finish, which is especially relevant in a world where working remotely is becoming increasingly common. In the course of this journey, how can you realize your aspirations and create sustainable outcomes, all while dealing with varied lab environments? The good news is that you can start today. This talk will show how you can prepare the ground for a digital lab, how to improve efficiency of your lab operations, and what it takes to implement an end-to-end solution to manage all content, context, and results in the lab.
<blockquote>
Presenter: Nicolas Louvet (Software Product Manager, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Nicolas Louvet joined Agilent Technologies in 2005 as an ELN Services Consultant in the Software &amp; Informatics Division, became the Product Manager for OpenLab ELN, and currently serves as the Software Product Manager for SLIMS. He has more than 15 years of experience working directly with clients needing to digitalize their laboratory processes. His area of expertise is focused on workflow and content management in the laboratory.
</blockquote>

Agilent Technologies: How to Achieve a Fully Digital, End-to-End Analytical Workflow with CDS, ELN and LIMS

How to Achieve a Fully Digital, End-to-End Analytical Workflow with CDS, ELN and LIMS

How to digitize lab operations from start to finish, which is especially relevant in a world where working remotely is becoming increasingly common.

How to Achieve a Fully Digital, End-to-End Workflow

Find out about the next generation of software from Agilent.
OpenLab CDS can streamline your lab operations with a single, secure data system that combines chromatography and mass spectrometry into one software platform. OpenLab CDS can control your Agilent GC, LC, single quadrupole GC/MS, LC/MS instruments as well as other vendors’ instruments in the lab, and save substantial time managing software and training staff.
<blockquote>
Presenter: Shawn Anderson (Director of Marketing, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Shawn Anderson is the Associate Vice President of Marketing for the Software and Informatics Division at Agilent Technologies. He has over 28 years of experience in the chromatography and purification/separations market space. His career has developed from bench work in biotech to field support, applications, sales, product management, and product marketing. Shawn is proud to have “learned and led” at some of the most well-respected vendors in the industry such as GE Healthcare, Dionex, Bio-Rad, and now Agilent, designing, launching, and marketing next generation hardware, software and consumable products. He is passionate about end-user and customer voice and believes that the lost sale is often the best learning opportunity. Finally, he is an optimistic futurist, and looks forward to the continuing democratization of science and technology.
</blockquote>

Agilent Technologies: OpenLab CDS-The future of Agilent Chromatography Data System for HPLC, GC, GCMS and LCMS

OpenLab CDS-The future of Agilent Chromatography Data System for HPLC, GC, GCMS and LCMS

Find out about the next generation of software from Agilent.

OpenLab CDS The future of Agilent Chromatography Data System

Pharmaceutical products come into contact with a wide range of polymeric materials on their journey from the production line to patients, with possible leaching of potentially dangerous substances into products, possibly compromising the stability, or even worse, the pharmacological activity. Extractable and leachable (E&amp;L) compounds are the focus of rigorous testing workflows to ensure therapeutics are safe and meet regulatory requirements.This webcast will present an E&amp;L study aiming to address the challenges to achieve sufficient sensitivity and selectivity for unknown analytes potentially present in the sample.A method has been optimized with the use of static headspace autosampling coupled with a HRAM GC–MS, resulting in a powerful technique to assess and quantify potentially dangerous untargeted volatile extractables down to trace level. Very high mass accuracy with errors of 1 ppm or better, even for smaller molecules and fragments, increases confidence in structure elucidation of unknown compounds.Key Learning Objectives:<ul><li>Learn about streamlining workflow for organic volatile impurities from contact materials</li><li>Learn how to optimize headspace sampling parameters with a strategy based on the theory of gas phase chemistry</li><li>Discover the benefits of using HRAM GC–MS for untargeted or unknown impurities</li></ul>Who should attend:<ul><li>Scientists, chemists, and analysts involved in E&amp;L testing</li><li>Laboratory managers in the pharmaceutical industry, CMOs, CROs and contract services</li><li>Researchers and method developers interested in E&amp;L methodology</li></ul><blockquote>Presenter: Xiaotend (Shelton) Gong (Instrumentation Chemist, Extractable and Leachable (E&amp;L) Testing, SGS)Xiaoteng Gong received his Master’s degree from the Illinois Institute of Technology, and has worked on food contact materials at the National Center for Food Safety and Technology (NCFST) of the Food and Drug Administration (FDA). With extensive experience in analytical chemistry, he currently is an instrumentation chemist at SGS specializing in extractables and leachables (E&amp;L) studies for pharmaceutical packaging. He has more than five years of experience using headspace gas chromatography–mass spectrometry (GC–MS).Presenter:&nbsp;Daniela Cavagnino (Marketing Manager, GC-MS, Thermo Fisher Scientific)Daniela Cavagnino received a Master’s degree in Chemistry from the University of Milan, Italy. She started her career in gas chromatography at Thermo Fisher Scientific, spending several years in the R&amp;D laboratories working on GC technology innovation. Then, she conveyed her technical background into product management and marketing management roles, and she now has more than 15 years of experience promoting GC and GC–MS technology and applications in several different market segments. During her career, she has participated as an author and co-author in technical publications and as a lecturer at international conferences.</blockquote>

Thermo Fisher Scientific: Increased Confidence in Untargeted Volatile E&L Analysis by Static Headspace Sampling Coupled to HRAM GC-MS

Increased Confidence in Untargeted Volatile E&L Analysis by Static Headspace Sampling Coupled to HRAM GC-MS

This webcast presents an E&L study aiming to address the challenges to achieve sufficient sensitivity and selectivity for unknown analytes 

Untargeted Volatile E&L Analysis via Headspace GC-MS

FT-IR spectroscopy is an easy-to-use and nondestructive analysis tool for chemical identification, quantification, composition analysis, optical characterization and many more. Depending on measurement geometry (beside transmission measurement) and optical properties of sample materials FT-IR can be very surface sensitive. It provides plenty of surface analysis techniques with different penetration depth to qualitatively or quantitatively characterize the upper layer of a sample, to follow surface reactions or to observe surface emissions etc. Depending on sample form, e.g. powder, gel, liquid, crystal blocks, coatings, micro sized samples or else, different FT-IR techniques can be applied.In this Webinar You Will Learn:<ul><li>Attenuated Total Reflection - ATR</li><li>Diffuse Reflectance Infrared Fourier Transform Spectroscopy - DRIFT</li><li>Specular Reflectance</li><li>InfraRed Reflection Absorption Spectroscopy - IRRAS</li><li>Emission Spectroscopy</li><li>Photo Acoustic Spectroscopy - PAS</li></ul>Who Should Attend?<ul><li>Surface analysis experts (e.g. material science, polymers, automotive…)</li><li>Spectroscopy experts (e.g. academia, physicists, chemists…)</li><li>Microscopy experts (e.g. research, pharmaceuticals, electronics… )</li></ul><blockquote>Presenter: Dr. Xia StammerDr. Xia Stammer studied Physical Chemistry and focused on surface functionalization and characterization during her PhD and research activities. She has been FT-IR application specialist since almost 10 years at Bruker and is specialized for FT-IR research solutions for catalysis, material science and surface analysis.Presenter:&nbsp;Dr. Inga Köhler&nbsp;Dr. Inga Köhler studied Geology and Paleontology and acquired her PhD with focus on Early Earth. Inga has a strong interest in communicating scientific topics to the public and continues to contribute to Archean research. At Bruker, she works as a Scientific Content Creator for FT-IR and Raman spectroscopy as well as microscopy.</blockquote>

Bruker: Shed Light on Surface | How to use FT-IR to characterize surfaces  

Shed Light on Surface | How to use FT-IR to characterize surfaces

In this webinar, you will learn about various FT-IR techniques for surface characterization.

How to use FT-IR to characterize surfaces  

In this webinar we will show you:<ul><li>Why FT-IR is the method of choice for particle-driven analysis of microplastics.</li><li>Demands and requirements to establish a microplastic lab based on FT-IR technology.</li><li>Necessary steps in sample preparation from various sources.</li><li>Theoretical basics to understand the idea behind FT-IR analysis of microparticles.</li><li>That there are comprehensive, complete solutions to microplastic analysis, right out of the box.</li></ul>You will learn about:<ul><li>Instrumental setup and experimentals</li><li>Particle analysis and evaluation</li><li>Microplastic software solutions</li></ul>We will cover the basics of:<ul><li>Different microplastics analysis techniques</li><li>Sample types</li><li>Sample preparation steps</li><li>FT-IR experimental procedures</li><li>FT-IR instrumentation</li></ul>Who should attend:<ul><li>Analytical service laboratories</li><li>Environmental researchers</li><li>Food &amp; Feed producers</li><li>Drinks &amp; Beverages producers</li></ul>FT-IR and Raman are very versatile analytical techniques - but did you know that Bruker offers by far the most comprehensive product range for spectroscopy? Our instruments cover all applications from routine incoming inspection, to multispectral fundamental research at the highest level, to solutions for in-process monitoring.If you are looking for new and innovative solutions to your analytical problems, we welcome you to join our free webinars on spectroscopic measurement techniques, perhaps making your daily work easier.Your Bruker Optics Team

Bruker: Why FT-IR FPA Imaging is King in Microplastics Analysis?

Why FT-IR FPA Imaging is King in Microplastics Analysis?

In this webinar we will show you why FT-IR is the method of choice for particle-driven analysis of microplastics.

Once again, we point out the strong synergies of pharmaceutical research, process development and quality control with Raman microscopy. In this webinar, our Raman expert Di Yan will first highlight the basics and then analyze three typical samples. For this, we leave the "PowerPoint monotony" and go hands-on with the Raman microscope. Afterwards there will be a live question and answer session to answer your questions.You will learn about:<ul><li>How to apply Raman microscopy</li><li>What to look out for in Raman instrumentation</li><li>How to comply with regulations using a Raman microscope</li></ul>What is the goal of the webinar:<ul><li>Demonstrate the utility of Raman microscopy in Pharma</li><li>Highlight the unique benefits of Raman microscopy</li></ul>We will discuss:<ul><li>Relationships between Raman and other techniques (e.g. XRD)</li><li>Basics of Raman microscopy and imaging</li><li>Application example #1: API distribution</li><li>Application example #2: Polymorphism</li><li>Application example #3: Particle analysis</li></ul>Who should attend:<ul><li>R&amp;D specialists, especially process developers</li><li>Quality control and PAT specialists</li><li>Planning to buy Raman microscope</li><li>Thinking about implementing Raman microscopy</li><li>Want to learn more about Raman microscopy in Pharma</li></ul><blockquote>Presenter: Dr. Di YanDr. Di Yan is a product manager at Bruker for Raman microscopy. He has studied physical chemistry at Friedrich Schiller University and Leibniz Institute of Photonic Technology and has extensive experience in Raman detection techniques.</blockquote>

Bruker: Tools for Pharmaceutical Troubleshooting: Raman Microscopy

Tools for Pharmaceutical Troubleshooting: Raman Microscopy

In this webinar, our Raman expert Di Yan will first highlight the basics and then analyze three typical samples.

By combining infrared spectroscopy with atomic force microscopy (AFM-IR), it is possible to perform chemical analysis and compositional mapping with a spatial resolution down to 10 nm, which greatly surpasses standard optical diffraction limits. During this 2-hour event, our speakers explore:<ul><li>Origins of the AFM-IR technique</li><li>Recent advances in AFM-IR technology</li><li>Applications that can benefit from AFM-IR spectroscopy—especially life sciences and environmental chemistry</li></ul>Bruker Application Scientist Dr. Cassandra Phillips hosts the workshop and live demos, providing an overview of Bruker's latest nanoIR product updates.&nbsp;Watch this webinar to:<ul><li>Hear distinguished guest speakers discuss their work on AFM-IR with the nano-IR platform</li><li>Experience Bruker's new patented Surface Sensitive mode</li><li>Become familiar with Bruker's new AFM-IR platforms</li></ul><blockquote>Presenter: Xiaoji Xu, Ph.D.Presentation: NanoIR through PeakForce Infrared (PFIR) MicroscopyHere, Xiaoji Xu, Ph.D. (Lehigh University) introduces the novel PFIR method of AFM-IR developed at Lehigh University. This method of label-free chemical nanoscopy is based on the mechanical detection of photothermal response by AFM operated in PeakForce Tapping mode and ultimately can achieve a higher spatial resolution (sub-10 nm) and provide more rich chemical information than many of the existing tools we use for chemical imaging—or imaging in general—while also providing greater flexibility in applicability to samples in both air and liquid.In addition to providing a review of the strengths and benefits of PFIR as they relate to foundational AFM-IR and PeakForce Tapping principles and capabilities, the presentater explores and provides detailed, real-world examples of PFIR's applicability to a broad range of sample types and experimental settings.Presenter: Dmitry Kurouski, Ph.D.Presentation: Biology at the Nanoscale: From Viruses to AmyloidsIn this presentation, Dmitry Kurouski, Ph.D. (Texas A&amp;M University) showcases his team's research and findings using TERS and AFM-IR to investigate viruses, viral particles, and alpha-synuclein oligomers. Topics of this discussion range from an exploration of how IR/AFMIR spectroscopy reveals a variety of infrared spectra in biological samples that are otherwise inaccessible by traditional Raman microscopy methods, to a detailed presentation of the team's findings via a combination of AFM-IR and TERS about changes observed in the secondary structural organization and surface structure information of populations of oligomers relative to their impact on the development of Parkinson's disease.These two technologies possess different capabilities that demonstrate strong complementarity in terms of both the chemical information available and the achievable probing depth.Presenter: Cassandra Philips, Ph.D.Presentation: Quantitative Demonstration of Surface Sensitivity with nanoIR3The presenter conducts a profile analysis of a PMMA wedge sample in both Resonance enhanced and Surface Sensitivity modes, then demonstrate the analytical process for data collected in Surface Sensitivity mode.Comparison of the data outputs of various operational modes demonstrates that using the same probe and sample, users can switch from looking at bulk measurements (where the signal increases linearly with the thickness) to measurements with a surface sensitivity on the order of 15 nm just by adjusting the parameters.Surface Sensitivity mode enables measurement of the top layer of a sample with significantly improved accuracy over other operational modes, as it collects data only from the surface and not from the absorbing material beneath it.&nbsp;Presentation: Demonstration: New Platforms for AFM-IRThe presenter introduces the unique capabilities of a new Bruker platform for AFM-IR imaging.Looking at a sample of PMMA beads in epoxy resin, the presenter demonstrates the new platform's capability to achieve higher acuity and operate at higher scan speeds than other nanoIR systems. Its integration with both Bruker's most advanced AFM controller and legacy Tapping Mode imaging capabilities are explored.Additionally, the presenter showcases the ability to switch wavenumber and reconfigure laser power mid-scan (to look at both the epoxy band and the carbonyl band of the sample), as well as the platform's unique capacity to switch between sample-scanning and tip-scanning configurations, enabling investigation of the chemical composition and mechanical properties of the same sample using the same probe.</blockquote>

Bruker: NanoIR Spectroscopy & Imaging: Recent Developments and Applications

NanoIR Spectroscopy & Imaging: Recent Developments and Applications

Find out more about Bruker's latest nano IR product updates and see real-time demonstrations of the new Surface Sensitive mode and new AFM-IR platforms

NanoIR Spectroscopy & Imaging - Developments & Applications

Attend our on-demand webinar: „The True Value of FT-IR and Raman as a Quality Control Tool in Pharmaceutical Manufacturing“

Bruker: The True Value of FT-IR and Raman as a Quality Control Tool in Pharmaceutical Manufacturing

The True Value of FT-IR and Raman as a Quality Control Tool in Pharmaceutical Manufacturing

Attend our on-demand webinar about the True Value of FT-IR and Raman as a Quality Control Tool in Pharmaceutical Manufacturing.